Τα βοοειδή είναι αγελάδες που δεν μπορούν να περπατήσουν λόγω τραυματισμού ή ασθένειας. Πολλοί ειδικοί στη γεωργία συνιστούν τη σφαγή των βοοειδών ως ανθρωπιστική απάντηση στην κατάστασή τους. Οι αγελάδες είναι οι πιθανές πηγές ασθένειας των τρελών αγελάδων, μια θανατηφόρα ασθένεια που οι ειδικοί λένε ότι μπορεί να μεταδοθεί σε ανθρώπους που καταναλώνουν μολυσμένο κρέας. Το 2008, το Αμερικανικό Ινστιτούτο Κρέατος, η Εθνική Ένωση Κρέατος και η Εθνική Ένωση Γάλακτος υπέβαλαν αίτηση στο Υπουργείο Γεωργίας των Ηνωμένων Πολιτειών (USDA) να θεσπίσει κυβερνητική απαγόρευση της πώλησης κρέατος από αγελάδες που έχουν πέσει για ανθρώπινη κατανάλωση, αλλά μέχρι στιγμής δεν έχει υιοθετηθεί ολοκληρωτική απαγόρευση.
Ο τραυματισμός μιας αγελάδας μπορεί να την κάνει να γίνει downer ή splitter. Συχνά, τα προβλήματα γέννα είναι η κύρια αιτία. Εάν μια αγελάδα δυσκολεύεται να γεννήσει εξαιτίας ενός μεγάλου μοσχαριού ή κακώς τοποθετημένου μοσχαριού, μπορεί να προκαλέσει «σχίσιμο» ή αδυναμία χρήσης των πίσω ποδιών. Τα Downers μπορούν επίσης να προκληθούν από κατάγματα στα πόδια, τις περισσότερες φορές από την είσοδο σε μια τρύπα σκύλου γκοφέρ ή λιβάδι. Επιπλέον, τα δύσκολα ταξίδια στο σφαγείο μπορούν να αφήσουν τις αγελάδες ανάπηρες. Εάν παραμεληθεί η σωστή διατροφή, οι αγελάδες γίνονται πιο επιρρεπείς σε έλλειψη ασβεστίου και είναι πιο πιθανό να έχουν κατάγματα ή σπασμένα οστά. Οι αγελάδες μπορούν συχνά να αναρρώσουν από αυτούς τους τραυματισμούς, ιδιαίτερα αν είναι σε θέση να καθίσουν ακόμα, αλλά οι περισσότερες σφάζονται.
Πολλές ασθένειες μπορούν να προκαλέσουν χαμηλότερα βοοειδή, ειδικά αν δεν αντιμετωπιστούν. Οι αγελάδες που πάσχουν από μαστίτιδα, λοιμώξεις της μήτρας, καρκίνο ή χρόνια πνευμονία μπορεί σύντομα να γίνουν υποτονικές. Μελέτες δείχνουν ότι τα επίπεδα καρκίνου αυξάνονται μεταξύ των βοοειδών και ορισμένοι ειδικοί προτείνουν ότι ένας παράγοντας που συμβάλλει μπορεί να είναι η ανασυνδυασμένη αυξητική ορμόνη βοοειδών (rBGH), η οποία χρησιμοποιείται για την αύξηση της γαλακτοπαραγωγής. Μετά από αυτές τις πληροφορίες, πολλές χώρες έχουν απαγορεύσει εντελώς τη χρήση του rBGH.
Τον Ιανουάριο του 2008, η Ανθρωπιστική Εταιρεία των Ηνωμένων Πολιτειών κυκλοφόρησε βίντεο που δείχνουν γραφικές απεικονίσεις της κακοποίησης των μικρότερων βοοειδών. Τα βίντεο, που τραβήχτηκαν στο σφαγείο του Τσίνο της Καλιφόρνια, έδειχναν άρρωστες και αδυνατισμένες αγελάδες να υφίστανται ηλεκτροπληξία και να ψεκάζονται με πίδακες νερού υψηλής ισχύος από τους υπαλλήλους. Επιπλέον, το βίντεο προκάλεσε σοβαρές ανησυχίες ότι άρρωστα βοοειδή χρησιμοποιούνται για ανθρώπινη κατανάλωση. Ο ισχύων κανονισμός της αμερικανικής κυβέρνησης επιτρέπει τη χρήση κρεάτων μόνο εάν το ζώο έχει επιθεωρηθεί από κτηνίατρο για να διασφαλιστεί ότι το πρόβλημα προκαλείται από σπασμένα οστά και όχι από ασθένεια. Παρά τις προσπάθειες των Κογκρέσσων, των ομάδων για τα δικαιώματα των ζώων και των αξιωματούχων της βιομηχανίας κρέατος να αλλάξουν τους κανονισμούς και να απαγορεύσουν το κρέας από οποιαδήποτε αγελάδα, η USDA εξακολουθεί να διατηρεί την αρχική της πολιτική.
Ο φόβος του κρέατος από μολυσμένα βοοειδή έγκειται κυρίως στην πιθανή μετάδοση ασθενειών βοοειδών στον άνθρωπο μέσω κατανάλωσης κρέατος. Η νόσος των τρελών αγελάδων, το κοινό όνομα για τη σπογγώδη εγκεφαλίτιδα των βοοειδών, είναι μια θανατηφόρα ασθένεια που προκαλεί τον εκφυλισμό του εγκεφάλου και του νωτιαίου μυελού. Μελέτες δείχνουν ότι η ασθένεια είναι μεταδοτική από ανθρώπους που καταναλώνουν άρρωστο κρέας. Από το 2008, υπήρχαν περίπου 200 επιβεβαιωμένα κρούσματα μόλυνσης από ανθρώπους παγκοσμίως.
Η εξασφάλιση των κατάλληλων συνθηκών διαβίωσης, η διατροφή και η άμεση ιατρική περίθαλψη για κάθε άρρωστη αγελάδα είναι απαραίτητη για τη διατήρηση της υγείας τους. Ο πυρετός του γάλακτος, ένα σύνδρομο χαμηλού ασβεστίου, πιστεύεται ότι ευθύνεται για σχεδόν το 40% του συνόλου των βοοειδών. Ορισμένες μελέτες έχουν δείξει ότι από εκείνες τις αγελάδες που έλαβαν θεραπεία εντός έξι ωρών από την έναρξη των συμπτωμάτων του πυρετού του γάλακτος, μόνο το 2% έγινε μόνιμος βοοειδής. Πολλοί ειδικοί πιστεύουν ότι ο καλύτερος τρόπος για να αποφύγετε τα βοοειδή είναι η κατάλληλη προληπτική φροντίδα και προφύλαξη.