Οι πιπεριές, που συνήθως ονομάζονται επίσης πιπεριές στη Βόρεια Αμερική, είναι φυτά που είναι επιρρεπή σε διάφορους τύπους ασθενειών. Μερικά από τα στοιχεία που προκαλούν ασθένεια σε αυτά τα φυτά περιλαμβάνουν τύπους μυκήτων, βακτηρίων και ιών. Οι περισσότερες από τις ασθένειες που επηρεάζουν τα φυτά πιπεριάς εμφανίζουν την παρουσία τους σε συμπτώματα όπως σήψη, μαρασμός, καστανή και κηλίδες. Μερικά από αυτά, συμπεριλαμβανομένων των μυκητιακών ασθενειών, μπορεί να είναι ορατά ως τύπος μούχλας ή φουσκώματος στο φυτό ή στις ρίζες του. Μερικές από τις πιο συνηθισμένες ασθένειες της πιπεριάς περιλαμβάνουν το ωίδιο, το βακτηριακό στίγμα, τη βακτηριακή σήψη και τον ιό της κηλίδας πιπεριάς.
Υπάρχει επίσης μια σειρά από παράσιτα που μπορούν να καταστρέψουν τα φυτά καθώς και τις πιπεριές, που είναι στην πραγματικότητα τα φρούτα του φραγκοστάφυλου. Οι αφίδες, οι νηματώδεις, οι κάμπιες και τα ακάρεα είναι μερικά από τα παράσιτα που μπορούν να βλάψουν και να σκοτώσουν τα φυτά μέσω της τροφής τους. Ορισμένες ασθένειες του αυγού εξαπλώνονται στην πραγματικότητα από φυτό σε φυτό από παράσιτα. Ο ιός της πιπεριάς, για παράδειγμα, μπορεί να εξαπλωθεί από αφίδες που τον μεταφέρουν από μολυσμένα ζιζάνια.
Τρεις βασικοί τύποι μυκητιακών παθήσεων προσβάλλουν τις ρίζες των πιπεριών και άλλων φυτών όταν το έδαφος παραμένει πολύ υγρό. Όταν το έδαφος παραμένει δροσερό, το Pythium μπορεί να αναπτυχθεί και να προκαλέσει καστανή και σήψη των ριζών. Σε θερμότερες θερμοκρασίες, η Ριζοκτονία μπορεί να αναπτυχθεί και να προκαλέσει καφέ μαλακές κηλίδες όπου το φυτό βγαίνει από το έδαφος. Επιπλέον, το Phytophthora μπορεί να αναπτυχθεί στις ρίζες και το κάτω στέλεχος, κάνοντας τα φυτά καφετιά και προκαλώντας σήψη των ριζών.
Οι μυκητιασικές ασθένειες που προσβάλλουν συνήθως το φυτό και τους καρπούς του φραγκοστάφυλου περιλαμβάνουν διαφορετικούς τύπους μούχλας και μούχλας, οι οποίοι είναι συνήθως ορατοί ως κηλίδες και κηλίδες στα φυτά και τις πιπεριές. Οι περισσότερες από αυτές τις μυκητιακές ασθένειες μπορούν να επηρεάσουν μια μεγάλη ποικιλία καλλιεργειών. Οι μυκητιακές ασθένειες είναι δύσκολο να αντιμετωπιστούν και μερικές από αυτές δεν μπορούν να σκοτωθούν μόλις εμφανιστούν στα φυτά. Σε αυτές τις περιπτώσεις, τα φυτά μπορεί να πρέπει να αφαιρεθούν ενώ το χώμα υποβάλλεται σε επεξεργασία για να σκοτώσει την ασθένεια.
Οι ιογενείς και βακτηριακές παθήσεις δεν έχουν γενικά ορατά σημεία όπως η μούχλα, αλλά εμφανίζονται σε συμπτώματα καθώς τα φυτά μαραίνονται, ροδίζουν και πεθαίνουν. Αυτά μπορούν να εξαπλωθούν από παράσιτα, χέρια, εργαλεία κηπουρικής ακόμη και μολυσμένους σπόρους. Το βακτηριακό στίγμα, η βακτηριακή σήψη, οι ιοί της κηλίδας και διάφορα είδη ιών ντομάτας είναι μερικές από τις πιο κοινές βακτηριακές και ιογενείς ασθένειες της καψούρας. Αυτές οι ασθένειες δεν μπορούν συνήθως να θεραπευτούν και μπορούν να βλάψουν και να καταστρέψουν τα πάντα, από μικρά οικόπεδα μέχρι μεγάλες καλλιέργειες.