Αρκετά χαρακτηριστικά χρειάζονται στο σχεδιασμό ενός ιδανικού εκκολαπτηρίου για να διασφαλιστεί ότι η εγκατάσταση είναι ασφαλής, καθαρή και εύκολη στη χρήση. Ένα καλά σχεδιασμένο εκκολαπτήριο θα είναι πιο παραγωγικό, με μικρότερο κίνδυνο απώλειας και περισσότερες δυνατότητες άντλησης επιπλέον αποθεμάτων καθώς διευρύνονται οι δραστηριότητες του εκκολαπτηρίου. Θα πρέπει επίσης να συμμορφώνεται με τους ισχύοντες νόμους που αφορούν τα εκκολαπτήρια και την κτηνοτροφία.
Τα εκκολαπτήρια χρησιμοποιούνται με σκοπό την επώαση των αυγών πουλερικών και ψαριών για να εκκολαφθούν ζωντανά νεαρά και στη συνέχεια να μεγαλώσουν τα μικρά μέχρι να είναι αρκετά μεγάλα για να πουληθούν ή να μεταφερθούν σε άλλη τοποθεσία. Τα βιομηχανικά εκκολαπτήρια λειτουργούν συνεχώς, θέτοντας σοβαρές προκλήσεις στο σχεδιασμό γιατί πρέπει να φιλοξενούν αυγά και μικρά σε διάφορα στάδια ανάπτυξης. Οι σχεδιαστικές εκτιμήσεις ποικίλλουν, ανάλογα με το αν η εγκατάσταση χρησιμοποιείται για πουλερικά ή ψάρια.
Και στις δύο περιπτώσεις, ένα ιδανικό εκκολαπτήριο έχει εξαιρετικό αερισμό και σχεδιασμό που διευκολύνει τον καθαρισμό για να διατηρηθεί ο χώρος όσο το δυνατόν πιο υγιεινός. Θα πρέπει να περιλαμβάνει ξεχωριστούς χώρους για επώαση αυγών και στέγαση μικρών για τη μείωση της εξάπλωσης της ασθένειας, μαζί με έναν ασφαλή χώρο για την αποθήκευση ζωοτροφών και άφθονη παροχή γλυκού νερού. Ένα ιδανικό εκκολαπτήριο διαθέτει επίσης σαφή πρωτόκολλα για τους εργαζόμενους, όπως απαγόρευση διέλευσης μεταξύ εκκολαπτηρίων και περιοχών με σκοπό να διατηρηθούν αυτές οι περιοχές όσο το δυνατόν πιο ξεχωριστές.
Στην περιοχή όπου τα αυγά επωάζονται και εκκολάπτονται, πρέπει να υπάρχει άφθονος χώρος για να μετακινηθείτε, μαζί με χώρο για να απομονώσετε διαφορετικά είδη ή φυλές. Σε ένα εκκολαπτήριο πουλερικών, διαφορετικές φυλές μπορούν να επωαστούν σε ξεχωριστές θερμοκοιτίδες και δίσκους, ενώ σε ένα εκκολαπτήριο ψαριών, διαφορετικές λίμνες θα χρησιμοποιηθούν για να κρατήσουν τα είδη χωριστά. Ο χώρος πρέπει επίσης να είναι εύκολος στην παρακολούθηση, έτσι ώστε το προσωπικό να μπορεί να είναι σε εγρήγορση για την ανάπτυξη προβλημάτων όπως οι διακυμάνσεις της θερμοκρασίας ή οι ακαθαρσίες στο νερό.
Στους χώρους όπου οι νεαροί μεταφέρονται μετά την εκκόλαψή τους, η καθαριότητα είναι κρίσιμη. Ο μεγάλος όγκος νεαρών ζώων μπορεί να δημιουργήσει μια εκπληκτική ποσότητα αποβλήτων και αυτά τα απόβλητα πρέπει να συλλέγονται και να απορρίπτονται υπεύθυνα. Πρέπει επίσης να ληφθούν μέτρα για τη σίτιση και την απομόνωση των ζώων για να επιβεβαιωθεί ότι είναι υγιή πριν τους επιτραπεί να αναμειχθούν με τον γενικό πληθυσμό. Ένας χώρος επεξεργασίας για την προετοιμασία των ζώων για αποστολή είναι επίσης ένα σημαντικό μέρος του σχεδιασμού σε ένα ιδανικό εκκολαπτήριο.
Το να υπάρχει χώρος για τα ζώα είναι προφανώς το κλειδί σε ένα ιδανικό εκκολαπτήριο, αλλά απαιτείται χώρος και για τους ανθρώπους. Τα εκκολαπτήρια πρέπει να τηρούν εκτενή αρχεία για τα ζώα που εκτρέφουν, πράγμα που απαιτεί πολύ χώρο γραφείου. Πολλοί πρέπει επίσης να παρέχουν ορισμένες κτηνιατρικές υπηρεσίες, συμπεριλαμβανομένων βασικών υπηρεσιών όπως η μέτρηση και η ζύγιση νεαρών ζώων, και οι υπάλληλοι χρειάζονται επίσης ένα μέρος για να αλλάξουν, με ορισμένα εκκολαπτήρια να διαθέτουν αίθουσες διακοπών και χώρους ντους επίσης.