Chociaż jogurt grecki jest wszechstronny i może być stosowany jako zamiennik wielu bardziej tłustych i kalorycznych składników, pieczenie z użyciem jogurtu greckiego wymaga pewnej uwagi, aby osiągnąć najlepsze rezultaty. Jednym z najważniejszych aspektów pieczenia z jogurtem greckim w przepisach, które nie wymagają tego konkretnie, jest obserwowanie ilości płynu dodawanego do ciasta lub ciasta, ponieważ w jogurcie greckim jest mniej płynu niż w jogurcie nieodcedzonym, mleku i Maślanka. Inną rzeczą, którą należy wziąć pod uwagę podczas pieczenia z jogurtem greckim, jest to, jak wpłynie on na teksturę końcowego wypieku, ponieważ brak wysokotłuszczowego składnika, takiego jak olej lub jajka, może spowodować, że końcowe ciasto, muffinka lub ciastko będzie nadmiernie gęsty i potencjalnie gumowaty. Chociaż jogurt grecki ma mniejszą tendencję do rozdzielania się po ugotowaniu, ilość ciepła, jaką można wykorzystać podczas pieczenia z jogurtem greckim, może zmusić go do oddzielenia się, chyba że zostaną dodane dodatkowe składniki, takie jak białka jaj lub skrobia kukurydziana, aby przeciwdziałać temu efektowi.
Jogurt grecki jest wytwarzany w sposób podobny do większości innych rodzajów jogurtu, z wyjątkiem tego, że pod koniec przetwarzania jest przecedzany, aby uzyskać gęstszą, mniej wodnistą konsystencję. Oznacza to, że przepisy, które wymagają składników, takich jak kwaśna śmietana, serek śmietankowy, bita śmietana, a nawet niektóre rodzaje miękkich serów, mogą zastąpić jogurt grecki bez żadnych modyfikacji stosowanych ilości. W wielu przypadkach bardziej tradycyjne rezultaty pieczenia można osiągnąć, jeśli użyje się pełnotłustego jogurtu greckiego, chociaż pewne modyfikacje przepisów mogą oznaczać, że pieczenie z użyciem jogurtu greckiego, który jest beztłuszczowy lub o niskiej zawartości tłuszczu, również może działać.
Podczas pieczenia z jogurtem greckim w przepisie, w którym jogurt jest używany jako zamiennik produktu płynnego, należy zwrócić uwagę na proporcję dodawanego jogurtu greckiego w stosunku do pierwotnej wymaganej ilości. Zmniejszona objętościowo ilość płynu w jogurcie greckim w porównaniu z mlekiem, maślanką lub śmietanką może prowadzić do tego, że gotowy produkt jest suchy lub kruchy. Aby to zrekompensować, do ciasta należy dodać więcej jogurtu greckiego lub, alternatywnie, można dodać pewną ilość innego rodzaju mokrego składnika, takiego jak mus jabłkowy.
Jeśli grecki jogurt jest używany do zmniejszenia ilości tłuszczu w przepisie, konsystencja końcowego wypieku może być inna niż zamierzona. Ciasta, babeczki i ciasteczka mogą stać się bardzo gęste i gumiaste, jeśli w cieście lub cieście nie ma wystarczającej ilości tłuszczu. Nawet jeśli grecki jogurt ma zastąpić większość tłuszczu w przepisie, pewna ilość oryginalnego tłuszczu – czy to masła, oleju czy żółtek – powinna zostać zachowana, aby zachować konsystencję.
Pieczenie z jogurtem greckim może spowodować pękanie jogurtu i rozdzielanie się na twaróg i serwatkę. Dzieje się tak, ponieważ ciepło może spowodować, że białka w jogurcie będą zatrzymywać się, kurczyć i oddzielać od płynnej serwatki. Jednym ze sposobów na uniknięcie tego jest zmieszanie jogurtu greckiego z czymś, takim jak białka jaj lub skrobia kukurydziana, w celu ustabilizowania białek przed dodaniem jogurtu do pozostałych składników.