Istnieją tysiące gatunków endemicznych dla Australii (nigdzie indziej). Można to przypisać izolacji geograficznej kontynentu — jest to najbardziej odizolowany z kontynentów i został odkryty dopiero przez obcokrajowców w 1606 roku. Do czasu budowy Kanału Sueskiego Australia była jedynym kontynentem, którego nie łączyła lądują na innych kontynentach. Australia została odizolowana od innych kontynentów, odkąd oderwała się od Antarktydy około 40 milionów lat temu.
Najbardziej znanym gatunkiem endemicznym dla Australii jest fauna torbacza. Torbacze to ssaki o innym rodowodzie i różnicach anatomicznych niż ssaki łożyskowe, w tym niższą temperaturę ciała, wczesne narodziny, brak łożyska i różne narządy płciowe. Należą do nich zwierzęta roślinożerne, takie jak koala, wombat, kangur szczurzy, walabia i słynny kangur, wszystkożerny bandycoot, szybowiec cukrowy, torbacz i różne wallabies, mięsożerny quoll, kowari, numbat, mulgara, antechinus i wiele innych. W sumie 224 gatunki torbaczy są endemiczne dla Australii. Torbacze całkowicie wysiedliły łożyska w Australii.
Inne gatunki endemiczne dla Australii to stekowce, niezwykłe ssaki w swojej własnej kategorii. Mają metabolizm wolniejszy niż torbacze, chociaż mają wszystkie standardowe cechy ssaków, takie jak włosy i zdolność dojenia młodych. Stekowce obejmują cztery gatunki kolczatek i dziobaka, uważanego za jednego z najbardziej niezwykłych członków królestwa zwierząt. Dziobak jest opisywany jako kaczodzioby, bobra i wydry. Ma jadowitą ostrogę na tylnej nodze i składa jaja, jako jeden z niewielu ssaków, który to robi. Stekowce przez wiele lat były słabo poznane, uważane za „bardziej prymitywne” ssaki. Oddzielili się ewolucyjnie od innych ssaków około 150 milionów lat temu, aż do epoki dinozaurów.
Istnieje wiele innych gatunków endemicznych dla Australii, chociaż najbardziej znane są torbacze i stekowce. W Australii około 83% ssaków jest endemicznych, 89% gadów, 90% ryb i owadów oraz 93% płazów. Słynne emu, nielotny ptak spokrewniony ze strusiem, zamieszkuje tam swój dom i znajduje się na herbie Australii. Na kontynencie występują liczne endemiczne gatunki papug. Krokodyl różańcowy, największy ze wszystkich żyjących gatunków krokodyli, występuje w północnej Australii, ale można go również spotkać w Azji Południowo-Wschodniej. Krokodyl słodkowodny, znacznie mniejszy gatunek, występuje endemicznie w północnej Australii.