Οι τιμές της αιθανόλης μπορούν να επηρεαστούν από διάφορους παράγοντες. Αυτό το καύσιμο εξαρτάται από ένα γεωργικό προϊόν, συνήθως καλαμπόκι ή ζάχαρη, επομένως η τιμή αυτών των βασικών προϊόντων μπορεί να κάνει τεράστια διαφορά όταν πρόκειται για τον προσδιορισμό του κόστους του καυσίμου αιθανόλης. Άλλοι παράγοντες που επηρεάζουν την τιμή της αιθανόλης περιλαμβάνουν το κόστος παραγωγής, το κόστος μεταφοράς, τους φόρους ή τα τιμολόγια και τις επιδοτήσεις. Ορισμένες από αυτές δημιουργούν ανοδικές πιέσεις τιμών ενώ άλλες εργάζονται για να μειώσουν τις τιμές.
Για να κατανοήσουμε τον σημαντικό ρόλο που διαδραματίζουν οι τιμές των γεωργικών προϊόντων στην τιμή της αιθανόλης, βοηθά να γνωρίζουμε τι επηρεάζει αυτές τις τιμές των εμπορευμάτων. Οι συνθήκες ανάπτυξης όπως οι ασθένειες, οι καιρικές συνθήκες και οι συνθήκες του εδάφους έχουν όλα σημαντικές επιπτώσεις στην τιμή. Ο νόμος της προσφοράς και της ζήτησης διδάσκει ότι εάν η ζήτηση παραμένει η ίδια ή αυξάνεται και η προσφορά συρρικνώνεται, το κόστος αυξάνεται. Επομένως, όταν οι συνθήκες μειώνουν τις αποδόσεις των καλλιεργειών, η τιμή ανεβαίνει. Κατά τη διάρκεια των καλύτερων ετών, οι τιμές της αιθανόλης μπορεί πράγματι να πέφτουν.
Ενώ η τιμή αυτών των βασικών δομικών στοιχείων της αιθανόλης είναι σημαντική, δεν είναι τόσο ασταθείς όσο πολλοί πιστεύουν. Το καλαμπόκι και η ζάχαρη αγοράζονται συχνά με συμβόλαιο, αποφεύγοντας έτσι κάποιες από τις καθημερινές αλλαγές τιμών που είναι βέβαιο ότι θα συμβούν. Ως εκ τούτου, οι τιμές της αιθανόλης μπορούν να παραμείνουν σχετικά σταθερές ακόμη και όταν υπάρχουν μεγάλες διακυμάνσεις στην αγορά εμπορευμάτων. Κατά τη διαπραγμάτευση νέων συμβάσεων, οι τιμές της αιθανόλης ενδέχεται να είναι πιο πιθανό να αλλάξουν λόγω των ενημερωμένων τιμών των εμπορευμάτων.
Ένας άλλος σημαντικός παράγοντας στον καθορισμό των τιμών της αιθανόλης είναι το κόστος μεταφοράς. Η αιθανόλη πρέπει να μεταφέρεται σε δεξαμενές σε τρένα και φορτηγά επειδή είναι τόσο διαβρωτική. Υπάρχουν πολύ λίγοι αγωγοί που έχουν σχεδιαστεί για να μεταφέρουν τέτοιο υλικό. Επομένως, η αιθανόλη έχει εγγενή αύξηση στο κόστος σε σύγκριση με την κανονική βενζίνη και το λάδι.
Το κόστος μεταφοράς αντισταθμίζεται κάπως από το γεγονός ότι, σε πολλά μέρη, υπάρχουν επιδοτήσεις και φορολογικές ελαφρύνσεις για την αιθανόλη. Τέτοια κίνητρα υπάρχουν επειδή ορισμένες κυβερνήσεις επιθυμούν να ενθαρρύνουν τη χρήση αιθανόλης ως καθαρότερο καύσιμο καύσης. Αυτό συμβάλλει στην πτώση των τιμών της αιθανόλης, αν και τεχνητά.
Ωστόσο, αυτός ο τεχνητός έλεγχος των τιμών μπορεί να λειτουργήσει και με τους δύο τρόπους. Οι δασμοί και άλλοι φόροι στην αιθανόλη είναι επίσης τεχνητές επιρροές στις τιμές και συμβάλλουν στην άνοδο της τιμής, ειδικά όταν πρόκειται για ξένες πηγές αιθανόλης. Για παράδειγμα, η βραζιλιάνικη αιθανόλη θα ήταν πολύ φθηνότερη για αγορά στις Ηνωμένες Πολιτείες, εκτός από το ότι υπάρχει δασμός στην εισαγωγή της. Αυτό καθιστά την τιμή της βραζιλιάνικης αιθανόλης ίση ή ακόμα πιο ακριβή από την εγχώρια αιθανόλη. Αυτό μπορεί να μην είναι επωφελές για τους καταναλωτές, αλλά βοηθά στην προστασία της εγχώριας βιομηχανίας.