Ca și în cazul oricărui aliment care este în esență grăsime pură, există încă probleme de sănătate asociate cu margarina, mai ales dacă este consumată în cantități mari. Una dintre cele mai mari probleme potențiale este riscul crescut de boli de inimă. Multe tipuri conțin niveluri ridicate de grăsimi saturate și grăsimi trans periculoase, despre care se știe că scad nivelurile de colesterol benefic din lipoproteinele de înaltă densitate (HDL) și cresc nivelurile de tip nociv cunoscut sub numele de lipoproteine cu densitate scăzută (LDL).
Odată ce untul a devenit asociat cu riscuri pentru sănătate, cum ar fi bolile de inimă, datorită nivelurilor sale ridicate de grăsimi saturate și colesterol, mulți oameni căutau o alternativă. Adesea, oamenii ar trece la margarină, care de multe ori nu are colesterol și cel puțin un nivel mai scăzut de grăsimi saturate decât untul și adesea mai puține calorii. Motivul pentru care nu există colesterol este că margarina este făcută din grăsimi vegetale solidificate în loc din surse animale. Odată cu trecerea timpului, profesioniștii din domeniul sănătății au început să observe probleme de sănătate, cum ar fi riscul crescut de a dezvolta boli de inimă pentru persoanele care consumau și margarină.
Cercetătorii au descoperit că riscul de boli de inimă asociat cu margarina se datorează prezenței acizilor grași trans, cunoscuți și sub denumirea de grăsimi trans. Aceste substanțe se formează în procesul de solidificare a uleiului vegetal și au fost legate de mai multe probleme de sănătate. Batoanele solide au niveluri mult mai mari de grăsimi trans decât cele mai moi. S-a demonstrat că grăsimile trans au un efect advers asupra nivelului de colesterol, un indicator major al bolii cardiace, chiar dacă margarina nu conține de fapt colesterol. Grăsimile trans scad nivelul de colesterol HDL bun și cresc cantitatea de colesterol LDL dăunător găsit în organism.
Un alt factor care contribuie la riscul bolilor de inima asociat cu margarina este cantitatea de grăsimi saturate găsită în multe mărci. Chiar dacă există mai puține grăsimi saturate decât untul, niveluri ridicate pot fi prezente în unele produse cu margarină. Cantitățile acestor substanțe nesănătoase pot varia foarte mult în funcție de producător. De regulă, este o idee bună ca consumatorii să caute produse cu un nivel scăzut de grăsimi saturate și să nu uite să le folosească cu moderație.
Mulți producători au eliminat cât mai multe grăsimi trans din produsele lor, iar multe tipuri de margarină sunt, de asemenea, făcute acum cu grăsimi nesaturate, cum ar fi uleiul de măsline sau de canola. Produsele cu grăsimi saturate reduse și fără grăsimi trans sunt mai puțin dăunătoare decât altele, dar trebuie totuși consumate doar cu moderație. Consumul de cantități mari de orice aliment gras este probabil să crească șansele de a dezvolta boli de inimă, dar limitarea consumului la cantități mici de grăsimi nesaturate reduce acest risc.