Το καλαμπόκι Bt είναι ένας γενετικά τροποποιημένος οργανισμός (ΓΤΟ) που έχει κατασκευαστεί βιομηχανικά για να αντιστέκεται στον ευρωπαϊκό τρυπητή καλαμποκιού, ένα παράσιτο των καλλιεργειών που μπορεί να προκαλέσει σημαντική ζημιά στις καλλιέργειες. Πολλά έθνη φυτεύουν αυτό το είδος καλαμποκιού και χρησιμοποιείται σε διάφορες βιομηχανίες. Μελέτες που διεξήχθησαν για αυτόν τον ΓΤΟ φαίνεται να υποδηλώνουν ότι δεν έχει αρνητικές επιπτώσεις στην ανθρώπινη υγεία, με αποτέλεσμα πολλοί κρατικοί φορείς να τον πιστοποιήσουν ως ασφαλή για χρήση.
Αυτό το καλαμπόκι εκμεταλλεύεται μια τοξίνη που παράγεται από το βακτήριο Bacillus thuringiensis. Η τοξίνη, γνωστή ως Bt, διαρρηγνύει τα έντερα του καλαμποκιού και των σχετικών οργανισμών όταν καταποθεί. Τα παράσιτα συνήθως πεθαίνουν μέσα σε δύο έως τρεις ημέρες από την κατάποση της τοξίνης. Ήδη από τη δεκαετία του 1930, οι αγρότες καλλιεργούσαν το βακτήριο ως μέθοδο καταπολέμησης των παρασίτων και ψέκαζαν την τοξίνη στις καλλιέργειές τους για να αποτρέψουν τη μόλυνση από το παράσιτο.
Η τοπική εφαρμογή αυτού του φυσικού φυτοφαρμάκου είχε ορισμένα ελαττώματα, συμπεριλαμβανομένης της ανομοιόμορφης κάλυψης και της τελικής απομάκρυνσής του. Ως αποτέλεσμα, οι ερευνητές άρχισαν να διερευνούν την ιδέα της εισαγωγής των γονιδίων που κωδικοποιούν την τοξίνη απευθείας στον γενετικό κώδικα του καλαμποκιού, μαζί με ένα τμήμα κώδικα γνωστό ως προαγωγέας, το οποίο θα ενθάρρυνε το καλαμπόκι να παράγει την τοξίνη και ένας δείκτης που θα μπορούσε να χρησιμοποιηθεί για την παρακολούθηση και την αναγνώριση τροποποιημένου καλαμποκιού.
Μετά από κάποιες δοκιμές και σφάλματα, αρκετές εταιρείες είχαν αναπτύξει καλαμπόκι Bt και το εργοστάσιο υποβλήθηκε σε επιθεώρηση από κυβερνητικές υπηρεσίες για να διαπιστωθεί εάν ήταν ασφαλές ή όχι. Μόλις εγκριθεί, θα μπορούσε να φυτευτεί από αγρότες, μαζί με τις αποκαλούμενες καλλιέργειες «καταφυγίου» καλαμποκιού που δεν είναι Bt. Οι καλλιέργειες καταφυγίου χρησιμοποιούνται για να αποθαρρύνουν την αντίσταση του Bt παρέχοντας ζωοτροφές για τον Ευρωπαίο καλαμποκιού που είναι ασφαλής για κατανάλωση. Η ιδέα είναι ότι εάν μερικά έντομα αναπτύξουν ανθεκτικότητα, μπορεί να ζευγαρώσουν με έντομα που έφαγαν από την καλλιέργεια του καταφυγίου, αραιώνοντας ή εξαλείφοντας την αντίσταση. Αντίθετα, ένα χωράφι που καλύπτεται μόνο από καλαμπόκι Bt θα προωθούσε την αντίσταση σκοτώνοντας όλα τα έντομα που ήταν ευάλωτα στο Bt και προωθώντας την επιβίωση των ανθεκτικών εντόμων.
Ενώ αυτό το καλαμπόκι έχει σαφώς κάποια πλεονεκτήματα, δεν ήταν χωρίς διαμάχη. Ορισμένοι ερευνητές έχουν εκφράσει ανησυχίες ότι το καλαμπόκι ή η γύρη του θα μπορούσαν να επηρεάσουν τους πληθυσμούς των πεταλούδων, καθώς οι προνύμφες πεταλούδων είναι ευάλωτες στην τοξίνη. Μελέτες έχουν επίσης δείξει ότι έχει διασταυρωθεί με το κανονικό καλαμπόκι, δημιουργώντας ασθενείς ποσότητες της τοξίνης σε στελέχη καλαμποκιού που δεν πρέπει να περιέχουν Bt. Ορισμένοι αντίπαλοι των ΓΤΟ υποστήριξαν επίσης ότι δεν είναι αρκετά γνωστά για τις πιθανές επιπτώσεις τους στην ανθρώπινη υγεία, γεγονός που τους καθιστά κινδύνους για την ασφάλεια.