Τα κυψελιδικά μακροφάγα είναι κύτταρα που βρίσκονται στους πνεύμονες και αποτελούν μέρος του ανοσοποιητικού συστήματος. Τα μακροφάγα είναι φαγοκύτταρα, που σημαίνει ότι είναι σε θέση να προσλάβουν και να αφομοιώσουν νεκρά ή κατεστραμμένα κύτταρα και δυνητικά επιβλαβείς ουσίες όπως βακτήρια ή τοξικά σωματίδια. Σε αντίθεση με άλλα μακροφάγα, εκτίθενται άμεσα στο περιβάλλον έξω από το σώμα, λόγω της θέσης τους στην επένδυση των πνευμόνων. Εκεί, βοηθούν στην πρόληψη λοιμώξεων αφαιρώντας τους μικροοργανισμούς πριν εισέλθουν στην αναπνευστική κυκλοφορία. Καθαρίζουν επίσης αλλεργικές και τοξικές ουσίες από τους εναέριους χώρους στους πνεύμονες.
Τα ανθρώπινα κυψελιδικά μακροφάγα είναι τα κύρια φαγοκύτταρα σε αυτό που ονομάζεται έμφυτο ανοσοποιητικό σύστημα, το οποίο είναι η πρώτη γραμμή άμυνας του οργανισμού έναντι επιβλαβών μικροβίων και τοξικών ουσιών. Τα κυψελιδικά μακροφάγα είναι σε θέση να αντιμετωπίσουν τον μικρό αριθμό βακτηρίων και ιών που συνήθως εισπνέονται καθημερινά. Καταβροχθίζουν τους μικροοργανισμούς και τους καταστρέφουν, και επίσης εκκρίνουν ουσίες που επιτίθενται στα μικρόβια. Εάν μεγαλύτερος αριθμός μικροοργανισμών εισβάλει στους εναέριους χώρους, τα κυψελιδικά μακροφάγα είναι σε θέση να παράγουν ουσίες που προκαλούν μια φλεγμονώδη απόκριση, προσελκύοντας άλλα κύτταρα του ανοσοποιητικού στους πνεύμονες.
Εκτός από την έναρξη της φλεγμονής για την καταπολέμηση της νόσου, το ανθρώπινο κυψελιδικό μακροφάγο εμπλέκεται επίσης στην επίλυση αυτής της φλεγμονής. Μια κυτταρική σειρά κυψελιδικών μακροφάγων μπορεί να παράγει διαφορετικούς τύπους κυψελιδικών μακροφάγων, που αναφέρονται ως κύτταρα Μ1 και Μ2, τα οποία πιστεύεται ότι έχουν αντίθετες λειτουργίες. Το Μ1 είναι το κύτταρο που ασχολείται περισσότερο με τη φλεγμονή, ενώ το Μ2 έχει περισσότερο αντιφλεγμονώδη δράση. Διαφορετικές καταστάσεις μπορεί να οδηγήσουν σε μεγαλύτερο ή λιγότερο αριθμό κάθε τύπου κυττάρου που παράγεται.
Κατά την αντιμετώπιση μιας λοίμωξης, η φλεγμονώδης απόκριση οδηγεί στο να πεθαίνουν λευκά αιμοσφαίρια γνωστά ως ουδετερόφιλα και να συγκεντρώνονται στους πνευμονικούς εναέριους χώρους. Τα περιεχόμενα των κυττάρων αυτών των ουδετερόφιλων θα μπορούσαν να είναι επιβλαβή εάν διαρρεύσουν. Ως μέρος της αντιφλεγμονώδους λειτουργίας τους, τα κυψελιδικά μακροφάγα είναι σε θέση να απομακρύνουν τα νεκρά ουδετερόφιλα πριν αυτά αποικοδομηθούν και απελευθερώσουν το περιεχόμενό τους στους πνεύμονες.
Όταν οι άνθρωποι αναπτύσσουν πνευμονιοκοκκική πνευμονία, παίζουν ρόλο τόσο η φλεγμονώδης όσο και η αντιφλεγμονώδης δράση των κυψελιδικών μακροφάγων. Μια τεράστια φλεγμονώδης απόκριση οδηγεί στο γέμισμα των εναέριων χώρων των πνευμόνων με υγρό και ουδετερόφιλα, αλλά, χάρη στη δράση των κυψελιδικών μακροφάγων, αυτοί οι χώροι καθαρίζονται ξανά χωρίς τραυματισμό στους πνεύμονες. Η πνευμονιοκοκκική πνευμονία μπορεί να αντιμετωπιστεί με τη χρήση αντιβιοτικών ή μπορεί να προληφθεί με εμβόλιο.