Ο κύριος ενδοκρινικός αδένας είναι ένας άλλος τρόπος αναφοράς στη μικροσκοπική υπόφυση στο μπάσο του κρανίου, όπου συναντά τη σπονδυλική στήλη. Από τους οκτώ τύπους αδένων που παράγουν ορμόνες στο σώμα, αυτός ο ενδοκρινικός αδένας λαμβάνει τις εντολές του απευθείας από τον κεντρικό υποθάλαμο του εγκεφάλου. Όταν η υπόφυση λαμβάνει αυτές τις ορμονικές εκκρίσεις από τον υποθάλαμο, με τη σειρά της απελευθερώνει τον ίδιο αριθμό ορμονών για να ελέγξει τους άλλους αδένες και τις διάσπαρτες εκκρίσεις τους σε όλο το σώμα.
Η πρώτη λέξη στον κύριο ενδοκρινικό αδένα μπορεί να είναι μια μεγάλη παραπλανητική. Στην πραγματικότητα είναι ο υποθάλαμος που είναι ο κύριος αδένας της ενδορφίνης, καθώς εκκρίνει επίσης ορμονικά σήματα που οδηγούν μέσω της λεγόμενης υποφυσιακής πυλαίας αρτηρίας στην υπόφυση, η οποία παράγει αυτό που λέγεται χημικά για τους άλλους αδένες. Επιπλέον, ο υποθάλαμος εκκρίνει μια άλλη ορμονική ένωση – σωματοστατίνη, η οποία αναγκάζει την υπόφυση να αναστείλει την παραγωγή της ανθρώπινης αυξητικής ορμόνης.
Ο κύριος ενδοκρινικός αδένας που συνδέεται απευθείας με τον υποθάλαμο είναι κατασκευασμένος από τρία διαφορετικά εργοστάσια, που ονομάζονται λοβοί, τα οποία παράγουν διαφορετικές ορμόνες. Η ωκυτοκίνη για την τόνωση του τοκετού και η αντιδιουρητική ορμόνη για την αύξηση του νερού στην κυκλοφορία του αίματος παράγονται από τον οπίσθιο λοβό. Μια ορμόνη για τη ρύθμιση του τόνου του δέρματος και της χρωστικής παράγεται από τον ενδιάμεσο λοβό της υπόφυσης. Το μεγαλύτερο μέρος του έργου όμως πέφτει στον πρόσθιο λοβό: η προλακτίνη για να ξεκινήσει η γαλουχία, η αυξητική ορμόνη και άλλες ενώσεις για την τόνωση της επίφυσης, των νεφρών, του θυρεοειδούς, του παραθυρεοειδούς και των αναπαραγωγικών αδένων.
Συνολικά, οι ορμόνες σήματος αποστέλλονται από τον κύριο ενδοκρινικό αδένα για να προκαλέσουν διαφορετική δραστηριότητα που απαιτείται για τη ζωή. Οι ορμόνες που αποστέλλονται στις ωοθήκες ή στους όρχεις, για παράδειγμα, ενεργοποιούν την παραγωγή οιστρογόνων, προγεστερόνης και άλλων εκκρίσεων για την ανάπτυξη και την αναπαραγωγή των γυναικών, καθώς και την τεστοστερόνη και άλλα ανδρογόνα που είναι υπεύθυνα για την αναπαραγωγή των ανδρών. Με παρόμοιο τρόπο, για τον έλεγχο του θυρεοειδούς στο λαιμό, ο κύριος ενδοκρινικός αδένας λαμβάνει μια ορμόνη απελευθέρωσης θυρεοτροπίνης από τον υποθάλαμο, στη συνέχεια παράγει και στέλνει ένα ορμονικό μήνυμα στον θυρεοειδή αδένα. Αυτός ο αδένας τότε ενεργοποιείται για να κάνει τις θυρεοειδικές ορμόνες υπεύθυνες για διάφορες ζωτικές σωματικές λειτουργίες, από τη ρύθμιση του αίματος και της καρδιάς έως τη διατήρηση των μυών και την πέψη των τροφών.
Αν και δεν είναι τεχνικά αδένας, το πάγκρεας πίσω από το στομάχι έχει μερικές σημαντικές αδενικές λειτουργίες. Ένα από τα δύο μέρη αυτού του οργάνου παράγει ορμόνες. Το ενδοκρινές πάγκρεας παράγει ορμόνες όπως η ινσουλίνη, η οποία διατηρεί το σωστό επίπεδο σακχάρου στο σώμα. Το άλλο μέρος, που ονομάζεται εξωκρινές πάγκρεας, καθιστά τα ένζυμα ζωτικής σημασίας για την υγιή πέψη.