Η έμφυτη ανοσολογία ασχολείται με τη λειτουργία και τη δομή του ανοσοποιητικού συστήματος. Πιο συγκεκριμένα, εστιάζει στην έμφυτη ανοσία. Το ανοσοποιητικό σύστημα χωρίζεται σε δύο ομάδες: το έμφυτο και το προσαρμοστικό.
Η έμφυτη ανοσολογία εστιάζει στις μη ειδικές άμυνες του ανοσοποιητικού συστήματος. Αυτές οι άμυνες περιλαμβάνουν χημικές ουσίες που εμφανίζονται στο αίμα, φυσικούς φραγμούς και κύτταρα που δημιουργούνται για να επιτεθούν σε ξένες ουσίες. Η μελέτη αυτής της περιοχής βοηθά τους ερευνητές να προσδιορίσουν πόσο γρήγορα ανταποκρίνεται το σώμα στην έκθεση σε αντιγόνα.
Το έμφυτο και προσαρμοστικό ανοσοποιητικό σύστημα εργάζεται προς τον ίδιο στόχο της προστασίας του σώματος από ξένες ουσίες, αλλά ο τρόπος με τον οποίο επιτυγχάνουν αυτόν τον στόχο διαφέρει. Το έμφυτο ανοσοποιητικό σύστημα είναι έτοιμο να αμυνθεί από τη στιγμή που εμφανίζεται η έκθεση, αλλά το προσαρμοστικό ανοσοποιητικό σύστημα χρειάζεται περισσότερο χρόνο για να ανταποκριθεί — πρέπει να προσαρμοστεί. Η έμφυτη ανοσολογία έχει δείξει ότι είναι το προσαρμοστικό ανοσοποιητικό σύστημα που αμύνεται ενάντια στο συγκεκριμένο αντιγόνο που πυροδότησε την απόκριση. το έμφυτο ανοσοποιητικό σύστημα είναι μη ειδικό επειδή αντιδρά εξίσου σε όλα τα αντιγόνα. Το έμφυτο ανοσοποιητικό σύστημα δεν θυμάται τα αντιγόνα στα οποία έχει προηγουμένως εκτεθεί.
Αν και η έμφυτη ανοσολογία μελετά το έμφυτο ανοσοποιητικό σύστημα, πρέπει επίσης να μελετήσει πώς το έμφυτο και το προσαρμοστικό σύστημα συνεργάζονται. Υπάρχουν πολλά συστατικά του ενός που επηρεάζουν τα συστατικά του άλλου. Για παράδειγμα, εάν το προσαρμοστικό ανοσοποιητικό σύστημα ανακαλύψει έναν οργανισμό που είχε συναντήσει προηγουμένως, θα εργαστεί πιο γρήγορα για να τον καταστρέψει χωρίς να χρειαστεί πολύς χρόνος για να προσαρμοστεί, αλλά εάν υπάρχει ένας επιπλέον οργανισμός ή μόλυνση που δεν αναγνωρίζεται, το έμφυτο ανοσοποιητικό σύστημα θα αμύνεται ήδη όταν ξεκινήσει το προσαρμοστικό σύστημα. Την ίδια στιγμή, όταν το έμφυτο ανοσοποιητικό σύστημα δημιουργεί μια κυτταρική άμυνα, το προσαρμοστικό σύστημα ανταποκρίνεται ανάλογα. Ωστόσο, το έμφυτο σύστημα αντιδρά πρώτο, επειδή το προσαρμοστικό σύστημα χρειάζεται περισσότερο χρόνο για να αναγνωρίσει και να ανταποκριθεί.
Μέσω της έμφυτης ανοσολογίας, η έρευνα έχει δείξει ότι υπάρχουν αρκετά στοιχεία του έμφυτου συστήματος. Τα ανατομικά εμπόδια είναι οι πρώτες άμυνες και είναι σωματικά, όπως το δέρμα. Εάν τα ανατομικά φράγματα είναι κατεστραμμένα, ξεκινά η μόλυνση. οι άμυνες περιλαμβάνουν φλεγμονή. Τα μακροφάγα και τα φυσικά κύτταρα φονείς παρέχουν μέρος των κυτταρικών φραγμών.
Μαθαίνοντας για το πώς λειτουργεί το ανοσοποιητικό σύστημα για την καταπολέμηση των λοιμώξεων, οι ερευνητές συνεισφέρουν σημαντικές βιοϊατρικές πληροφορίες. Με τις λεπτομέρειες που μαθαίνονται για το έμφυτο σύστημα, μαθαίνεται επίσης πώς το σώμα θα ανταποκριθεί σε συγκεκριμένους οργανισμούς. Αυτό βοηθά στον προσδιορισμό του πόσο αποτελεσματικά μπορεί να είναι τα φάρμακα και πότε χρειάζονται για να ενισχύσουν τις φυσικές αποκρίσεις του σώματος.