Τα απειλούμενα είδη είναι οργανισμοί που κινδυνεύουν να εξαφανιστούν στο σχετικά κοντινό μέλλον, εκτός εάν συμβεί παρέμβαση ή ριζική αλλαγή. Εάν δεν ληφθούν μέτρα διατήρησης, αυτά τα είδη μπορεί να εξαφανιστούν στη φύση. Ενώ μπορούν να χρησιμοποιηθούν αιχμάλωτα προγράμματα αναπαραγωγής για τη διατήρηση του είδους, τέτοια προγράμματα ενέχουν κινδύνους, συμπεριλαμβανομένης της απώλειας της γενετικής ποικιλομορφίας ως αποτέλεσμα περιορισμένου αριθμού οργανισμών που έχουν εγγραφεί στο πρόγραμμα για να ξεκινήσουν, καθώς και δυσκολίες στην οργάνωση και διατήρηση ενός προγράμματος αναπαραγωγής. Ορισμένα είδη, για παράδειγμα, είναι εξαιρετικά δύσκολο να αναπαραχθούν σε αιχμαλωσία.
Η Διεθνής Ένωση για τη Διατήρηση της Φύσης (IUCN) χρησιμοποιεί το «απειλείται» ως μια ευρεία κατηγορία για να περιγράψει είδη που είναι ευάλωτα, υπό εξαφάνιση και σε κίνδυνο. Τα απειλούμενα είδη καταγράφονται σε μια λίστα γνωστή ως Κόκκινη Λίστα και τέτοια είδη μερικές φορές είναι γνωστά ως «είδη κόκκινης λίστας» για να αντικατοπτρίζουν αυτό. Η Κόκκινη Λίστα του IUCN διατίθεται στο διαδίκτυο και δημοσιεύεται επίσης σε έντυπη μορφή. Αναθεωρείται και ενημερώνεται συνεχώς για να αντικατοπτρίζει νέες προσθήκες και αλλαγές στην κατάσταση, προκειμένου να ενημερώνεται η κοινότητα διατήρησης για τις νέες εξελίξεις.
Στις Ηνωμένες Πολιτείες, το «απειλούμενο» είναι μία από τις δύο κατηγορίες προστασίας βάσει του νόμου περί ειδών υπό εξαφάνιση. Η άλλη κατηγορία είναι «υπό εξαφάνιση». Αυτή η διαφορά στην ορολογία μπορεί να προκαλέσει σύγχυση σε άτομα που έχουν συνηθίσει τους ορισμούς του IUCN ή σε συνομιλίες όπου οι άνθρωποι δεν διευκρινίζουν και παρέχουν πληροφορίες σχετικά με το σύστημα ταξινόμησης που χρησιμοποιούν. Άλλα κράτη με νόμους για την προστασία των απειλούμενων ειδών τείνουν να χρησιμοποιούν τα πρότυπα IUCN και αυτά τα πρότυπα χρησιμοποιούνται επίσης στο διεθνές δίκαιο.
Υπάρχουν πολλοί λόγοι για τους οποίους τα είδη μπορούν να απειληθούν, συμπεριλαμβανομένης της απώλειας του οικοτόπου, του κυνηγιού, των ασθενειών και της κλιματικής αλλαγής. Οι επιστήμονες που ερευνούν απειλούμενα είδη διερευνούν τους μυριάδες λόγους για τους οποίους οι οργανισμοί μπορούν να γίνουν ευάλωτοι στην εξαφάνιση. Η διασυνδεδεμένη φύση των σχέσεων μεταξύ ζώων και περιβάλλοντος μπορεί να γίνει ιδιαίτερα σημαντική, καθώς η απώλεια ενός είδους μπορεί να δημιουργήσει ένα φαινόμενο ντόμινο που εξαπλώνεται σε άλλα είδη. Ο προσδιορισμός των βασικών ειδών σε ένα περιβάλλον πριν εξαφανιστούν είναι μια σημαντική πτυχή της διατήρησης.
Τα βήματα που μπορούν να ληφθούν για τη διατήρηση των ειδών περιλαμβάνουν τη δημιουργία αιχμαλωτισμένων προγραμμάτων αναπαραγωγής για τη δημιουργία μιας δεξαμενής γονιδίων που μπορεί να επανεισαχθεί στην άγρια φύση, μαζί με τη ψήφιση νόμων για την προστασία των περιοχών της ερημιάς, τον καθαρισμό των περιβαλλοντικών κινδύνων και τη λήψη μέτρων για τον περιορισμό των ανθρώπινων δραστηριοτήτων που απειλούν περιβάλλον. Αυτό περιλαμβάνει την πραγματοποίηση αλλαγών πολιτικής σε διεθνές επίπεδο, καθώς και την ενθάρρυνση μεμονωμένων κοινοτήτων να διατηρήσουν τα απειλούμενα είδη στις περιοχές τους.