Η κύρια αιτία ενός ανεξήγητου πυρετού είναι κάποιος τύπος βακτηριακής ή ιογενούς λοίμωξης. Άλλες αιτίες περιλαμβάνουν συνταγογραφούμενα φάρμακα και πιο σοβαρές υποκείμενες παθήσεις, όπως ο HIV ή ο καρκίνος. Ένας ανεξήγητος πυρετός μπορεί να συνοδεύεται από άλλα συμπτώματα που μοιάζουν με κρυολόγημα ή αλλεργική αντίδραση. Αυτοί οι τύποι πυρετών είναι συνήθως χαμηλού βαθμού και μπορεί να εμφανιστούν μία φορά, κατά διαστήματα ή χρόνια.
Τα άτομα μπορεί να εμφανίσουν πυρετό όταν αποκτήσουν λοίμωξη της ανώτερης ή κατώτερης αναπνευστικής οδού. Ο πυρετός μπορεί να είναι ελαφρύς και να αυξήσει τη φυσιολογική θερμοκρασία του σώματος ενός ατόμου μόνο κατά μερικούς βαθμούς. Εκτός από τον πυρετό, οι λοιμώξεις της αναπνευστικής οδού μπορεί να αναγνωριστούν από άλλα συμπτώματα, όπως περίσσεια υγρού και βλέννας στο στήθος, το λαιμό, τη μύτη και τα αυτιά.
Ένας ανεξήγητος πυρετός είναι συχνά μια ανοσολογική απόκριση που έχει σχεδιαστεί για να βοηθήσει το σώμα να διατηρήσει τη σωστή θερμοκρασία. Οι βακτηριακές λοιμώξεις που εμφανίζονται στα όργανα του σώματος, συμπεριλαμβανομένων ασθενειών όπως η φλεγμονώδης νόσος της πυέλου, μπορεί να οδηγήσουν σε πυρετό. Ενώ αυτές οι βακτηριακές λοιμώξεις μπορούν να αντιμετωπιστούν με αντιβιοτικά, μπορεί να μην έχουν εμφανή συμπτώματα ή μπορεί να χρειαστεί λίγος χρόνος για να εμφανιστούν αξιοσημείωτα συμπτώματα.
Σοβαρές ασθένειες που θέτουν σε κίνδυνο το ανοσοποιητικό σύστημα μπορεί να οδηγήσουν σε χρόνιο ανεξήγητο πυρετό. Μία από αυτές τις ασθένειες είναι ο HIV ή το AIDS. Δεδομένου ότι η πάθηση επιτίθεται αργά στο ανοσοποιητικό σύστημα του σώματος και του αφαιρεί τις δυνατότητές του, αναπτύσσεται πυρετός ως η μάταιη προσπάθεια του σώματος να απαλλαγεί από τον ιό. Οποιοσδήποτε τύπος καρκίνου μπορεί επίσης να οδηγήσει σε επίμονο πυρετό.
Οι μυστηριώδεις πυρετοί είναι κάπως συνηθισμένοι στα παιδιά και τα μωρά καθώς τα συστήματά τους προσαρμόζονται στο περιβάλλον. Καθώς το ανοσοποιητικό σύστημα των παιδιών αναπτύσσεται, είναι πιο πιθανό να κολλήσουν διάφορους ιούς από άλλα παιδιά. Εκτός εάν ο πυρετός είναι σχετικά υψηλός, συνήθως δεν χρειάζεται ξεχωριστή θεραπεία και θα υποχωρήσει μόλις αντιμετωπιστεί η λοίμωξη.
Ορισμένοι τύποι συνταγών και χρήσης φαρμάκων μπορεί να οδηγήσουν σε πυρετό. Τα στεροειδή και οι θεραπείες για τον καρκίνο μπορεί να προκαλέσουν το σώμα να αναπτύξει μια φλεγμονώδη απόκριση που οδηγεί σε πυρετό. Ακόμη και η υπερβολική χρήση αλκοόλ και παράνομων ναρκωτικών μπορεί να οδηγήσει στην ανάπτυξη επίμονου πυρετού που δεν έχει πρόσθετα συμπτώματα. Ορισμένες ασθένειες που αναπτύσσονται ως αποτέλεσμα της κατάχρησης αλκοόλ, όπως η ηπατική βλάβη και οι ουλές, μπορεί να είναι η πραγματική υποκείμενη αιτία του πυρετού.
Τόσο τα παιδιά όσο και οι ενήλικες μπορεί να αναπτύξουν έναν ανεξήγητο πυρετό. Η συνήθης αιτία είναι μια υποκείμενη πάθηση που αποδυναμώνει το ανοσοποιητικό σύστημα κατά κάποιο τρόπο. Ορισμένες χρόνιες παθήσεις, συμπεριλαμβανομένου του διαβήτη και του λύκου, μπορεί να οδηγήσουν σε επίμονους πυρετούς.