Jedną z najbardziej oczywistych różnic między koniakiem a whisky jest to, że producenci koniaku używają winogron, a producenci whisky używają zbóż. Chociaż oba procesy wykorzystują fermentację do tworzenia trunków, producenci koniaków stosują proces podwójnej destylacji. Przepisy rządowe wymagają, aby producenci koniaku wytwarzali alkohol wyłącznie w regionie koniaku we Francji, używając tylko niektórych gatunków winogron. Producenci whisky mogą swobodnie produkować whisky w wielu krajach, a niektóre kraje, takie jak Irlandia i Stany Zjednoczone, słyną z whisky.
Podobnie jak w przypadku wielu produktów spożywczych, koniak i whisky mają długą historię rozwoju i udoskonalania. Koniak różni się od innych likierów na bazie owoców tym, że winiarze dwukrotnie go destylują i leżakują w dębowych beczkach. Podwójna destylacja, zwana destylacją charentaise, tworzy mniej ostry napój. Koniak dostarczany w dębowych beczkach lub beczkach jest bardziej aromatyczny i gładszy, ponieważ znajduje się w beczkach na statkach i w magazynie.
Podobnie Irlandczycy i Szkoci musieli improwizować przy produkcji alkoholu i tworzyli whisky. Niedobór winogron na wyspach skłonił do stworzenia likieru zbożowego. Wykorzystali dostępne ziarna, a z czasem proces został udoskonalony, aby uwzględnić starzenie w beczkach. Starzenie sfermentowanego płynu w dębowych beczkach jest typowe dla koniaku i whisky. Na niektórych obszarach, w tym w Irlandii, ludzie używają słowa whisky; w Stanach Zjednoczonych i innych obszarach napój nazywa się whisky.
Producenci koniaku fermentują sok winogronowy przez około pięć dni przed pierwszą destylacją. Po drugiej destylacji twórcy zamykają koniak w beczkach. Zazwyczaj określają wiek koniaku jako Bardzo Wyjątkowy (VS), co oznacza minimum dwa lata w beczce; Very Special Old Pale (VSOP), który trwa cztery lata lub dłużej; lub Extra Old (XO), który jest przechowywany w beczce ponad sześć lat. Niektórzy producenci koniaku starzeją swoje produkty przez ponad 20 lat.
W przeciwieństwie do tego, producenci whisky destylują zacier zbożowy tylko raz i podają wiek w latach. Na przykład etykieta może mówić o 12-letniej whisky. Niektóre z typowych grup wiekowych to pięć, 10 i 15 lat. Podobieństwo między koniakiem a whisky polega na tym, że koneserzy oceniają wiek każdego na podstawie czasu spędzonego w beczce, a nie w butelce.
Kolejną różnicą między koniakiem a whisky jest to, że producenci koniaku używają soku tylko z wybranych winogron, ale nie z innych owoców. Generalnie producenci whisky używają jęczmienia jako bazy, ale mogą również używać innych ziaren. Zboża te obejmują żyto i słodowane żyto, pszenicę i kukurydzę. Często producenci whisky łączą ziarna, takie jak whisky bourbon, w której kukurydza stanowi ponad połowę ziarna.