Alimentele moleculare sunt în general înțelese ca fiind orice tip de aliment natural care a fost crescut din semințe care au suferit un proces de inginerie moleculară intenționată. Adesea, semințele sunt modificate, astfel încât planta rezultată va fi mai puțin sensibilă la o serie de factori care ar putea dăuna recoltei. Alimentele moleculare pot fi, de asemenea, modificate pentru a crește aroma unui anumit produs sau pur și simplu ca mijloc de a asigura o recoltă sănătoasă cu un randament ridicat.
Majoritatea procedurilor utilizate în modificarea alimentelor au de-a face cu a face planta mai rezistentă. Alimentele artificiale vor fi mai rezistente la condițiile meteorologice nefavorabile, cum ar fi seceta sau expunerea excesivă la soare. Alimentele moleculare pot, de asemenea, să reziste mucegaiului, mucegaiului și altor boli ale plantelor care pot duce la eșecul recoltei. Există chiar și exemple de alimente modificate care sunt concepute special pentru a rezista unei infestări cu o gamă largă de insecte.
Există, de asemenea, exemple de produse alimentare moleculare care sunt infuzate cu o aromă sau o aromă mai puternică decât soiurile similare. Aroma și mirosul îmbunătățit sunt adesea de dorit pentru utilizare cu legume congelate sau conservate, deoarece acestea vor tinde să păstreze mai mult gust după procesul de gătire. Alimentele moleculare pot fi, de asemenea, concepute pentru a păstra mai multă culoare în timpul gătirii. Atunci când este cazul, prezentarea felului de mâncare nu va fi doar gustoasă, ci și va atrage ochiul.
În unele sferturi, termenul de hrană moleculară a fost folosit pentru a se referi la metoda de preparare a alimentelor, mai degrabă decât la mâncarea în sine. De exemplu, dacă se folosește o alternativă la metodele tradiționale de gătit, cum ar fi utilizarea gătirii prin fuziune, preparatele rezultate pot fi înțelese ca fiind alimente moleculare. Cu toate acestea, majoritatea experților culinari tind să considere alimentele moleculare ca alimente modificate genetic, mai degrabă decât alimente care sunt preparate într-un mod netradițional.