Οι ασθενείς που έχουν διαγνωστεί με όγκο στον εγκέφαλο μπορεί να έχουν ευρέως ποικίλο προσδόκιμο ζωής. Ένας αριθμός παραγόντων είναι σημαντικοί για τον καθορισμό της πρόγνωσης του ασθενούς. Πρώτον, ο τύπος του καρκίνου που υπάρχει είναι πολύ σημαντικός, καθώς διαφορετικοί τύποι κακοήθων αναπτύξεων έχουν διαφορετικούς βαθμούς επιθετικότητας. Το μέγεθος και η θέση του όγκου κατά τη στιγμή της διάγνωσης είναι επίσης σημαντικά. Ένας άλλος σημαντικός παράγοντας στην πρόγνωση του όγκου του εγκεφάλου είναι εάν ο πρωτοπαθής όγκος έχει δώσει μετάσταση ή εξαπλωθεί σε περιοχές του σώματος μακριά από τον εγκέφαλο.
Ένας σημαντικός παράγοντας που επηρεάζει την πρόγνωση του όγκου του εγκεφάλου είναι ο τύπος του όγκου που υπάρχει. Πολλά διαφορετικά κύτταρα που βρίσκονται μέσα στον εγκέφαλο μπορούν να εξελιχθούν σε καρκινικές αναπτύξεις και οι όγκοι που προκύπτουν έχουν ποικίλες ικανότητες να αυξάνονται σε μέγεθος και να εξαπλώνονται σε άλλες περιοχές του σώματος. Για παράδειγμα, ένας τύπος όγκου εγκεφάλου που ονομάζεται πολύμορφο γλοιοβλάστωμα (GBM) είναι πολύ επιθετικός και οι ασθενείς που έχουν διαγνωστεί με αυτόν τον όγκο τυπικά επιβιώνουν για λιγότερο από ένα χρόνο. Αντίθετα, ένα μηνιγγίωμα, που είναι ένας όγκος που προέρχεται από τις μεμβράνες που επενδύουν τον εγκέφαλο, αναπτύσσεται πολύ πιο αργά και είναι λιγότερο πιθανό να δώσει μετάσταση σε άλλες περιοχές του σώματος. Οι ασθενείς που λαμβάνουν αυτή τη διάγνωση καρκίνου έχουν μεγαλύτερο προσδόκιμο ζωής.
Μια άλλη σημαντική πτυχή της πρόγνωσης του όγκου του εγκεφάλου είναι το μέγεθος του όγκου τη στιγμή της διάγνωσης. Γενικά, οι όγκοι που είναι μεγαλύτεροι έχουν χειρότερη πρόγνωση από τους όγκους που είναι μικρότεροι. Αυτό οφείλεται στο γεγονός ότι αυτοί οι μεγαλύτεροι όγκοι είχαν περισσότερο χρόνο να αναπτυχθούν, να εξαπλωθούν και να μπλέξουν στις σημαντικές δομές του εγκεφάλου. Οι μεγάλοι όγκοι που βρίσκονται στον εγκέφαλο μπορεί να είναι ιδιαίτερα επικίνδυνοι επειδή υπάρχει περιορισμένος διαθέσιμος χώρος μέσα στο κρανίο. Η υπερβολική ανάπτυξη όγκου θα μπορούσε να προκαλέσει κήλη – ή μετατόπιση – του εγκεφάλου έξω από το κρανίο, μια διαδικασία που θα μπορούσε να οδηγήσει σε απώλεια συνείδησης και διακοπή της αναπνοής.
Σε αντίθεση με πολλούς άλλους τύπους όγκων που επηρεάζουν διαφορετικά όργανα του σώματος, η θέση του όγκου του εγκεφάλου μπορεί να επηρεάσει σε μεγάλο βαθμό την πρόγνωση του ασθενούς. Αυτό οφείλεται στο γεγονός ότι οι περιοχές του εγκεφάλου είναι εξαιρετικά εξειδικευμένες στις ικανότητές τους να ελέγχουν πτυχές της λειτουργίας του σώματος. Ένας όγκος στον εγκέφαλο που επηρεάζει το στέλεχος του εγκεφάλου μπορεί να είναι θανατηφόρος επειδή αυτή η περιοχή του εγκεφάλου ελέγχει ζωτικές διαδικασίες όπως η αναπνοή, ο καρδιακός παλμός και η κυκλοφορία του αίματος. Κάποιος που βρίσκεται στον μετωπιαίο λοβό του εγκεφάλου μπορεί να προκαλέσει μόνο αλλαγές στην προσωπικότητα και μπορεί να μην είναι άμεσα απειλητικός για τη ζωή.
Το εάν ο όγκος έχει δώσει μεταστάσεις επηρεάζει επίσης την πρόγνωση του όγκου του εγκεφάλου. Τα καρκινικά κύτταρα μπορούν να εξαπλωθούν από τον εγκέφαλο σε άλλες περιοχές του σώματος μέσω του λεμφικού συστήματος ή του αίματος. Αν και οι όγκοι του εγκεφάλου δεν δίνουν μεταστάσεις τόσο συχνά όσο κάποιοι άλλοι όγκοι στο σώμα, εάν εξαπλωθούν σε απομακρυσμένες περιοχές τότε η πρόγνωση του ασθενούς είναι αρκετά κακή. Αξίζει να σημειωθεί ότι άλλοι όγκοι όπως ο καρκίνος του πνεύμονα, ο καρκίνος του μαστού ή ο καρκίνος του παχέος εντέρου συχνά κάνουν μετάσταση στην περιοχή του εγκεφάλου. Γενικά, οι εγκεφαλικές μεταστάσεις είναι ένα κακό προγνωστικό σημάδι για ασθενείς με αυτούς τους άλλους καρκίνους.