Όταν πρόκειται για την παρασκευή πίτσας με καραμελωμένο κρεμμύδι, θα πρέπει να ληφθούν υπόψη τα είδη των κρεμμυδιών που χρησιμοποιούνται καθώς και τα πρόσθετα συστατικά. Ο σκοπός της καραμελοποίησης των κρεμμυδιών είναι να γίνουν μαλακά και να αναδειχθεί η εγγενής γλύκα μέσα τους. Για να το διευκολύνετε ακόμη περισσότερο, είναι συχνά καλύτερο να επιλέξετε ένα κρεμμύδι που είναι ήδη αρκετά γλυκό, όπως ισπανικά ή κίτρινα κρεμμύδια, ή να χρησιμοποιήσετε λίγη ζάχαρη ενώ τα καραμελώνετε. Θα πρέπει επίσης να ληφθούν υπόψη τα πρόσθετα συστατικά που χρησιμοποιούνται για την επικάλυψη της πίτσας με καραμελωμένο κρεμμύδι, όπως διάφορα είδη τυριών και κρέατα με γεύσεις που συνδυάζονται καλά με το κρεμμύδι.
Η καραμελωμένη πίτσα με κρεμμύδι ξεκινά συχνά με τα κρεμμύδια, και γι’ αυτό θα πρέπει να ληφθεί υπόψη ο καθορισμός του ποια θα χρησιμοποιηθούν. Τα γλυκά κρεμμύδια θεωρούνται συνήθως τα καλύτερα για αυτό το είδος παρασκευής, καθώς η διαδικασία καραμελοποίησης αναδεικνύει και ενισχύει τη γλυκύτητα οποιουδήποτε κρεμμυδιού που χρησιμοποιείται. Συχνά προτιμώνται τα κίτρινα ή τα ισπανικά κρεμμύδια, αν και μερικά κόκκινα κρεμμύδια μπορούν επίσης να δώσουν μια γλυκιά και δυνατή γεύση μετά την καραμελοποίηση. Στο τέλος, ωστόσο, θα πρέπει να ληφθούν υπόψη οι προτιμήσεις του ατόμου που τρώει την πίτσα με καραμελωμένο κρεμμύδι και μπορεί να χρησιμοποιηθεί σχεδόν οποιοδήποτε είδος κρεμμυδιού.
Η πραγματική διαδικασία καραμελοποίησης κρεμμυδιών για πίτσα καραμελωμένου κρεμμυδιού συχνά διαρκεί όσο ή περισσότερο από το ψήσιμο της ίδιας της πίτσας. Καθώς αυτό είναι ένα τόσο σημαντικό συστατικό της συνολικής γεύσης του πιάτου, ωστόσο, αξίζει τον κόπο ένας παρασκευαστής πίτσας να εξασφαλίσει ότι τα κρεμμύδια ψήνονται αργά μέχρι να μαλακώσουν και να ροδίσουν. Δεν είναι ασυνήθιστο για έναν μάγειρα να προσθέτει λίγη μαύρη ζάχαρη ή μέλι στο τηγάνι ενώ μαγειρεύει τα κρεμμύδια για πίτσα καραμελωμένο κρεμμύδι, κάτι που ενισχύει τη δυνητική γλυκύτητα των κρεμμυδιών που χρησιμοποιούνται. Η καραμελοποίηση εκτελείται συχνά σε μέτρια ή χαμηλή φωτιά για έως και μισή ώρα, αν και τα κρεμμύδια μπορεί να απαιτούν λιγότερο χρόνο.
Εκτός από τα κρεμμύδια για πίτσα καραμελωμένου κρεμμυδιού, πρέπει να ληφθούν υπόψη και άλλα συστατικά και επικαλύψεις. Η γλυκύτητα των κρεμμυδιών συχνά συνδυάζεται καλά με κάτι αλμυρό, έτσι πολλοί παρασκευαστές πίτσας προτιμούν να χρησιμοποιούν κρέας όπως προσούτο ή ιταλικό λουκάνικο μαζί τους. Υπάρχει επίσης μια μεγάλη ποικιλία από σάλτσες και τυριά που μπορούν να χρησιμοποιηθούν για την παρασκευή αυτής της πίτσας, συμπεριλαμβανομένων βασικών κόκκινων σάλτσες και τυριών που μπορεί να κυμαίνονται από μοτσαρέλα έως γκοργκοντζόλα. Μερικοί προτιμούν να φτιάχνουν καραμελωμένη πίτσα με κρεμμύδι χωρίς καθόλου σάλτσα, επιτρέποντας στα κρεμμύδια και σε λίγο τυρί να ενισχύσουν τη γεύση της ζύμης και να λειτουργήσουν ως η κύρια εστίαση του πιάτου.