Κατά την επιλογή της καλύτερης διάταξης αγωγών, τα δύο κύρια ζητήματα είναι η δρομολόγηση και το μέγεθος του αγωγού. Ένα καλά σχεδιασμένο σύστημα αγωγών θα παρέχει ομοιόμορφες θερμοκρασίες σε όλο το κτίριο, θα ελαχιστοποιεί τον θόρυβο και θα λαμβάνει υπόψη τα αρχιτεκτονικά εμπόδια. Λογισμικό χαμηλού κόστους είναι διαθέσιμο για να βοηθήσει τον σχεδιαστή να καθορίσει το βέλτιστο μέγεθος του αγωγού, λαμβάνοντας υπόψη την αρχιτεκτονική του κτιρίου και τα πιθανά εμπόδια. Οι στρογγυλοί αγωγοί είναι εγγενώς πιο αποτελεσματικοί και λιγότερο δαπανηροί στην κατασκευή τους, αλλά, σε ορισμένες περιπτώσεις, τα εμπόδια ή τα διάκενα μπορεί να υπαγορεύουν τη χρήση ορθογώνιων αγωγών.
Για να σχεδιάσετε την καλύτερη διάταξη αγωγών, είναι απαραίτητο να προσδιορίσετε πρώτα τον όγκο αέρα που απαιτεί κάθε χώρος στο κτίριο. Αφού καθοριστεί αυτό, πρέπει να υπολογιστεί ο αριθμός και ο τύπος των εξόδων σε κάθε χώρο για να παρέχεται ο απαιτούμενος όγκος αέρα. Οι περιορισμοί σχεδιασμού κτιρίου πρέπει επίσης να ληφθούν υπόψη. Θέματα όπως η περιορισμένη απόσταση μεταξύ της οροφής και της οροφής σε ένα υπάρχον κτίριο ενδέχεται να απαιτούν τροποποιήσεις σε μια βέλτιστη διάταξη αγωγών. Άλλοι παράγοντες που επηρεάζουν το σχεδιασμό του αγωγού περιλαμβάνουν τον βαθμό δυσκολίας που εμπλέκεται στην εγκατάσταση καθώς και την εύκολη πρόσβαση σε αποσβεστήρες, φίλτρα και χειριστήρια συστήματος.
Μια καλά σχεδιασμένη διάταξη αγωγών είναι συνήθως ευθύνη του εργολάβου Θέρμανσης, Αερισμού και Κλιματισμού (HVAC). Σε ορισμένες περιπτώσεις, ωστόσο, οι διαχειριστές κτιρίων, οι σχεδιαστές βιομηχανικών εγκαταστάσεων, ακόμη και οι ιδιοκτήτες σπιτιού μπορεί να χρειαστεί να τροποποιήσουν το σύστημα αγωγών για να εξαλείψουν τις ατέλειες και να αντιμετωπίσουν τις μεταβαλλόμενες ανάγκες HVAC. Αυτές οι τροποποιήσεις μπορεί να είναι απαραίτητες επειδή ο αρχικός σχεδιασμός είναι πολύ δαπανηρός για να εφαρμοστεί λόγω πολύπλοκων μεταβάσεων ή εξειδικευμένων, δαπανηρών εξαρτημάτων.
Παραδοσιακά, οι εργολάβοι HVAC και λαμαρίνας έχουν χρησιμοποιήσει μια μηχανική συσκευή που ονομάζεται nomoraph για να καθορίσουν το μέγεθος του αγωγού. Είναι εύκολο στη χρήση και παρέχει γρήγορο υπολογισμό των βέλτιστων διαστάσεων είτε για στρογγυλούς είτε για ορθογώνιους αγωγούς. Το λογισμικό, ωστόσο, παρέχει στον σχεδιαστή περισσότερες πραγματικές μεθόδους υπολογισμού του βέλτιστου μεγέθους και δρομολόγησης του αγωγού και μπορεί να παράγει μια εκτίμηση του κόστους υλικού και εργασίας. Όταν προκύπτουν προβλήματα ροής αέρα με ένα σύστημα HVAC, κάποιο λογισμικό μπορεί να αναλύσει και να προτείνει τροποποιήσεις στην υπάρχουσα διάταξη του αγωγού προσομοιώνοντας το τρέχον σύστημα.
Το πιο προηγμένο λογισμικό διάταξης αγωγών είναι ικανό να εισάγει δεδομένα από σχέδια σχεδίασης με τη βοήθεια υπολογιστή (CAD), ελαχιστοποιώντας έτσι τα δεδομένα που πρέπει να εισαχθούν στο λογισμικό διαστασιολόγησης και διάταξης αγωγών. Οι περισσότεροι εκδότες του λογισμικού καθιστούν τα προγράμματα συμβατά με προγράμματα σχεδίασης που βασίζονται σε autoCAD. Θα πρέπει να σημειωθεί ότι, αν και τα προγράμματα CAD μπορούν να βοηθήσουν στο σχεδιασμό του συνολικού συστήματος HVAC, δεν υποκαθιστούν την εμπειρία και την κρίση ενός σχεδιαστή ή μηχανικού HVAC.