Wideokonferencje stają się coraz bardziej popularną opcją w świecie biznesu i edukacji ze względu na wygodę i eliminację kosztów podróży. Należy jednak pamiętać również o pewnych wadach wideokonferencji. Po pierwsze, za każdym razem, gdy używana jest technologia, należy spodziewać się trudności technicznych; może to obejmować problemy z oprogramowaniem, problemy z samym sprzętem komputerowym, a nawet otaczające elementy rozpraszające, które utrudniają słyszenie lub widzenie, takie jak hałas otoczenia w biurze. Niektórym osobom brakuje również osobistych połączeń, które występują w bardziej tradycyjnych warunkach, takich jak uścisk dłoni i kontakt wzrokowy, których brakuje podczas wideokonferencji.
Koszt konfiguracji tej technologii to kolejna z najczęstszych wad wideokonferencji. Firmy, które ponoszą duże koszty podróży dla pracowników, często uznają ten proces za wart zachodu, ale niektóre mniejsze firmy mogą uznać koszty wideokonferencji za zaporowe. Firmy będą również musiały zaplanować, gdzie zainstalują wideokonferencję; na przykład sala konferencyjna to dobry wybór, ale wtedy ta sama sala nie może być używana do spotkań, jeśli trwa wideokonferencja. Chociaż być może nie są to wady wideokonferencji, takie kwestie logistyczne są czymś do przemyślenia.
Kłopoty techniczne to jedne z najczęstszych wad wideokonferencji. Usterki oprogramowania są dość powszechne, co może wymagać wezwania pomocy technicznej, przerywając cały harmonogram konferencji. Aparat lub mikrofon w komputerze również może ulec awarii. Ponadto w niektórych biurach mogą wystąpić nieoczekiwane problemy, takie jak hałas dochodzący z zewnątrz. Istnieje wiele sposobów, w jakie wideokonferencja może zostać zakłócona, co zazwyczaj nie stanowi problemu podczas osobistej konferencji.
Inną z głównych wad wideokonferencji jest brak osobistego kontaktu. Podczas próby nawiązania relacji biznesowej, a nawet podczas rozmowy kwalifikacyjnej z kimś o pracę, ważne może być zobaczenie, jak dana osoba radzi sobie w sytuacjach zawodowych. Mocny uścisk dłoni i przyjazny kontakt wzrokowy to jedne z najlepszych sposobów na określenie tego, ale wideokonferencje temu zapobiegają. Ponieważ technologia wciąż się poprawia, prawdopodobnie będzie to mniejszy problem, ale nadal nie będzie substytutu spotkania się z kimś osobiście. Oczywiście zalety wideokonferencji zwykle przeważają nad kilkoma wadami, ale w niektórych przypadkach nie można zastąpić staromodnego spotkania międzyludzkiego.