Debata o kawie i zdrowiu prawdopodobnie potrwa jeszcze długo. Początkowo badania sugerowały, że kawa nie była zbyt korzystna dla zdrowia człowieka, ale bardziej szczegółowe badania podważyły ten pomysł. Wydaje się, że zarówno Coffea arabica, jak i Coffea robusta zawierają związki, które mogą sprawić, że osoby pijące kawę będą zdrowsze. Pomimo obaw związanych ze związkami zawartymi w ziarnach arabiki, trochę naciąganym byłoby stwierdzenie, że są one niezdrowe.
Wczesne badania kawy, które wykazały, że jest zła dla konsumentów, często nie uwzględniały innych czynników. Wiele osób regularnie pijących kawę w tamtych czasach również paliło i piło, a czynności te były wyraźnie powiązane z problemami zdrowotnymi. Bliższe spojrzenie wykazało, że wiele problemów związanych z konsumpcją kawy wynikało w rzeczywistości z innych czynników.
Dwa sporne związki zawarte w kawie ziarnistej Arabica to Kahweol i Kafestol. Oba są związkami diterpenowymi i oba zostały powiązane z problemami zdrowotnymi. Kahweol wydaje się podnosić poziom enzymów wątrobowych. Kafestol powoduje wzrost złego cholesterolu i występuje zarówno w ziarnach arabiki, jak i robusty, chociaż arabika ma znacznie wyższe stężenie tej substancji. Najlepiej nie spożywać ani w nadmiarze, ale robienie kawy z filtrem usuwa większość tych związków, dzięki czemu kawa jest całkowicie bezpieczna do picia.
W rzeczywistości kawa ziarnista Arabica może być dobra dla ludzi. Odkryto, że osoby pijące kawę w Holandii i Japonii są mniej podatne na niektóre rodzaje nowotworów. Prawdopodobnie odpowiada za to wysoki poziom przeciwutleniaczy w kawie. Może również pomóc w zapobieganiu arytmiom serca, zmniejszaniu ubytków i zabijaniu bakterii. Wymagane są dalsze badania, ale wydaje się oczywiste, że korzyści płynące z kawy przewyższają potencjalne koszty, zwłaszcza gdy diterpeny są usuwane przez filtrowanie. Wiele z tych odkryć dotyczy zarówno ziaren Arabiki, jak i Robusty, ku uciesze ludzi, którzy wolą gatunki Robusty o większej zawartości kofeiny.
Kawa może jednak wywoływać migreny, przyczyniać się do wrzodów żołądka i podnosić ciśnienie krwi. W niektórych przypadkach lekarz może zalecić pacjentowi rozważenie zmniejszenia spożycia kawy lub przejście na wersję bezkofeinową. Osoby powinny zawsze stosować się do porad udzielanych przez pracownika służby zdrowia, ponieważ jest on bardziej świadomy problemów, które są specyficzne dla organizmu pacjenta.