Strukturę organizacyjną i wydajność łączy relacja, w której ta pierwsza może dyktować lub przynajmniej wpływać na produktywność. Różne struktury mogą być bardziej odpowiednie dla firm w zależności od wielkości podmiotu lub branży, w której działa firma. Pracownicy często stają się wytworem struktury organizacyjnej praktykowanej w firmie i zaczynają zachowywać się i działać w sposób, który odzwierciedla i idealnie wspiera ramy wdrożone przez pracodawców.
Firmy z niedoborem personelu mogą wymagać, aby poszczególne osoby nosiły wiele kapeluszy, to znaczy wykonywały wiele zadań, które są powiązane i niezwiązane z tytułem zawodu. Może to być po to, aby firma nadal działała tak, jakby była w pełni obsadzona personelem, nawet jeśli tak nie jest. Inaczej jest w firmie, która ma funkcjonalną strukturę organizacyjną.
Środowisko funkcjonalne to takie, w którym poszczególni pracownicy otrzymują określone zadania w ramach pionu o szerszym celu organizacyjnym. Oczekuje się, że osoby te będą działać zgodnie z określonymi parametrami. Chociaż zawsze może istnieć prawdopodobieństwo krzyżowania się działów w miarę pojawiania się projektów i opuszczania pracy przez poszczególne osoby, role i funkcje pracy pozostają rozdzielone i zdefiniowane. Związek między strukturą organizacyjną a wydajnością polega tutaj na tym, że pracownicy mogą stawać się coraz bardziej biegli w swojej pracy ze względu na przejrzystość i powtarzalność zadań. Ponadto jednostki mogą mieć niewielkie możliwości odwołania, jeśli wydajność jest opóźniona, ponieważ cele są jasno określone jako realizowane przez pracodawcę.
Mała firma jest bardziej skłonna do przyjęcia płaskiej struktury organizacyjnej. Wynika to częściowo z praktyczności, ponieważ tego typu środowisko jest kształtowane przez nieco ograniczony personel. Pracownicy często pracują pod bezpośrednim kierownictwem właściciela lub operatora firmy, w przeciwieństwie do kierownictwa działu lub kadry kierowniczej średniego szczebla. W takim otoczeniu struktura organizacyjna i wydajność są ze sobą powiązane, ponieważ pracownicy są świadomi, że kierownictwo wyższego szczebla jest świadome indywidualnych wyników. Może to pozytywnie wpłynąć na produktywność i zachęcić współpracowników do udziału.
W macierzowej strukturze organizacyjnej role przypisane tytułom zawodowym są mniej formalne. Firmy, które tworzą takie środowisko, prawdopodobnie będą promować pracę zespołową i łączenie różnych działów biurowych w określonym celu. W tym środowisku struktura organizacyjna i wydajność są ze sobą powiązane, ponieważ pracownicy są zachęcani lub nagradzani za okazywanie ducha przedsiębiorczości i kreatywności, gdy pracują ze sobą, aby osiągnąć określony cel. Konflikt może powstać w środowiskach zespołowych, jeśli pracownicy opierają się różnym stylom zarządzania osób z działów zewnętrznych.