Hiszpańska Inkwizycja była trybunałem kościelnym prowadzonym przez hiszpańską monarchię i powołanym w celu wykorzenienia heretyków i innych osób, które zagrażały statusowi Kościoła rzymskokatolickiego w Hiszpanii. Założona w 1478 r. hiszpańska inkwizycja została formalnie zniesiona dopiero w 1834 r. i jest jedną z najbardziej niesławnych z licznych inkwizycji prowadzonych w Europie. Szacuje się, że pod rządami hiszpańskiej inkwizycji zginęło co najmniej 2,000 osób, a niezliczona ilość innych była torturowana, poddawana straszliwym karom fizycznym i zmuszana do oddania całej swojej własności.
Ten okres w historii Hiszpanii był poprzedzony okresem, w którym Hiszpania była niezwykle zróżnicowana religijnie. Kiedyś chrześcijanie, muzułmanie i żydzi żyli w Hiszpanii stosunkowo spokojnie, wymieniając się pomysłami i informacjami oraz tworząc bogatą i żywą kulturę. Kiedy jednak monarchia hiszpańska rozpoczęła rekonkwistę terenów okupowanych przez Maurów, postrzegała to jako zagrożenie i starała się przywrócić katolicyzm jako dominującą religię w Hiszpanii.
Monarchowie Ferdynand II z Aragonii i Izabela I z Kastylii ustanowili inkwizycję hiszpańską, ustanawiając inkwizycję kierowaną przez rząd, a nie przez Kościół, co jest dość sprytnym posunięciem politycznym. Dokładne motywacje hiszpańskiej inkwizycji są nieco niejasne. Poza oczywistą chęcią przywrócenia katolicyzmu w Hiszpanii, monarchowie mogli mieć bardziej cyniczne motywy, takie jak chęć zagarnięcia własności osób skazanych przez inkwizycję i pilną potrzebę zmniejszenia politycznego znaczenia tzw. Conversos, osoby wyznania mojżeszowego i muzułmańskiego, które nawróciły się na chrześcijaństwo, często z powodu nacisków lub powodów politycznych.
Niezależnie od rozumowania hiszpańskiej inkwizycji, była ona zorganizowana podobnie jak formalna inkwizycja papieska. Inkwizytorzy wchodzili do miasta i po nabożeństwach wygłaszali oficjalne oświadczenie, zapraszając ludzi do spowiedzi lub denuncjacji. Po zidentyfikowaniu grupy przyznanych do winy lub zadenuncjowanych przestępców, byli oni stawiani przed sądem w formacie trybunału. Jedną z głównych wad hiszpańskiej inkwizycji z prawnego punktu widzenia jest to, że oskarżonym nie podano tożsamości ich oskarżycieli, a także często byli nieświadomi zarzutów, co uniemożliwiało im obronę. Byli również zobowiązani do składania zeznań, a odmowa złożenia zeznań traktowana była jako przyznanie się do winy.
Conversos, których często podejrzewano, że nie są prawdziwymi chrześcijanami, byli szczególnymi celami hiszpańskiej inkwizycji, ponieważ inkwizycja mogła tylko formalnie sądzić chrześcijan. Inkwizycja sądziła również ludzi za podejrzenie herezji i różne inne przestępstwa, z których wiele było jedynie abstrakcyjnie związanych z wiarą katolicką. Tortury były szeroko rozpowszechnione wśród trybunałów inkwizycyjnych, podobnie jak naciski, aby zachęcać obywateli do denuncjowania się nawzajem obietnicą nietykalności przed śledztwem. W przypadku skazania niektórym osobom oferowano możliwość pojednania z Kościołem, zwykle po odbyciu wyczerpującej kary fizycznej i utracie mienia. Inni skazani przestępcy zostali straceni.