Η συνταγογραφούμενη δόση σερτραλίνης εξαρτάται σε μεγάλο βαθμό από την κατάσταση που αντιμετωπίζεται με αυτήν και η δόση μπορεί να αυξηθεί εάν το φάρμακο δεν έχει σημαντική επίδραση. Για καταστάσεις όπως η κατάθλιψη, η ιδεοψυχαναγκαστική διαταραχή (OCD) και η προεμμηνορροϊκή δυσφορική διαταραχή, συνιστάται δόση 50 χιλιοστόγραμμα (mg) και θα πρέπει να αυξάνεται κατά 50 mg εάν είναι απαραίτητο. Εάν οι ασθενείς λαμβάνουν σερταλίνη για διαταραχή πανικού ή μετατραυματικό στρες, η προτεινόμενη δόση έναρξης είναι 25 mg την ημέρα. Γενικά, δεν πρέπει να λαμβάνονται περισσότερα από 200 mg την ημέρα.
Η σερτραλίνη συνήθως συνταγογραφείται για την κατάθλιψη και ταξινομείται ως αντικαταθλιπτικό εκλεκτικό αναστολέα επαναπρόσληψης σεροτονίνης (SSRI). Αυτά τα φάρμακα λειτουργούν για να αυξήσουν την ποσότητα σεροτονίνης στον εγκέφαλο. Η σεροτονίνη είναι μια χημική ουσία νευροδιαβιβαστή που είναι υπεύθυνη για τη μεταφορά σημάτων μεταξύ των νεύρων στον εγκέφαλο. Τα χαμηλά επίπεδα σεροτονίνης στον εγκέφαλο πιστεύεται ότι συνδέονται με καταστάσεις όπως η κατάθλιψη, η ΙΨΔ, η διαταραχή μετατραυματικού στρες και ο αλκοολισμός. Οι SSRI μπορούν επομένως να χρησιμοποιηθούν για τη θεραπεία αυτών των καταστάσεων.
Η συνιστώμενη δόση σερτραλίνης καθορίζεται από την κατάσταση του ασθενούς και την ανταπόκρισή του στη θεραπεία. Για ασθενείς με κατάθλιψη, συνιστάται αρχική δόση 50 mg. Αυτή είναι η πιο κοινή χρήση της σερτραλίνης, καθώς περίπου ένας στους 10 ανθρώπους υποφέρει από κατάθλιψη κάποια στιγμή στη ζωή του. Η δόση σερτραλίνης για την ΙΨΔ είναι επίσης 50 mg. Η ΙΨΔ είναι μια κατάσταση που χαρακτηρίζεται από καταναγκασμούς που ο ασθενής νιώθει ότι πρέπει να ακολουθήσει, παρόλο που μπορεί να είναι παράλογοι ή περιττοί στη φύση τους. Και για τις δύο αυτές καταστάσεις, εάν η δόση των 50 mg σερτραλίνης ανά ημέρα δεν βοηθά την κατάσταση, μπορεί να αυξηθεί κατά 50 mg κάθε εβδομάδα, έως το μέγιστο των 200 mg την ημέρα.
Η προεμμηνορροϊκή δυσφορική διαταραχή είναι μια πιο σοβαρή εκδοχή του προεμμηνορροϊκού συνδρόμου, με τους ασθενείς να αισθάνονται κατάθλιψη, ευερεθιστότητα και ένταση πριν από την εμμηνόρροια. Οι γυναίκες που πάσχουν από αυτή την πάθηση συνιστάται να λαμβάνουν 50 mg την ημέρα ή μόνο κατά την ωχρινική φάση της εμμήνου ρύσεως. Εάν το φάρμακο λαμβάνεται καθ’ όλη τη διάρκεια του εμμηνορροϊκού κύκλου, μπορεί να συνταγογραφηθεί μόνο σε δόσεις έως και 150 mg την ημέρα. Εάν λαμβάνεται μόνο μέσω της ωχρινικής φάσης, προτείνεται μέγιστη δόση σερτραλίνης 100 mg.
Η διαταραχή κοινωνικού άγχους και η διαταραχή μετατραυματικού στρες έχουν και οι δύο προτεινόμενη αρχική δόση σερτραλίνης 25 mg την ημέρα. Εάν η θεραπεία δεν είναι αποτελεσματική μετά από μία εβδομάδα, μπορεί να αυξηθεί στα 50 mg. Μετά από αυτό, η δόση μπορεί να αυξηθεί με τον ίδιο τρόπο όπως και σε άλλες καταστάσεις, με αυξήσεις των 50 mg μία φορά την εβδομάδα, έως το μέγιστο των 200 mg την ημέρα.