Υπάρχουν πολλά οφέλη που σχετίζονται με το σιτάρι ολικής αλέσεως, μερικά από αυτά διατροφικά και άλλα σχετικά με τη διαδικασία μαγειρέματος. Πολλά από τα φυσικά θρεπτικά συστατικά στο σιτάρι βρίσκονται στο πίτουρο και το φύτρο του μούρου του σίτου, τα οποία είναι τα μέρη που αφαιρούνται όταν το σιτάρι μεταποιείται σε λευκό αλεύρι και άλλα προϊόντα. Η χρήση σιταριού ολικής αλέσεως παρέχει αύξηση στην ποσότητα μαγνησίου, μαγγανίου και φυτικών ινών που μπορούν να συνδυαστούν για να βοηθήσουν το σώμα να λειτουργεί πιο αποτελεσματικά, να μειώσει τον κίνδυνο ορισμένων ασθενειών και να προσφέρει βελτιωμένη πέψη. Ορισμένοι κατασκευαστές έχουν διαπιστώσει ότι η χρήση σιταριού ολικής αλέσεως ωφελεί επίσης τις γραμμές παραγωγής τους, επειδή είναι πιο ανθεκτικό και μπορεί εύκολα να αναμειχθεί, να μετρηθεί και να παρακολουθηθεί από τη συγκομιδή έως το τελικό προϊόν, σε αντίθεση με ορισμένα πιο επεξεργασμένα αλεύρια.
Ένας από τους βασικούς τρόπους με τους οποίους το σιτάρι ολικής αλέσεως μπορεί να ωφελήσει τον οργανισμό είναι μέσω του τρόπου με τον οποίο πέπτεται. Το φύτρο και το πίτουρο καταναλώνονται, επομένως το σώμα αφομοιώνει το σιτάρι πιο αργά από ό,τι θα το έκανε αν δεν περιλαμβάνονταν. Αυτό επιτρέπει στο σιτάρι να μετατραπεί σε σάκχαρα πιο αργά και φυσικά από ό,τι θα συνέβαινε με το επεξεργασμένο, λεπτοαλεσμένο λευκό αλεύρι που παρασκευάζεται από το ενδοσπέρμιο του σιταριού. Η μείωση της ταχύτητας της πέψης μπορεί να βοηθήσει στην αποφυγή αιχμών του σακχάρου στο αίμα που μπορεί να προκαλέσουν ανεπιθύμητες ενέργειες. Αυτό σημαίνει επίσης ότι το άτομο που έχει φάει το σιτάρι ολικής αλέσεως θα αισθάνεται χορτάτο για μεγαλύτερο χρονικό διάστημα, βοηθώντας στη διατήρηση ενός υγιούς βάρους.
Το μαγνήσιο που περιέχεται στο σιτάρι ολικής αλέσεως μπορεί να βοηθήσει στην πρόληψη προβλημάτων με την παραγωγή ινσουλίνης, μειώνοντας πιθανώς τον κίνδυνο εμφάνισης διαβήτη τύπου 2. Η κατανάλωση ολικής αλέσεως έχει επίσης αποδειχθεί ότι μειώνει τον κίνδυνο καρδιακών παθήσεων και καρκίνου του μαστού. Ορισμένα στοιχεία του σιταριού ολικής αλέσεως, όπως διάφορα είδη οξέων στο πίτουρο, έχουν αντιοξειδωτικά και άλλες ιδιότητες που μπορούν να καταπολεμήσουν τις λοιμώξεις και τις ασθένειες και γενικά έχουν ευεργετική επίδραση στον οργανισμό εάν καταναλωθούν σε σωστές ποσότητες ως μέρος μιας υγιεινής διατροφής.
Ορισμένες εταιρείες που παράγουν εμπορικά αρτοσκευάσματα έχουν διαπιστώσει ότι, χρησιμοποιώντας σιτάρι ολικής αλέσεως, είναι σε καλύτερη θέση να παρακολουθούν και να ελέγχουν τις προμήθειες των δημητριακών τους από την πηγή μέχρι την παραγωγή. Ο κόκκος μπορεί επίσης να αντέξει ορισμένες τεχνικές επεξεργασίας με πιο ευνοϊκά αποτελέσματα από το επεξεργασμένο λευκό αλεύρι. Τα σχετικά οφέλη για την υγεία σημαίνουν επίσης ότι ορισμένοι παραγωγοί θεωρούν ωφέλιμο να διαφημίζουν τη χρήση δημητριακών ολικής αλέσεως στα τρόφιμά τους για να προσελκύσουν τους καταναλωτές.