Ένα μπαρόκ όργανο είναι ένα όργανο σωλήνα χτισμένο σε ένα συγκεκριμένο στυλ και σε ορισμένες προδιαγραφές κατά την εποχή του μπαρόκ. Αυτή η περίοδος διήρκεσε από το 1685 έως το 1750. Υπήρχαν πολλές καινοτομίες στην τέχνη, τη μουσική και την αρχιτεκτονική κατά τη διάρκεια αυτής της περιόδου, και ο σχεδιασμός του οργάνου των σωλήνων άλλαξε δραματικά, αυξάνοντας το μέγεθος, τη δύναμη και το μουσικό εύρος. Γνωστοί μπαρόκ συνθέτες όπως ο Γιόχαν Σεμπάστιαν Μπαχ στη Γερμανία συνεργάστηκαν με κύριους οργανοποιούς για να παραγάγουν αυτά που θεωρούνται μερικά από τα καλύτερα όργανα που έχουν κατασκευαστεί ποτέ.
Η μπαρόκ μουσική ήταν εξαιρετικά περίτεχνη και με πλούσια υφή. Το μπαρόκ όργανο που συνδέεται συχνότερα με τη θρησκευτική μουσική ήταν πολύ πιο ισχυρό από τα προκάτοχά του από την Αναγέννηση. Συχνά χρησιμοποιήθηκε ως σόλο όργανο, ή ως μέρος ενός «concerto grosso», δύο ή περισσότερων σόλο οργάνων με συνοδεία ορχήστρας. Το πάθος του Αγίου Ματθαίου του Μπαχ, χρησιμοποιώντας δύο όργανα στη σύνθεση, γράφτηκε το 1727 και θεωρείται ένα από τα αριστουργήματα της δυτικής ιερής μουσικής.
Όπως αναπτύχθηκε κατά την περίοδο του μπαρόκ, το όργανο έγινε ένα “πλένο” ή πλήρες όργανο. Ένα ιταλικό όργανο σωλήνων πλήρους μεγέθους, για παράδειγμα, μπορεί να έχει έως και 600 σωλήνες και να περιέχει πάνω από 2000 μέρη. Μερικά από τα μεγαλύτερα όργανα που δημιουργήθηκαν κατά την περίοδο έχουν χιλιάδες σωλήνες και έως και επτά εγχειρίδια ή πληκτρολόγια, συνδεδεμένα με τους σωλήνες των οργάνων. Σε εξωτερικό σχεδιασμό, τα όργανα τείνουν να μοιάζουν με τους μπαρόκ καθεδρικούς ναούς στους οποίους χρησιμοποιούνταν συχνά. Ένα σωλήνα οργάνου της περιόδου προοριζόταν να είναι έργο τέχνης καθώς και όργανο.
Μαζί με την αύξηση του μεγέθους του, το μπαρόκ όργανο υπέστη πολλές τεχνικές καινοτομίες. Τέτοιες συνεργασίες μεταξύ του Μπαχ και του κύριου οργανοποιού Γκότφριντ Σίλμπερμαν βοήθησαν να επιτευχθούν ορισμένες αλλαγές. Ο Silbermann κατασκεύασε όργανα για χρήση σε όλη την Ευρώπη.
Μια σημαντική αλλαγή ήταν η αύξηση του αριθμού και του σχεδιασμού των στάσεων οργάνων και η διάταξη εγχειριδίων και σωλήνων. Το όργανο “σταματά” αφήνει τον αέρα υπό πίεση στους σωλήνες και μπορεί να ενεργοποιηθεί ή απενεργοποιηθεί από τον οργανίστα. Άρχισαν να σχεδιάζονται στάσεις που θα μπορούσαν να μιμηθούν τους ήχους άλλων οργάνων. Αυξήθηκαν επίσης σε αριθμό, επιτρέποντας μια τεράστια ποικιλία ήχων.
Τα ξεχωριστά πληκτρολόγια για τα πόδια, αποτελούμενα από πεντάλ, επεκτάθηκαν για να επιτρέψουν μεγαλύτερη ρύθμιση των ήχων. Οι σωλήνες οργανώθηκαν σε ράφια. Κάθε ράφι αντιστοιχούσε σε διαφορετικό ύψος, ξυλεία και όγκο.
Πολλές από τις καινοτομίες του σχεδιασμού του μπαρόκ οργάνου εξακολουθούν να χρησιμοποιούνται σήμερα. Τα όργανα που σώζονται από την περίοδο θεωρούνται έργα τέχνης και πολλά εκτίθενται σε μουσεία. Μερικά από τα σχέδια έχουν αναδημιουργηθεί για σύγχρονη χρήση.