Υπάρχουν τρεις κοινές περιοχές του εγκεφαλικού φλοιού. Αυτά τα μέρη είναι οι συσχετισμοί, οι κινητικές και οι αισθητηριακές περιοχές. Κάθε μία από αυτές τις τρεις περιοχές παίζει ξεχωριστούς ρόλους στη λήψη, επεξεργασία και μετάδοση πληροφοριών στον εγκέφαλο. Γενικά, ο εγκεφαλικός φλοιός είναι υπεύθυνος για το χειρισμό όλων των πληροφοριών που αφορούν τις αισθήσεις, τις κινήσεις και τη συνείδηση.
Ο φλοιός του εγκεφάλου είναι επίσης γνωστός ως φαιά ουσία στον εγκέφαλο λόγω του γκριζωπού χρώματος του. Είναι ένα στρώμα νευρικού ιστού, που είναι ιστό που περιέχει πολλούς νευρώνες, που καλύπτει και τα δύο ημισφαίρια του εγκεφάλου. Υπάρχουν συνολικά έξι στρώματα που αποτελούν τον εγκεφαλικό φλοιό. Οι νευρώνες μέσα στον ιστό κάθε στρώματος συνδέονται με άλλες περιοχές του εγκεφάλου.
Οι περιοχές σύνδεσης του εγκεφαλικού φλοιού συνδέονται με τον ινιακό, κροταφικό και βρεγματικό λοβό που βρίσκονται στην πίσω περιοχή του εγκεφαλικού φλοιού. Αυτός ο τομέας συμβάλλει στην αντίληψη ενός ατόμου ή στον τρόπο με τον οποίο οι αντιλήψεις επηρεάζουν τις εμπειρίες. Η αφηρημένη σκέψη και ο προγραμματισμός κινήσεων και δράσεων επηρεάζονται από τους τομείς σύνδεσης. Διάφορες μορφές γλώσσας, όπως η έκφραση και η λήψη, διαχειρίζονται επίσης σε αυτόν τον τομέα. Επιπλέον, η προσοχή, η μνήμη και η επεξεργασία της συνείδησης σε σχέση με την κίνηση διατηρούνται από αυτήν την περιοχή.
Κινητικές περιοχές του εγκεφαλικού φλοιού βρίσκονται και στα δύο ημισφαίρια. Εκτείνονται από το ένα αυτί, στην κορυφή του εγκεφάλου και κάτω στο άλλο αυτί. Αυτές οι περιοχές ελέγχουν τις εθελοντικές κινήσεις, ιδιαίτερα τις λεπτές κινήσεις που γίνονται από τα χέρια. Οι κινητικές περιοχές λαμβάνουν και στέλνουν εισροές από την ουρά μαύρα και τους βασικούς πυρήνες.
Οι αισθητηριακές περιοχές συγκεντρώνονται, επεξεργάζονται και στέλνουν πληροφορίες που προέρχονται από τις αισθήσεις. Οι κύριες αισθητηριακές περιοχές λαμβάνουν πληροφορίες από τον θάλαμο. Κάθε ημισφαίριο του εγκεφάλου λαμβάνει αισθητηριακές πληροφορίες από αντίθετες πλευρές του σώματος, πράγμα που σημαίνει ότι το δεξί ημισφαίριο λαμβάνει σήματα από την αριστερή πλευρά του σώματος ενώ το αριστερό ημισφαίριο λαμβάνει σήματα από τη δεξιά πλευρά του σώματος. Η αφή, η ακοή και η όραση χειρίζονται αυτή η περιοχή του εγκεφαλικού φλοιού.
Ενώ οι περιοχές του εγκεφαλικού φλοιού μπορούν γενικά να χωριστούν με βάση τον σκοπό, στην πραγματικότητα χωρίζονται ακόμη περισσότερο από τις τρεις περιοχές. Πολλοί γιατροί και ερευνητές έχουν χαρτογραφήσει τον εγκεφαλικό φλοιό και τον έχουν χωρίσει σε πολλές περιοχές. Αυτοί οι πιο οριστικοί τομείς ταξινομούνται περαιτέρω ως πρωτογενείς ή δευτερογενείς. Οι κύριες περιοχές χειρίζονται απλούστερες λειτουργίες που ασχολούνται άμεσα με την είσοδο. Οι δευτερεύουσες περιοχές είναι υπεύθυνες για πιο πολύπλοκες λειτουργίες, όπως η κρίση και η δημιουργικότητα.