Η εκπαίδευση πτήσης με όργανα είναι εκπαίδευση αεροπορίας που βοηθά τους πιλότους να λάβουν βαθμολογία οργάνων, μια πιστοποίηση που δείχνει ότι μπορούν να πλοηγηθούν χρησιμοποιώντας όργανα πτήσης και μόνο, χωρίς να χρειάζεται να κοιτάξουν έξω από το πιλοτήριο. Το ποσό της εκπαίδευσης που απαιτείται για την απόκτηση βαθμολογίας οργάνων ποικίλλει, ανάλογα με τους κανονισμούς που καθορίζονται από τις αεροπορικές αρχές στη χώρα όπου ο πιλότος επιθυμεί να λάβει άδεια. Στις Ηνωμένες Πολιτείες, χρειάζονται περίπου 100 ώρες εκπαίδευσης πτήσης με όργανα σε αεροσκάφη και με προσομοιωτές για την απόκτηση βαθμολογίας οργάνου.
Με βαθμολογία οργάνων, οι πιλότοι έχουν την επιλογή να πετούν σύμφωνα με τους κανόνες πτήσης με όργανα (IFR), πράγμα που σημαίνει ότι οι τοπικές αεροπορικές αρχές έχουν αποφασίσει ότι οι συνθήκες είναι αρκετά επικίνδυνες ώστε οι πιλότοι να πρέπει να είναι σε θέση να χρησιμοποιούν αεροσκάφη για ασφαλή πλοήγηση. Αντίθετα, χωρίς βαθμολογία οργάνων, οι πιλότοι μπορούν να πετάξουν μόνο υπό κανόνες οπτικής πτήσης (VFR), όταν η ορατότητα είναι αρκετά καλή για να πετάξει χωρίς όργανα. Συνήθως, οι πιλότοι πρέπει επίσης να έχουν βαθμολογία οργάνων για να πετάξουν πάνω από ένα ορισμένο ύψος. Η εκπαίδευση πτήσης με όργανα παρέχει στους πιλότους μεγαλύτερη ευελιξία.
Κατά τη διάρκεια της εκπαίδευσης πτήσης με όργανα, οι πιλότοι εξοικειώνονται με τα όργανα που χρησιμοποιούνται στην αεροπορία, όπως το υψόμετρο, ο δείκτης κατεύθυνσης, ο κάθετος δείκτης ταχύτητας, ο τεχνητός ορίζοντας και ο δείκτης ταχύτητας αέρα. Οι πιλότοι μαθαίνουν τι κάνει κάθε όργανο, πώς να διαβάζουν σωστά κάθε όργανο και πώς να εντοπίζουν κοινά σφάλματα με τα όργανα της αεροπορίας. Στη συνέχεια, μεταφέρονται σε πραγματικές ή προσομοιωμένες μετεωρολογικές συνθήκες οργάνων στις οποίες οι πιλότοι αναμένεται να πλοηγηθούν με όργανα, δίνοντάς τους την ευκαιρία να χρησιμοποιήσουν την εκπαίδευσή τους.
Για να λάβει εκπαίδευση πτήσης με όργανα, ο πιλότος πρέπει να κατέχει άδεια χειριστή και οι εκπαιδευτές συχνά προτιμούν να συνεργάζονται με μαθητές που έχουν πτητική εμπειρία, ώστε να είναι εξοικειωμένοι με τη λειτουργία των αεροσκαφών υπό VFR. Υπάρχουν πολλές επιλογές κατάρτισης, συμπεριλαμβανομένων εκπαιδευτών που θα ταξιδέψουν σε πιλότους για να παρέχουν σχολές διδασκαλίας ή πτήσης στις οποίες μπορούν να εγγραφούν οι πιλότοι για εντατική εκπαίδευση. Η εκπαίδευση θα παρέχει στον πιλότο τις ώρες που απαιτούνται από το νόμο, μαζί με τις δεξιότητες που απαιτούνται για να περάσει τις δοκιμές που διεξάγονται από τις αρχές προκειμένου να καθοριστεί εάν ο πιλότος πρέπει ή όχι να λάβει βαθμολογία οργάνου.
Η εκπαίδευση πτήσης με όργανα έχει σχεδιαστεί για να διασφαλίζει ότι οι πιλότοι είναι άνετοι και ικανοί όταν πετούν υπό IFR. Ακόμη και μετά την εκπαίδευση, οι πιλότοι μπορούν να αποπροσανατολιστούν σε κακές καιρικές συνθήκες και μπορούν ακόμα να κάνουν κακές επιλογές. Τα λάθη είναι ιδιαίτερα συνηθισμένα μεταξύ των πιλότων που μόλις μαθαίνουν ή μόλις πιστοποιούνται, με την εμπειρία να εκθέτει σταδιακά τους πιλότους σε μια μεγάλη ποικιλία καταστάσεων και συνθηκών που τους καθιστούν πιο εξειδικευμένους και σίγουρους στην πτήση.