Trójjedyny mózg odnosi się do hipotezy dotyczącej ewolucji i funkcji ludzkiego mózgu, którą po raz pierwszy zaproponował neurobiolog Paul D. MacLean w latach 1960. XX wieku. Zakłada ona, że mózg można podzielić na trzy części, zwane kompleksem gadów, kompleksem paleossaczy i kompleksem neossaków, które powstały sekwencyjnie w toku ewolucji i są powiązane z coraz bardziej zaawansowanymi formami myślenia. Obecnie uważa się ją za obaloną ze względu na późniejsze badania w neurologii, paleontologii i dziedzinach pokrewnych, chociaż zachowuje swoją obecność w kulturze popularnej.
Zgodnie z hipotezą trójjedynego mózgu, najstarszą i najbardziej podstawową częścią ludzkiego mózgu jest grupa skupisk nerwowych zwanych jądrami podstawnymi, które znajdują się poniżej mózgu. Nazywa się to kompleksem gadów, nazwanym tak, ponieważ przypuszcza się, że ta część trójjedynego mózgu wyewoluowała u odległych ewolucyjnych przodków ludzkości przed ssakami. W trójjedynym modelu mózgu kompleks gadów rządzi prymitywnymi instynktami, takimi jak agresja, dominacja i reakcja walki lub ucieczki.
Druga część, kompleks paleossaczy, obejmuje struktury w mózgu, które obecnie określa się mianem układu limbicznego. Obejmuje to ciało migdałowate, hipokamp i podwzgórze wraz z korą obręczy i częściami kory mózgowej. MacLean argumentował, że te struktury rządzą emocjami i zachowaniami, takimi jak reprodukcja, rodzicielstwo i karmienie. Zgodnie z hipotezą ta część mózgu wyewoluowała najpierw u wczesnych ssaków. MacLean był pierwszym neurobiologiem, który zidentyfikował układ limbiczny i jego znaczenie, a koncepcja ta jest nadal szeroko stosowana we współczesnej neuronauce, pomimo późniejszego zdyskredytowania hipotezy trójjedynego mózgu jako całości.
Trzecia część, zwana kompleksem neossaków, to kora nowa. Kora nowa jest częścią kory mózgowej występującej wyłącznie u ssaków. W trójjedynym modelu mózgu kompleks neossaków jest najnowszą częścią mózgu, która ewoluowała i jest odpowiedzialna za wyższe funkcje umysłowe, takie jak język i myślenie abstrakcyjne.
Zwoje podstawy są obecne u wszystkich kręgowców, a więc ich ewolucja prawdopodobnie znacznie poprzedza pojawienie się gadów. Podobnie, struktury mózgu zawarte w kompleksie paleossaczy nie są charakterystyczne dla ssaków, a wiele kręgowców niebędących ssakami wykazuje przypisywane mu zachowania związane z opieką nad dziećmi. Odkryto, że wszystkie zauropsydy, klasyfikacja obejmująca ptaki, gady i dinozaury, mają struktury mózgu podobne w działaniu do tego, co MacLean nazwał kompleksem neossaków, co wskazuje, że ewolucja tych struktur również poprzedza ewolucję ssaków. Wyrafinowane zdolności umysłowe, niegdyś uważane za wyłączne dla ssaków, takie jak wytwarzanie narzędzi, są również obecne u niektórych gatunków ptaków.
Idea trójjedynego mózgu również straciła wiarygodność ze względu na lepsze zrozumienie ludzkiego mózgu. Na przykład uszkodzenie mózgu w niektórych obszarach sklasyfikowanych jako część kompleksu paleossaczego może upośledzać funkcje poznawcze, które są rzekomo jedyną domeną kompleksu neossaczego. Trudno to wytłumaczyć w modelu układu nerwowego, który przypisuje wszystkie wyższe funkcje umysłowe jednej, określonej części mózgu.