Chociaż sprawozdania finansowe mogą przedstawiać obecną kondycję finansową firmy, interesariusze często potrzebują więcej informacji z tych raportów. Analiza wskaźnikowa reprezentuje szereg formuł matematycznych, które firma może zastosować do sprawozdań finansowych. Chociaż te pomiary dostarczają istotnych danych, istnieją ograniczenia analizy ilorazowej. Kilka z najbardziej rażących ograniczeń to potencjalne błędy w informacjach księgowych, potrzeba punktu odniesienia i możliwość, że wskaźniki będą całkowicie bez znaczenia. Firmy muszą przezwyciężyć te wady, aby nie dopuścić do wejścia ograniczeń analizy wskaźnikowej w proces decyzyjny firmy.
Informacje i dane księgowe nie zawsze są bezbłędne. Chociaż większość księgowych ciężko pracuje, aby przedstawić informacje finansowe zgodnie z krajowymi standardami rachunkowości, wytyczne mogą być nieco elastyczne. Ta elastyczność stanowi punkt wyjścia dla ograniczeń analizy wskaźnikowej. Na przykład agresywny proces rozpoznawania dochodów może skutkować wyższymi wskaźnikami rentowności. Chociaż może to dotyczyć wczesnych wskaźników, ostatnie wskaźniki obliczone w ramach tego procesu rozpoznawania przychodów mogą szybko wskazywać na niższą rentowność.
Niezbędny jest również punkt odniesienia, aby zapobiec ograniczeniom analizy wskaźnikowej. Na przykład firma może odkryć pewne wyniki podczas obliczania wskaźników rotacji aktywów, takich jak rotacja zapasów lub należności. Większość firm używa standardu branżowego jako punktu odniesienia, aby określić, czy są w lepszej lub gorszej sytuacji pod względem środowiska operacyjnego. Jednak gdy ten punkt odniesienia nie jest dostępny, firma musi wybrać inny. Brak punktu odniesienia lub wybór niewłaściwego punktu odniesienia może spowodować wypaczenie wskaźników lub stosowanie wskaźników.
Wskaźniki finansowe mogą być również bez znaczenia, jeśli zostaną obliczone samodzielnie. Ograniczenia te istnieją, gdy firma prosi swoich księgowych o ich obliczenie po sporządzeniu każdego sprawozdania finansowego. Wyniki z każdego wskaźnika nie będą jednak miały żadnego znaczenia. Krótko mówiąc, wyniki to po prostu dodatkowe liczby. Firmy muszą mieć dobrze zdefiniowany cel obliczania i używania wskaźników finansowych, aby nie były one bez znaczenia w biznesie.
Celem analizy wskaźnikowej jest docelowo porównanie danych finansowych więcej niż jednej firmy za dany okres. Często trudno jest dokonać takich porównań, gdy sprawozdania finansowe są różne lub w alternatywnych formatach. W związku z tym wskaźniki odbierają tę podmiotowość i pozostawiają interesariuszom użyteczne informacje, o ile nie występują ograniczenia analizy wskaźnikowej.