Η λέξη «μικροχλωρίδα» αναφέρεται στη συλλογή ζωντανών μικροσκοπικών οργανισμών που ευδοκιμούν μέσα στα όργανα των ζωντανών πλασμάτων. Αυτά τα μικρόβια, που υπάρχουν σε μέρη όπως το στομάχι, ο φάρυγγας και ο κόλπος, περιλαμβάνουν μύκητες, βακτήρια και ιούς. δρουν ως προστατευτικοί παράγοντες που ενισχύουν το ανοσοποιητικό σύστημα ή ως καταστροφικοί παράγοντες που αποδυναμώνουν τον οργανισμό. Ορισμένα περιβάλλοντα φιλοξενούν μικροχλωρίδα που περιλαμβάνει ιούς και σκουλήκια. Οι κάτοικοι της μικροχλωρίδας, που ονομάζεται επίσης μικροβιακή, μπορεί να είναι είτε ωφέλιμοι είτε κακόβουλοι ανάλογα με το αν είναι αναερόβιοι ή αερόβιοι. Η ρίζα της λέξης «χλωρίδα» υποδηλώνει ότι η μικροχλωρίδα αναφέρεται στα μικρόβια που ζουν στα λουλούδια. η λέξη έχει εξελιχθεί, ωστόσο, για να αναφέρεται κυρίως σε οικοσυστήματα μέσα στα ζώα.
Τα ευεργετικά και θρεπτικά μικρόβια μέσα στις περισσότερες μικροχλωρίδες ονομάζονται συνήθως προβιοτικά. είναι αναερόβιες. Τα Bifidobacteria και οι γαλακτοβάκιλλοι είναι δύο από τα πιο κοινά προβιοτικά στη μικροχλωρίδα πολλών ζώων. Οι γαλακτοβάκιλλοι έλκονται από περιβάλλοντα με υψηλή περιεκτικότητα σε ζάχαρη και άμυλο. Παράγουν γαλακτικό οξύ, το οποίο τροφοδοτεί τους μύες με επιπλέον ενέργεια, σύμφωνα με πολλούς γιατρούς. Σε ορισμένες περιοχές του σώματος, οι γαλακτοβάκιλλοι παράγουν το απολυμαντικό υπεροξείδιο του υδρογόνου. Τα βακτήρια των γαλακτοβακίλλων, που υπάρχουν κυρίως στα έντερα, τον κόλπο και το ουροποιητικό σύστημα, υποτίθεται ότι βοηθούν τη θετική μικροχλωρίδα του σώματος να αποκρούσει τα παθογόνα, τα οποία είναι μικρόβια που προκαλούν ασθένειες.
Τα Bifidobacteria, όπως και οι γαλακτοβάκιλλοι, κατοικούν επίσης στα έντερα και στον κόλπο, παράγοντας προστατευτικό γαλακτικό οξύ. Αυτά τα βακτήρια είναι γνωστά για την πρόληψη των ελκών και της διάρροιας όταν υπάρχουν σε επαρκή αφθονία. Υποτίθεται επίσης ότι βοηθούν στην ανακούφιση από τον πόνο στο στήθος, το έκζεμα και τη γρίπη. Ο καρκίνος, η ηπατίτιδα και οι μολύνσεις ζύμης βοηθούνται επίσης από τα bifidobacteria.
Η μικροχλωρίδα είναι καλύτερη όταν είναι ισορροπημένη. Όποτε η αναλογία των προβιοτικών είναι στρεβλή, μπορεί να προκύψουν λοιμώξεις και ασθένειες λόγω των υψηλών συγκεντρώσεων επιβλαβών βακτηρίων όπως ο σταφυλόκοκκος, οι ζυμομύκητες και ο στρεπτόκοκκος. Τα όργανα μπορούν επίσης να σταματήσουν να λειτουργούν σωστά. Η κακή διατροφή, οι ασθένειες και τα φάρμακα όπως η χημειοθεραπεία μπορούν να εξοντώσουν τα καλά βακτήρια και να καταστρέψουν την ισορροπία των μικροβίων. Η γενετική, οι περιβαλλοντικοί ρύποι και το στρες μπορούν επίσης να καταστρέψουν τις αναλογίες βακτηρίων.
Για να αποκατασταθεί αυτή η ισορροπία ή να διατηρηθεί τακτικά, πολλοί άνθρωποι αυξάνουν τη διατροφή τους με συμπληρώματα σε σκόνη ή κάψουλες που περιέχουν προβιοτικά. Η σωστή δοσολογία εξαρτάται από το άτομο και την παρούσα αναλογία καλών και κακών βακτηρίων του οργανισμού. Πολλοί χρήστες πειραματίζονται με την σταδιακή αύξηση της συνιστώμενης δόσης έως ότου παρατηρήσουν μια αλλαγή στα επίπεδα μόλυνσης, ερεθισμού ή ενέργειας.
Τρόφιμα που έχουν υποστεί ζύμωση όπως το γιαούρτι και το αλκοόλ μπορούν συχνά να προσθέσουν ευεργετική μικροχλωρίδα. Το μητρικό γάλα προσφέρει υψηλά επίπεδα προβιοτικών στη μικροχλωρίδα των βρεφών. Η αναλογία των καλών βακτηρίων προς τα κακά βακτήρια στα έντερα και αλλού στο σώμα είναι συνήθως 85 τοις εκατό έως 15 τοις εκατό τόσο για βρέφη όσο και για ενήλικες.