Οι προσπάθειες διατήρησης ερπετών αντιμετωπίζουν την απώλεια φυσικού οικοτόπου και τον μειούμενο αριθμό ορισμένων ειδών. Οι ομάδες προστασίας εργάζονται για να φέρουν την προσοχή στο ζήτημα μέσω της εκπαίδευσης, της προστασίας ή της αποκατάστασης των οικοτόπων και νομοθεσίας που υποστηρίζει τη διατήρηση των ερπετών. Αυτές οι ομάδες χρησιμοποιούν συνήθως επιστημονική έρευνα για να προσδιορίσουν πώς ορισμένα ερπετά κινδυνεύουν ή απειλούνται και αναζητούν λύσεις για την προστασία χελωνών και χελωνών, φιδιών και σαυρών, και κροκόδειλων και αλιγάτορων.
Ο μειούμενος αριθμός θαλάσσιων χελωνών ώθησε τις διεθνείς συνθήκες να προστατεύσουν την επιβίωση αυτών των πλασμάτων. Η ρύπανση, ειδικά από πλαστικά απόβλητα, και η σύλληψη για εμπορική χρήση αποτελούν απειλές για τις θαλάσσιες χελώνες παγκοσμίως. Μερικές θαλάσσιες χελώνες πεθαίνουν όταν παγιδευτούν κατά λάθος σε εμπορικά δίχτυα αλιείας. Τα προγράμματα διατήρησης αντιμετωπίζουν επίσης την ανθρώπινη καταστροφή των τόπων φωλιάσματος στην παραλία.
Το Reptile Conservation International, ένας μη κερδοσκοπικός οργανισμός, προωθεί την εφαρμογή συνθετικών ορμονών σε αυγά χελώνας για την παραγωγή περισσότερων θηλυκών. Οι ερευνητές ανακάλυψαν ότι οι τοπικές εφαρμογές οιστρογόνων θα μπορούσαν να παρακάμψουν τη φυσική διαδικασία που καθορίζει το φύλο των χελωνών κατά την περίοδο επώασης. Η θερμοκρασία των αυγών στο τελευταίο στάδιο της ανάπτυξης καθορίζει το φύλο και η χειραγώγηση αυτής της διαδικασίας μπορεί να αναπληρώσει απειλούμενα είδη.
Πειράματα σε δύο είδη θαλάσσιων χελωνών, χελώνες γλυκού νερού, κροκόδειλους εκτροφής και γκέκο έδειξαν ότι αυτή η κατοχυρωμένη με δίπλωμα ευρεσιτεχνίας μέθοδος δεν δημιουργεί καμία αρνητική επίδραση στην ικανότητα αναπαραγωγής μιας γυναίκας στην ωριμότητα. Η ομάδα προστασίας ερπετών θεωρεί την εφαρμογή ορμονών έναν οικονομικά αποδοτικό τρόπο για την αντιμετώπιση των απειλούμενων ερπετών, αναφέροντας ότι 20 δολάρια ΗΠΑ (USD) μπορούν να θεραπεύσουν περίπου 250,000 αυγά. Αυτή η μέθοδος μπορεί να αντικαταστήσει το έργο της εκσκαφής αυγών χελώνας και της μεταφοράς τους σε εγκαταστάσεις επώασης εκτός χώρου, μια διαδικασία που συνήθως παράγει μεγαλύτερο αριθμό αρσενικών και δημιουργεί δυσκολίες σε απομακρυσμένες περιοχές.
Η προστασία των οικοτόπων αντιπροσωπεύει έναν άλλο στόχο των προγραμμάτων διατήρησης ερπετών. Τα φυσικά ενδιαιτήματα ενδέχεται να μολυνθούν από τη ρύπανση ή να καταστραφούν από την αστική ανάπτυξη. Η χελώνα της ερήμου μπορεί να επηρεαστεί από οχήματα εκτός δρόμου, κτηνοτροφία ή γεωργική επέκταση και ανάπτυξη εναλλακτικών πηγών ενέργειας. Οι ομάδες προστασίας συνεργάζονται συνήθως με ιδιώτες ιδιοκτήτες γης και δημόσιους οργανισμούς για την προστασία και την αποκατάσταση αυτών των περιοχών.
Τα εκπαιδευτικά συστατικά της διατήρησης των ερπετών συνήθως περιλαμβάνουν πληροφορίες για την εξάλειψη των μύθων για ορισμένα είδη, ειδικά για κροκόδειλους, αλιγάτορες και φίδια. Οι ομάδες διατήρησης εξηγούν συνήθως τη σημασία κάθε είδους στο οικοσύστημα και παροτρύνουν τους πολίτες να υποστηρίξουν τις προσπάθειες διατήρησης. Αυτές οι ομάδες μπορεί επίσης να συνεργαστούν με τους ιδιοκτήτες γης για τη διατήρηση του απειλούμενου οικοτόπου.
Η προστασία των ερπετών μπορεί να περιλαμβάνει τον οικοτουρισμό, μια από τις ταχύτερα αναπτυσσόμενες βιομηχανίες παγκοσμίως. Αντιμετωπίζει τη λεπτή ισορροπία μεταξύ της διατήρησης των οικονομικών οφελών του τουρισμού με πιθανές βλάβες στο περιβάλλον. Πολλές οικοτουριστικές δραστηριότητες ενσωματώνουν εκπαιδευτικές καμπάνιες στη συνολική εμπειρία παρατήρησης ερπετών στη φύση.