Η μελατονίνη είναι μια χημική ουσία που εμφανίζεται φυσικά στον εγκέφαλο, αλλά παράγεται επίσης ως συμπλήρωμα που χρησιμοποιείται ως βοήθημα ύπνου και ως θεραπεία για προβλήματα του κιρκάδιου ρυθμού. Αυτό το συμπλήρωμα είναι γενικά καλά ανεκτό στους περισσότερους ανθρώπους, αλλά υπάρχει πιθανότητα αρνητικών αλληλεπιδράσεων μελατονίνης με ορισμένα φάρμακα. Αυτές οι αλληλεπιδράσεις μπορούν να αλλάξουν τον τρόπο με τον οποίο αυτά τα φάρμακα επηρεάζουν το σώμα, επομένως κάθε άτομο που παίρνει μελατονίνη με άλλο φάρμακο θα πρέπει να γνωρίζει αυτές τις πιθανές αλληλεπιδράσεις μελατονίνης.
Τα φάρμακα για την αρτηριακή πίεση όπως η κλονιδίνη μπορεί να είναι λιγότερο αποτελεσματικά για ασθενείς που λαμβάνουν επίσης μελατονίνη. Οι αναστολείς διαύλων ασβεστίου που χρησιμοποιούνται για τη ρύθμιση της αρτηριακής πίεσης μπορούν να μειώσουν την ποσότητα της μελατονίνης που εισέρχεται στον εγκέφαλο. Τα φάρμακα με βήτα-αναστολείς που χρησιμοποιούνται για την αρτηριακή πίεση μπορεί να μην επηρεάζουν τα συμπληρώματα μελατονίνης, αλλά θα μπορούσαν να μειώσουν τα επίπεδα μελατονίνης που παράγεται από το σώμα.
Τα στεροειδή φάρμακα που χρησιμοποιούνται για τη μείωση των αποκρίσεων του ανοσοποιητικού συστήματος μπορεί να επηρεαστούν αρνητικά από τη μελατονίνη. Οι αλληλεπιδράσεις της μελατονίνης με τα κορτικοστεροειδή, ειδικότερα, μπορεί να τα αναγκάσουν να σταματήσουν να λειτουργούν. Άλλα φάρμακα που χρησιμοποιούνται για τη μεσολάβηση της φλεγμονώδους απόκρισης, όπως τα μη στεροειδή αντιφλεγμονώδη φάρμακα (ΜΣΑΦ) όπως η ιβουπροφαίνη, μπορεί επίσης να επηρεαστούν. Αυτά τα φάρμακα μπορούν να μειώσουν την αποτελεσματικότητα αυτού του συμπληρώματος μειώνοντας τα επίπεδά του στο πλάσμα.
Έχουν αναφερθεί σοβαρές αλληλεπιδράσεις μελατονίνης με ορισμένα αντικαταθλιπτικά. Τα αντικαταθλιπτικά αυξάνουν ήδη τα φυσικά επίπεδα μελατονίνης, επομένως η προσθήκη περισσότερων από αυτό το συμπλήρωμα μπορεί να προκαλέσει συμπτώματα που μοιάζουν με υπερβολική δόση. Αυτά τα συμπτώματα μπορεί να περιλαμβάνουν σύγχυση, απώλεια μνήμης, υπερβολική υπνηλία και δυσκολία στην αναπνοή. Δεν μπορεί όλα τα αντικαταθλιπτικά να προκαλούν αυτά τα συμπτώματα, αλλά η συμβουλή ενός γιατρού προτού τα αναμίξετε με μελατονίνη θα μπορούσε να βοηθήσει στην πρόληψη επικίνδυνων επιπλοκών.
Η λήψη αντιπηκτικών με αυτό το συμπλήρωμα μπορεί επίσης να δημιουργήσει δυσμενείς αλληλεπιδράσεις μελατονίνης. Η μελατονίνη αναστέλλει τον σχηματισμό θρόμβων αίματος, επομένως η ανάμειξή της με αντιπηκτικά όπως η βαρφαρίνη θα μπορούσε να αναστείλει σημαντικά την πήξη μετά από ένα κόψιμο στο σώμα. Επομένως, ο συνδυασμός των δύο θα μπορούσε να έχει επικίνδυνα αποτελέσματα.
Η ανάμειξη αυτού του συμπληρώματος με ινσουλίνη και άλλα φάρμακα για τον διαβήτη μπορεί να οδηγήσει σε επικίνδυνες συνέπειες. Κανονικά, η μελατονίνη παίζει ρόλο στην αύξηση του σακχάρου στο αίμα. Επομένως, τείνει να δρα ενάντια στα φάρμακα για τον διαβήτη που μειώνουν τα επίπεδα σακχάρου. Σε ακραίες περιπτώσεις, η μελατονίνη θα μπορούσε να εμποδίσει αυτά τα φάρμακα να δράσουν.
Η έρευνα έχει δείξει μια πιθανή αλληλεπίδραση μεταξύ της μελατονίνης και ορισμένων τύπων αντιψυχωσικών. Τα αντιψυχωσικά, μετά από ένα χρονικό διάστημα, μπορούν να δημιουργήσουν μια κατάσταση γνωστή ως όψιμη δυσκινησία. Αυτή η κατάσταση έχει ως αποτέλεσμα επαναλαμβανόμενες κινήσεις του προσώπου και του στόματος, ιδιαίτερα με τη μορφή χείλους και κινήσεων της γλώσσας. Τα άτομα σε μια μελέτη έδειξαν μειωμένη τάση να εμπλέκονται σε αυτές τις συμπεριφορές μετά τη λήψη μελατονίνης, αν και το αποτέλεσμα ήταν μόνο προσωρινό.