Το θέμα της αποτελεσματικότητας της βανκομυκίνης για τον MRSA (ανθεκτικός στη μεθικιλλίνη σταφυλόκοκκος) εξελίσσεται. Ακριβώς όπως ορισμένα στελέχη σταφυλόκοκκου ανέπτυξαν αντοχή σε πολλά κοινά αντιβιοτικά, είναι πλέον σαφές ότι αυτά τα μικρόβια συνεχίζουν να αλλάζουν. Με άλλα λόγια, αναπτύσσουν νέες αντιστάσεις στις νεότερες θεραπείες και πλέον υπάρχουν ορισμένα στελέχη MRSA που είναι επίσης ανθεκτικά στη βανκομυκίνη. Με το όνομα VR-MRSA, αυτά μπορεί να αλλάξουν τα διαθέσιμα αντιβιοτικά για τη θεραπεία με MRSA στο μέλλον, αν και προς το παρόν, η βανκομυκίνη εξακολουθεί να θεωρείται ως ένα από τα πιο αποτελεσματικά φάρμακα και συχνά ως ένα από τα φάρμακα έσχατης ανάγκης όταν το MRSA δεν ανταποκρίνεται σε άλλους τύπους της θεραπείας.
Κοντά στη δεκαετία του 2010, υπήρξαν πολυάριθμες κλινικές δοκιμές που υποδηλώνουν την αποτελεσματικότητα της βανκομυκίνης για το MRSA. Σε γενικές γραμμές, τέτοιες δοκιμές δείχνουν ότι το 80% ή περισσότερες των περιπτώσεων μπορεί να αντιμετωπιστούν αποτελεσματικά με αυτό το αντιβιοτικό. Ένα άλλο φάρμακο που είναι επίσης σχεδόν εξίσου αποτελεσματικό είναι η τιγεκυκλκίνη. Και οι δύο έχουν περίπου την ίδια πιθανότητα παρενεργειών, με την τιγεκυκλίνη να τείνει να δημιουργεί μεγαλύτερη ναυτία. Υπάρχουν άλλα φάρμακα που μπορούν να χρησιμοποιηθούν όταν αυτοί οι συνδυασμοί αποτύχουν και η επιτυχής θεραπεία μπορεί τελικά να εξαρτάται από τον τύπο του στελέχους. Εάν υπάρχει VR MRSA, η βανκομυκίνη είναι ελάχιστη χρήσιμη.
Ενώ η βανκομυκίνη για το MRSA μπορεί να είναι αποτελεσματική, δεν είναι πάντα το πρώτο φάρμακο επιλογής. Πρώτον, οι μορφές MRSA που αποκτήθηκαν από την κοινότητα μπορεί να μην αντιμετωπίζονται καν με αντιβιοτικά ανά πάσα στιγμή. Μερικές φορές αρκεί απλώς η αποστράγγιση τυχόν αποστημάτων και η διατήρησή τους καθαρά για την επίλυση μιας λοίμωξης από MRSA. Εναλλακτικά, ένα αντιβιοτικό που δεν βασίζεται στη μεθικιλλίνη ή οποιοδήποτε άλλο φάρμακο στο οποίο το MRSA μπορεί να μην έχει αντοχή θα μπορούσε να εξεταστεί πριν από τη βανκομυκίνη.
Ο λόγος για τον οποίο η βανκομυκίνη για το MRSA συχνά αποκαλείται θεραπεία έσχατης ανάγκης είναι επειδή υπάρχουν καλοί λόγοι για να μην τη χρησιμοποιήσετε επίσης. Η υπερβολική χρήση του έχει οδηγήσει σε άλλα υπερβακτηρίδια, όπως οι ανθεκτικοί στη βανκομυκίνη εντερόκοκκοι (VRE), οι οποίοι μπορούν να προκαλέσουν δύσκολες στομαχικές λοιμώξεις που είναι εξαιρετικά δύσκολο να επιλυθούν. Η αποφυγή δημιουργίας περισσότερων VRE ή VR MRSA προκαλεί αυτήν την ανησυχία. Επιπλέον, οι γιατροί δεν θέλουν να μολύνουν ασθενείς με VRE θεραπεύοντας τους από MRSA, το οποίο μπορεί να εμφανιστεί σε ιατρικά ευάλωτους ασθενείς. Αυτό σημαίνει ότι, εκτός εάν οι γιατροί το κρίνουν απολύτως απαραίτητο, μπορεί να αναζητήσουν πρώτα άλλα φάρμακα προτού στραφούν στη χρήση βανκομυκίνης για το MRSA.
Ο καθορισμός της καλύτερης θεραπείας για ανθεκτικά στα αντιβιοτικά μικρόβια είναι πάντα μια λεπτή ισορροπία. Το σωστό φάρμακο θα πρέπει να θεραπεύει αποτελεσματικά την πάθηση, να διατρέχει τον μικρότερο κίνδυνο επικίνδυνων παρενεργειών και να έχει τη χαμηλότερη τάση να προκαλέσει περαιτέρω εξέλιξη ενός μικροβίου και να γίνει πιο δύσκολο να αντιμετωπιστεί στο μέλλον. Η βανκομυκίνη για MRSA εξυπηρετεί πραγματικά μόνο μία από αυτές τις κατηγορίες: μπορεί να θεραπεύσει αποτελεσματικά το MRSA υπό την προϋπόθεση ότι δεν υπάρχει VR MRSA. Έχει παρενέργειες και μπορεί να προκαλέσει την εξέλιξη των βακτηρίων MRSA, επομένως δεν μπορεί τελικά να είναι η καλύτερη επιλογή σε όλες τις περιστάσεις. Η εύρεση ενός φαρμάκου που είναι η καλύτερη επιλογή αποδεικνύεται πολύ δύσκολη, αν και πολλές μελέτες συνεχίζονται για αυτό το θέμα.