Epidemiolog weterynaryjny monitoruje populacje zwierząt w celu ochrony zdrowia ludzi i zwierząt. Praca może obejmować reagowanie na wybuchy choroby, udział w badaniach klinicznych i współpracę z urzędnikami zdrowia publicznego. Osoby w tej dziedzinie mogą być zatrudniane przez agencje rządowe, a także firmy farmaceutyczne i organizacje zajmujące się dobrostanem zwierząt. W wielu regionach do pracy w zawodzie epidemiologa konieczne jest posiadanie licencji lekarza weterynarii z doświadczeniem klinicznym, a niektórzy pracodawcy preferują kandydatów do pracy z konkretnym doświadczeniem i przeszkoleniem w zakresie epidemiologii.
Zdrowie i dobrostan zwierząt jest powodem do niepokoju z wielu powodów. Choroby w populacjach zwierząt mogą przeskoczyć na ludzi, niezależnie od tego, czy są to wirusy grypy u ptaków, czy lekooporne infekcje bakteryjne u zwierząt jadalnych. Zły stan zdrowia populacji zwierząt może mieć również wpływ ekonomiczny; na przykład, jeśli populacja zwierząt jadalnych musi zostać zniszczona z powodu wybuchu pryszczycy. Epidemiolog weterynaryjny działa na rzecz ochrony interesów ludzi i zwierząt, koncentrując się na ograniczeniu wybuchu choroby i kontrolowaniu jej, gdy już wystąpi.
Niektóre choroby zwierząt mogą podlegać obowiązkowi zgłaszania, przy czym rolnicy, weterynarze i inne osoby, które mają kontakt z chorymi zwierzętami, muszą złożyć zgłoszenie do weterynarza-epidemiologa. Ci pracownicy służby zdrowia śledzą zgłoszenia, reagują na wybuchy chorób i zarządzają dochodzeniami. W przypadku pojawienia się znanej choroby, epidemiolog weterynaryjny może opracować plan reagowania w celu jej opanowania. W przypadku nieznanych chorób praca może wymagać trochę śledztwa, aby dowiedzieć się, co się dzieje i opracować sposób na radzenie sobie z tym.
Epidemiolodzy weterynaryjni mogą zapewniać pomoc publiczną i edukację, zwłaszcza osobom pracującym ze zwierzętami. Mogą omówić powszechne choroby, sposoby ich zapobiegania oraz sposoby ich identyfikacji, gdy pojawiają się w populacjach zwierząt. Może to wywołać szczególne obawy w przypadku transportowanych i sprzedawanych zwierząt, takich jak zwierzęta mięsne, które mogą być wysyłane do odległych pawilonów lub zwierzęta wykorzystywane w badaniach, które mogą być importowane spoza kraju. Zakażone mogą rozprzestrzenić chorobę na nowe populacje i spowodować kryzys zdrowia publicznego.
Innym aspektem pracy może być skoncentrowanie się na opracowywaniu metod leczenia chorych zwierząt. Badania kliniczne mogą obejmować epidemiologa weterynaryjnego, a monitorowanie może nastąpić po dopuszczeniu leków do sprzedaży. Jeśli zacznie pojawiać się wzorzec działań niepożądanych, nietypowe interakcje leków lub inne problemy, lek może zostać poddany przeglądowi w celu ustalenia, czy wymaga dodatkowych ostrzeżeń, czy też powinien zostać wycofany z rynku.