Οι περισσότεροι ιατρικοί ειδικοί συμφωνούν ότι οι 4D υπερήχοι είναι ασφαλείς για χρήση κατά τη διάρκεια της εγκυμοσύνης. Αυτοί οι υπέρηχοι επιτρέπουν στους γονείς και στα μέλη του ιατρικού προσωπικού να καταγράφουν εικόνες ενός αναπτυσσόμενου μωρού σε 3D και να παρακολουθούν κινήσεις ταυτόχρονα, γι’ αυτό και ονομάζεται 4D. Οι γονείς και το ιατρικό προσωπικό μπορούν να δουν το μωρό και τις κινήσεις του σε πραγματικό χρόνο σε μια οθόνη υπολογιστή. Μερικοί άνθρωποι έχουν εκφράσει ανησυχία για το γεγονός ότι τα ηχητικά κύματα που χρησιμοποιούνται σε ένα 4D υπερηχογράφημα μπορούν να αυξήσουν τη θερμοκρασία των ιστών. Πολλοί ιατροί ειδικοί υποστηρίζουν, ωστόσο, ότι η πιθανή αλλαγή θερμοκρασίας δεν είναι αρκετά σημαντική για να προκαλέσει βλάβη.
Μεγάλο μέρος της ανησυχίας που έχουν ορισμένοι άνθρωποι σχετικά με την ασφάλεια των υπερήχων 4D μπορεί να προέρχεται από το γεγονός ότι το θεωρούν ως νέα τεχνολογία. Το γεγονός είναι, ωστόσο, ότι οι 4D υπερήχοι χρησιμοποιούν την τεχνολογία που χρησιμοποιείται στους συνηθισμένους 2D υπερήχους που υπάρχουν εδώ και χρόνια. Οι έγκυες γυναίκες κάνουν συχνά τέτοιους υπέρηχους σε βάση ρουτίνας, χωρίς να βλάπτουν τα αγέννητα παιδιά τους. Ένα 4D υπερηχογράφημα λειτουργεί με τον ίδιο τρόπο που λειτουργούν οι 2D υπέρηχοι. Η διαφορά είναι ότι οι 4D υπέρηχοι χρησιμοποιούν πιο προηγμένους τεχνολογικά σαρωτές που καθιστούν δυνατή την προβολή περισσότερων από τη μήτρα μιας γυναίκας και το αναπτυσσόμενο μωρό της.
Ένα άτομο μπορεί να ανησυχεί περισσότερο για την ασφάλεια ενός 4D υπερήχου εάν το εξισώσει με ακτινογραφίες και παρόμοιες διαγνωστικές εξετάσεις. Σε αντίθεση με τις ακτίνες Χ, ωστόσο, οι 4D υπερήχοι δεν περιλαμβάνουν τη χρήση ακτινοβολίας. Αυτό σημαίνει ότι δεν υπάρχει κίνδυνος καρκίνου ή βλάβης ιστού που σχετίζεται με την ακτινοβολία από το 4D υπερηχογράφημα.
Μερικοί άνθρωποι αναφέρουν την αύξηση της θερμοκρασίας που μπορούν να προκαλέσουν τα ηχητικά κύματα καθώς περνούν μέσα από τους ιστούς ως λόγο ανησυχίας για τη χρήση του 4D υπερήχου. Οι περισσότεροι ιατροί, ωστόσο, υποστηρίζουν ότι ο κίνδυνος είναι πολύ μικρός για να δικαιολογήσει ανησυχία ή αποφυγή υπερήχων. Επιπλέον, οι τεχνικοί υπερήχων παρακολουθούν συνήθως τις αλλαγές θερμοκρασίας κατά τη διάρκεια των υπερήχων, έτσι ώστε να μπορούν να ανιχνευθούν τυχόν ανησυχητικές αλλαγές και στη συνέχεια να τερματιστεί ο υπέρηχος.
Εάν μια διαδικασία υπερήχων προκάλεσε δραματική αύξηση της θερμοκρασίας των ιστών του εμβρύου, είναι πιθανό αυτό να βλάψει ένα αναπτυσσόμενο μωρό. Ωστόσο, είναι εξαιρετικά απίθανο οι θερμοκρασίες να αυξηθούν τόσο ψηλά κατά τη διάρκεια ενός κανονικού 4D υπερήχου. Ως εκ τούτου, οι περισσότεροι ιατροί το θεωρούν ασφαλές. Ωστόσο, εάν μια γυναίκα έχει ανησυχίες για την ασφάλειά της, μπορεί να βρει τον γιατρό της μια καλή πηγή πληροφοριών σχετικά με τη διαδικασία. Επιπλέον, πολλοί στον ιατρικό τομέα συνιστούν τον περιορισμό των υπερήχων σε αυτούς που είναι απαραίτητοι αντί να τους χρησιμοποιούν ως εκλεκτικές διαδικασίες.