Αν και το ψάρι είναι μια εξαιρετικά υγιεινή, χαμηλή σε θερμίδες πηγή πρωτεΐνης που περιέχει θρεπτικά ωμέγα-3 λιπαρά οξέα, είναι πιθανό να καταναλωθεί πάρα πολύ από αυτό. Το πρώτο πράγμα που πρέπει να λάβετε υπόψη είναι ότι, δεδομένου ότι η υγιεινή διατροφή σημαίνει μια ισορροπημένη, ελεγχόμενη από τις μερίδες διατροφή, δεν συνιστάται η υπερβολική κατανάλωση ψαριού ή οποιασδήποτε άλλης τροφής. Από εκεί και πέρα, τα υψηλά επίπεδα υδραργύρου είναι ο κύριος λόγος για τη μη κατανάλωση μεγάλων ποσοτήτων ψαριών.
Πολλοί ειδικοί στον τομέα της υγείας προειδοποιούν ότι η υπερβολική κατανάλωση ψαριών μπορεί να δημιουργήσει συσσώρευση τοξινών υδραργύρου στο σώμα. Ο υδράργυρος είναι ένα μεταλλικό στοιχείο που είναι τοξικό σε υψηλές δόσεις. Εισέρχεται στην παροχή νερού από ίχνη ιατρικών αποβλήτων ή σταθμών ηλεκτροπαραγωγής. Τα ψάρια που κολυμπούν σε αυτό το νερό στη συνέχεια μολύνονται με υδράργυρο.
Τα ψάρια μπορούν να είναι ένα καλό μέρος μιας ισορροπημένης διατροφής. Η αποφυγή των ψαριών πιστεύεται ότι θέτει τα άτομα σε κίνδυνο για προβλήματα εγκεφάλου, νεύρων και καρδιάς. Οι περισσότεροι ειδικοί στον τομέα της υγείας συνιστούν να αποφεύγεται η υπερβολική ποσότητα ψαριού, λόγω του κινδύνου υδραργύρου, αλλά να καταναλώνεται εβδομαδιαία σε περιορισμένες ποσότητες. Η συνιστώμενη ποσότητα των περισσότερων ψαριών και οστρακοειδών ανά ενήλικα την εβδομάδα είναι το πολύ 12 ουγγιές (340 g). Τα μεγαλύτερα ψάρια όπως ο τόνος, ο καρχαρίας, το λαβράκι, ο ξιφίας και το σκουμπρί θα πρέπει να περιορίζονται σε 6 ουγγιές (170 γραμμάρια) εβδομαδιαίως το πολύ.
Οι έγκυες γυναίκες, οι θηλάζουσες μητέρες και τα μικρά παιδιά θα πρέπει να αποφεύγουν τις μεγαλύτερες ποικιλίες ψαριών. Αντίθετα, θα πρέπει να τρώνε άλλα είδη ψαριών και θαλασσινών σε μικρές ποσότητες. Τα τοξικά επίπεδα υδραργύρου λέγεται ότι βρίσκονται κυρίως στα μεγαλύτερα είδη ψαριών. Τα μωρά, τα μικρά παιδιά και οι γυναίκες σε αναπαραγωγική ηλικία είναι ιδιαίτερα ευαίσθητα στις πιθανές βλαβερές συνέπειες του υδραργύρου. Εάν ένα άτομο από μια ομάδα χαμηλότερου κινδύνου πρόκειται να φάει τόνο, γενικά θεωρείται καλύτερο να επιλέγει τύπους ελαφριάς συσκευασίας σε κομμάτια, νερού αντί για εκδόσεις με λίπος ή λάδι.
Η δηλητηρίαση από υδράργυρο, πιθανώς από πηγές όπως η υπερβολική ποσότητα ψαριών, μπορεί να προκαλέσει γενετικές ανωμαλίες ή εγκεφαλική βλάβη. Τα συμπτώματα της δηλητηρίασης από υδράργυρο σε ενήλικες ή παιδιά περιλαμβάνουν ροζ ή κόκκινα μάγουλα και τα άκρα των δακτύλων, καθώς και απώλεια μαλλιών, δοντιών και νυχιών. Τα δερματικά εξανθήματα και οι βλάβες των οργάνων πιστεύεται επίσης ότι προκαλούνται από υψηλά επίπεδα υδραργύρου, όπως αυτά από υπερβολική ποσότητα ψαριού. Οι διαταραχές της όρασης, της ομιλίας και της ακοής έχουν επίσης συνδεθεί με δηλητηρίαση από υδράργυρο.
Ένα άλλο πρόβλημα που μπορεί να προκληθεί από την υπερβολική κατανάλωση ψαριών περιλαμβάνει την κατάποση αντιβιοτικών στα ψάρια. Τα αντιβιοτικά είναι φάρμακα που χορηγούνται στα ψάρια για τον έλεγχο βακτηριακών ασθενειών. Ενώ τα άγρια ψάρια μπορεί ακόμα να απορροφούν αντιβιοτικά από τα τοξικά απόβλητα στο νερό, τα ίχνη των φαρμάκων είναι πιο πιθανό να βρεθούν σε ψάρια εκτροφής. Περαιτέρω περιπλέκοντας το πρόβλημα είναι η έλλειψη κανονισμών δοσολογίας αντιβιοτικών στη βιομηχανία ιχθυοκαλλιέργειας σε ορισμένα μέρη του κόσμου. Η ιχθυοκαλλιέργεια περιλαμβάνει την εκτροφή ψαριών σε περιορισμένη περιοχή. Τα αντιβιοτικά χρησιμοποιούνται για να εμποδίσουν τα βακτήρια να εξαπλωθούν σε όλο το απόθεμα.