Μία από τις πιο προφανείς διαφορές μεταξύ κονιάκ και ουίσκι είναι ότι οι κατασκευαστές κονιάκ χρησιμοποιούν σταφύλια και οι κατασκευαστές ουίσκι χρησιμοποιούν κόκκους. Αν και και οι δύο διαδικασίες χρησιμοποιούν ζύμωση για τη δημιουργία των υγρών, οι κατασκευαστές κονιάκ χρησιμοποιούν μια διαδικασία διπλής απόσταξης. Οι κυβερνητικοί κανονισμοί απαιτούν από τους κατασκευαστές κονιάκ να δημιουργούν το ποτό αποκλειστικά στην περιοχή του Cognac στη Γαλλία, χρησιμοποιώντας μόνο ορισμένα είδη σταφυλιών. Οι κατασκευαστές ουίσκι είναι ελεύθεροι να φτιάχνουν ουίσκι σε πολλές χώρες, ενώ ορισμένες χώρες, όπως η Ιρλανδία και οι Ηνωμένες Πολιτείες, φημίζονται για το ουίσκι τους.
Όπως συμβαίνει με πολλά τρόφιμα, το κονιάκ και το ουίσκι έχουν μακρά ιστορία ανάπτυξης και τελειοποίησης. Το κονιάκ διαφέρει από τα άλλα λικέρ με βάση τα φρούτα, επειδή οι οινοπαραγωγοί το αποστάζουν διπλά και το παλαιώνουν σε δρύινα βαρέλια. Η διπλή απόσταξη, που ονομάζεται απόσταξη charentaise, δημιουργεί ένα λιγότερο τραχύ ποτό. Το κονιάκ που αποστέλλεται σε δρύινα βαρέλια ή βαρέλια, είναι πιο γευστικό και πιο απαλό λόγω του χρόνου που κάθεται στα βαρέλια στα πλοία και στην αποθήκευση.
Ομοίως, οι Ιρλανδοί και οι Σκωτσέζοι έπρεπε να αυτοσχεδιάζουν όταν έφτιαχναν ποτό και δημιούργησαν ουίσκι. Η έλλειψη σταφυλιών στα νησιά οδήγησε στη δημιουργία του ποτού με βάση τα δημητριακά. Χρησιμοποίησαν τους κόκκους που ήταν διαθέσιμοι και με την πάροδο του χρόνου η διαδικασία βελτιώθηκε ώστε να συμπεριλάβει την παλαίωση σε βαρέλια. Η παλαίωση του υγρού που έχει υποστεί ζύμωση σε δρύινα βαρέλια είναι κοινή για το κονιάκ και το ουίσκι. Σε ορισμένες περιοχές, συμπεριλαμβανομένης της Ιρλανδίας, οι άνθρωποι χρησιμοποιούν τη λέξη ουίσκι. στις Ηνωμένες Πολιτείες και σε άλλες περιοχές, το ποτό ονομάζεται ουίσκι.
Οι κατασκευαστές κονιάκ ζυμώνουν το χυμό σταφυλιού για περίπου πέντε ημέρες πριν από την πρώτη απόσταξη. Μετά τη δεύτερη απόσταξη, οι παρασκευαστές σφραγίζουν το κονιάκ σε βαρέλια. Συνήθως, αναφέρουν την ηλικία του κονιάκ ως Very Special (VS), που σημαίνει τουλάχιστον δύο χρόνια στο βαρέλι. Πολύ Special Old Pale (VSOP), που είναι τέσσερα χρόνια ή περισσότερο. ή Extra Old (XO), το οποίο αποθηκεύεται στο βαρέλι για περισσότερα από έξι χρόνια. Ορισμένοι κατασκευαστές κονιάκ παλαιώνουν τα προϊόντα τους για περισσότερα από 20 χρόνια.
Αντίθετα, οι κατασκευαστές ουίσκι αποστάζουν τον πολτό κόκκων μόνο μία φορά και αναφέρουν την ηλικία σε χρόνια. Για παράδειγμα, μια ετικέτα μπορεί να λέει ουίσκι 12 ετών. Μερικές από τις κοινές ηλικίες είναι πέντε, 10 και 15 ετών. Μια ομοιότητα μεταξύ του κονιάκ και του ουίσκι είναι ότι οι γνώστες κρίνουν την ηλικία του καθενός από τον χρόνο που περνά στο βαρέλι, όχι σε ένα μπουκάλι.
Μια άλλη διαφορά μεταξύ κονιάκ και ουίσκι είναι ότι οι κατασκευαστές κονιάκ χρησιμοποιούν το χυμό μόνο επιλεγμένων σταφυλιών, αλλά όχι άλλων φρούτων. Γενικά, οι κατασκευαστές ουίσκι χρησιμοποιούν κριθάρι ως βάση, αλλά μπορούν να χρησιμοποιήσουν και άλλους κόκκους. Αυτοί οι κόκκοι περιλαμβάνουν τη σίκαλη και τη βυνοποιημένη σίκαλη, το σιτάρι και το καλαμπόκι. Συχνά οι κατασκευαστές ουίσκι συνδυάζουν κόκκους, όπως στο ουίσκι bourbon, που περιέχει το καλαμπόκι ως περισσότερο από το μισό του κόκκου.