Η αντιμετώπιση της ουδετεροπενίας στα παιδιά ποικίλλει ανάλογα με την αιτία αυτής της κατάστασης. Εάν αυτό το ιατρικό πρόβλημα προκαλείται από φαρμακευτική αγωγή, τότε η χρήση των φαρμάκων θα διακοπεί ή η δόση θα μειωθεί για να διαπιστωθεί εάν αυτό έχει θετικό αντίκτυπο στην ουδετεροπενία. Όταν η ουδετεροπενία προκαλείται από μια σοβαρή λοίμωξη, που συνήθως υπομένει για μεγάλο χρονικό διάστημα, θα χορηγηθούν αντιβιοτικά ή φάρμακα για τη διαχείριση των συμπτωμάτων και θα επιτρέψουν στον ασθενή να αναρρώσει πιο γρήγορα. Για σοβαρή ουδετεροπενία, που συνήθως προκαλείται από δυσλειτουργία στην παραγωγή ουδετερόφιλων στο μυελό των οστών, η θεραπεία αποτελείται από παράγοντες διέγερσης αποικιών κοκκιοκυττάρων (G-CSFs) για την αύξηση της σύνθεσης των ουδετερόφιλων. Όταν μια αυτοάνοση απόκριση έναντι των ουδετερόφιλων προκαλεί ουδετεροπενία στα παιδιά, η θεραπεία συνίσταται στην καταστολή του ανοσοποιητικού συστήματος με τη χρήση στεροειδών.
Πολλά φάρμακα χημειοθεραπείας μπορούν να περιορίσουν τη δραστηριότητα του μυελού των οστών και να μειώσουν την παραγωγή ουδετερόφιλων, οδηγώντας σε ουδετεροπενία. Η πιο κοινή θεραπεία για αυτήν την αιτία είναι η μείωση ή η διάδοση των θεραπειών με φάρμακα ή, εάν είναι δυνατόν, η πλήρης διακοπή της χρήσης του φαρμάκου μέχρι να υποχωρήσει η ουδετεροπενία. Όταν αυτό δεν είναι δυνατό, τα παιδιά συχνά θα νοσηλεύονται για να ελαχιστοποιηθεί ο κίνδυνος μόλυνσης, θα παρακολουθούνται στενά για τυχόν σημάδια λοίμωξης και θα αντιμετωπίζονται με προφυλακτικά αντιβιοτικά. Οι γονείς παιδιών που πάσχουν από αυτό το είδος ουδετεροπενίας πρέπει να έχουν μια λίστα με προειδοποιητικά σημάδια μόλυνσης ή σημάδια ότι η ουδετεροπενία επιδεινώνεται και να παρακολουθούν το παιδί τους με εγρήγορση.
Οι παρατεταμένες ή σοβαρές λοιμώξεις, ειδικά σε βρέφη και παιδιά, μπορεί να αποδυναμώσουν τον οργανισμό και να τον εξαντλήσουν από ουδετερόφιλα, προκαλώντας ουδετεροπενία στα παιδιά. Όταν συμβαίνει αυτό, το παιδί θα υποβληθεί σε θεραπεία με ισχυρά αντιβιοτικά για να επιταχυνθεί η καταστροφή του ξένου εισβολέα. Μπορούν επίσης να συνταγογραφηθούν φάρμακα για να μειώσουν τα συμπτώματα και να επιτρέψουν στο παιδί να ξεκουραστεί επαρκώς για να ξαναχτίσει το σώμα. Όταν η ουδετεροπενία στα παιδιά είναι πραγματικά σοβαρή, το παιδί μπορεί να νοσηλευτεί ώστε να χορηγηθούν ενδοφλέβια αντιβιοτικά και να παρακολουθηθεί στενά η κατάσταση του παιδιού.
Η παιδική ουδετεροπενία, που προκαλείται από ένα ελάττωμα στη σύνθεση των ουδετερόφιλων, αντιμετωπίζεται με την έναρξη της θεραπείας με G-CFS. Τα G-CFS είναι συνθετικές ορμόνες που ξεκινούν την παραγωγή ουδετερόφιλων από τον μυελό των οστών. Αυτή η θεραπεία χορηγείται, συνήθως μία φορά την ημέρα, με ενδοφλέβια ένεση. Η ουδετεροπενία στα παιδιά που προκαλείται από μια αυτοάνοση απόκριση που καταστρέφει τα ουδετερόφιλα συνήθως αντιμετωπίζεται με στεροειδή. Αυτά τα φάρμακα καταστέλλουν το ανοσοποιητικό σύστημα και επιτρέπουν στο σώμα να αναδομήσει τη συγκέντρωση των ουδετερόφιλων.
Τα συμπτώματα της ουδετεροπενίας στα παιδιά είναι συχνά δύσκολο να διαβαστούν. Όταν ένα παιδί έχει λάβει θεραπεία με φάρμακα χημειοθεραπείας ή άλλα φάρμακα που είναι γνωστό ότι προκαλούν ουδετεροπενία, οι γονείς θα πρέπει να είναι προσεκτικοί για τυχόν σημάδια μόλυνσης. Εάν κάποιος γίνει αντιληπτός, θα πρέπει να κληθεί αμέσως ο παιδίατρος ή ο ογκολόγος. Το πιο κοινό σημάδι ουδετεροπενίας στα παιδιά είναι να αρρωσταίνουν συχνά και με μεγαλύτερη σοβαρότητα. Μερικά παιδιά μπορεί επίσης να έχουν πρησμένα ή αιμορραγικά ούλα.