Μία από τις πιο κοινές χρήσεις της κλονιδίνης είναι η θεραπεία της διαταραχής ελλειμματικής προσοχής και υπερκινητικότητας, ή ADHD. Συνήθως χρησιμοποιείται μόνο εάν τα διεγερτικά, τα οποία χρησιμοποιούνται πιο συχνά για θεραπεία, δεν λειτουργούν. Οι περισσότεροι άνθρωποι χρησιμοποιούν κλονιδίνη για συμπτώματα ΔΕΠΥ όπως παρορμητικότητα και υπερκινητικότητα. Από την άλλη πλευρά, μπορεί επίσης να χρησιμοποιηθεί για τη μείωση των δευτερογενών συμπτωμάτων που εμφανίζουν μόνο ορισμένοι ασθενείς, όπως αϋπνία, ευερεθιστότητα, επιθετικότητα και ταραχή. Δεδομένου ότι αυτές είναι συχνά επίσης παρενέργειες διεγερτικών, όπως η μεθυλφαινιδάτη ή η δεξτροαμφεταμίνη, οι περισσότεροι ασθενείς πρέπει να χρησιμοποιούν και διεγερτικά και κλονιδίνη για τη ΔΕΠΥ.
Ένα κοινό σύμπτωμα της ΔΕΠΥ είναι η υπερκινητικότητα, η οποία μπορεί να επηρεάσει την καθημερινή ρουτίνα των περισσότερων ασθενών. Για παράδειγμα, τα παιδιά που δυσκολεύονται να κάθονται ακόμα συχνά δεν τα πηγαίνουν καλά στην τάξη, ενώ οι ενήλικες με το ίδιο πρόβλημα μπορεί να μην μπορούν να εργαστούν στην τυπική δουλειά του γραφείου. Ως εκ τούτου, μπορεί να επιλέξουν να χρησιμοποιήσουν κλονιδίνη για ΔΕΠΥ, καθώς μπορεί να τους βοηθήσει να ηρεμήσουν. Η παρορμητικότητα είναι ένα άλλο κοινό σύμπτωμα που συνήθως πρέπει να αντιμετωπιστεί προκειμένου οι ασθενείς να ζήσουν μια φυσιολογική ζωή, καθώς η λήψη βιαστικών αποφάσεων μπορεί να τους επηρεάσει αρνητικά. Η κλονιδίνη, ωστόσο, συνήθως δεν έχει επίδραση στην απροσεξία ή στη σύντομη διάρκεια προσοχής, γι’ αυτό και τα διεγερτικά συχνά χρειάζεται να λαμβάνονται ταυτόχρονα.
Στα περισσότερα άτομα με ΔΕΠΥ συνταγογραφούνται διεγερτικά για την ανακούφιση των περισσότερων από τα συμπτώματα αυτής της πάθησης. Δυστυχώς, αυτό το είδος φαρμάκου συνήθως συνοδεύεται από παρενέργειες που πρέπει να αντιμετωπιστούν με άλλα φάρμακα. Για παράδειγμα, οι περισσότεροι άνθρωποι που λαμβάνουν διεγερτικά βιώνουν αϋπνία, η οποία συχνά τους οδηγεί είτε στη διακοπή του φαρμάκου είτε στην έλλειψη ύπνου. Για το λόγο αυτό, πολλοί γιατροί συνταγογραφούν επίσης κλονιδίνη για τη ΔΕΠΥ, καθώς είναι γνωστό ότι βοηθά τους ασθενείς να κοιμηθούν. Στην πραγματικότητα, η υπνηλία είναι μια από τις κύριες παρενέργειές της, η οποία μπορεί να ενοχλεί όσους τη λαμβάνουν για να ανακουφίσουν την υψηλή αρτηριακή πίεση ενώ παράλληλα βοηθά όσους τη λαμβάνουν για ΔΕΠΥ.
Όσοι δεν πάσχουν από αϋπνία μπορεί να διστάζουν να λάβουν κλονιδίνη για συμπτώματα ΔΕΠΥ όπως υπερκινητικότητα και παρορμητικότητα, αλλά τα καλά νέα είναι ότι αυτή η παρενέργεια μπορεί να μετριαστεί. Για παράδειγμα, η λήψη του φαρμάκου πριν από τον ύπνο είναι ένας καλός τρόπος για να αποφύγετε την υπνηλία κατά τη διάρκεια της ημέρας ενώ ανακουφίζετε από την υπερκινητικότητα. Αυτό το φάρμακο πρέπει επίσης να λαμβάνεται σε μικρές, συχνές δόσεις προκειμένου να μειωθούν οι πιθανότητες υπνηλίας. Θα πρέπει να σημειωθεί από όσους επιλέγουν να λάβουν κλονιδίνη για ΔΕΠΥ ότι το φάρμακο συνήθως χρειάζεται περίπου ένα μήνα για να έχει οποιαδήποτε επίδραση στην παρορμητικότητα και την υπερκινητικότητα.