Η γενετική φωνολογία είναι ένας κλάδος της γενετικής γλωσσολογίας που καθορίζει το υποκείμενο σύνολο κανόνων που διέπουν την προφορά των λέξεων στη μητρική γλώσσα ενός ατόμου. Γενικά, η γενετική γλωσσολογία αναφέρεται στη θεωρία ότι όλη η ανθρώπινη γλώσσα παράγεται από γλωσσικές δομές που είναι συνδεδεμένες στον εγκέφαλο κατά τη γέννηση. Καθώς ένα άτομο αποκτά τη μητρική του/της γλώσσα, ενεργοποιούνται οι δομές που ισχύουν για τη συγκεκριμένη γλώσσα. Σύμφωνα με τη θεωρία της γενετικής φωνολογίας λοιπόν, το άτομο αποκτά επίσης ορισμένους κανόνες σχετικά με το ποιοι ήχοι μπορούν να συνδυαστούν με ποιους τρόπους. Η φωνολογία σχετίζεται στενά με τη φωνητική, εκτός από το ότι η φωνητική αναφέρεται στους ήχους που παράγονται πραγματικά μέσα σε μια γλώσσα, παρά στους κανόνες που διέπουν τους ήχους.
Τα αποτελέσματα της γενετικής φωνολογίας μπορούν να φανούν στον τρόπο που μια λέξη προέρχεται από μια άλλη μέσα σε μια γλώσσα. Στα Αγγλικά, για παράδειγμα, το πρόθεμα “in-” χρησιμοποιείται συχνά σε μια ρίζα λέξης για να την αναιρέσει. Σε ορισμένες περιπτώσεις, ωστόσο, ο συνδυασμός αυτού του προθέματος και των αρχικών ήχων της ρίζας παράγει έναν συνδυασμό ήχων που παραβιάζει τους κανόνες της αγγλικής φωνολογίας, επομένως το πρόθεμα ή η ρίζα τροποποιείται με κάποιο τρόπο. Η λέξη “υλικό”, για παράδειγμα, γίνεται “άυλο” με το πρόθεμα “im-” αντί “in-“, επειδή η προφορά [inma] δεν επιτρέπεται. Κάποια στιγμή οι ομιλητές της αγγλικής γλώσσας τροποποίησαν αυτή τη λέξη ώστε να ταιριάζει καλύτερα με τους κανόνες της φωνολογίας της.
Άλλες περιπτώσεις γενετικής φωνολογίας δεν φαίνονται στον πραγματικό σχηματισμό των λέξεων, αλλά στον τρόπο που προφέρονται. Τα Αμερικάνικα Αγγλικά, για παράδειγμα, περιέχουν έναν φωνολογικό κανόνα γνωστό ως «κανόνας πτυσσόμενου», ο οποίος δηλώνει ότι ένας ήχος [t] γίνεται πτερύγιο [ɾ] πριν από ένα άτονο φωνήεν. Το πτερύγιο προφέρεται πιο κοντά σε ήχο [d] παρά σε ήχο [t]. Αυτό μπορεί να παρατηρηθεί όταν η λέξη “μάχη” [‘fait] γίνεται “μαχητής” [‘fai dur] και χάνει τον σκληρό [t] ήχο.
Η έρευνα στη γενετική φωνολογία περιλαμβάνει τη χαρτογράφηση φωνολογικών κανόνων που παρατηρούνται λιγότερο εύκολα από τα παραδείγματα που αναφέρθηκαν παραπάνω, τόσο στα αγγλικά όσο και σε άλλες γλώσσες. Το 1968 The Sound Pattern of English των Noam Chomsky και Morris Halle ήταν το πρώτο ολοκληρωμένο έργο για την αγγλική φωνολογία, αλλά η μετέπειτα έρευνα βελτίωσε και αμφισβήτησε ορισμένες από τις υποθέσεις αυτού του έργου. Ορισμένοι το έχουν χρησιμοποιήσει ως πρότυπο από το οποίο βασίζουν τη φωνολογική έρευνα σε άλλες γλώσσες.