Το λογισμικό ειδικής αγωγής μπορεί να διδάξει στα παιδιά δεξιότητες ή να βοηθήσει στη διαχείριση των εκπαιδευτικών τους δεδομένων σε σχολεία με προγράμματα ειδικής αγωγής. Υπάρχουν διάφοροι τύποι προγραμμάτων που βοηθούν τα παιδιά να ενισχύσουν τις δεξιότητές τους στην ανάγνωση, την ομιλία και τη γραφή. Διατίθενται επίσης προγράμματα που βοηθούν τα παιδιά να βελτιώσουν τις μαθηματικές τους δεξιότητες. Αυτά τα προγράμματα περιλαμβάνουν παιχνίδια και ευκαιρίες για τα παιδιά να εξασκήσουν δεξιότητες που θα χρειαστούν στη ζωή καθώς και στο σχολείο.
Το λογισμικό μαθηματικών δεξιοτήτων μπορεί να διδάξει στα παιδιά μέσω παιχνιδιών ή μουσικής. Οι μαθητές με ειδικές ανάγκες μπορούν να μάθουν να μετράνε και να μάθουν βασικές μαθηματικές δεξιότητες χρησιμοποιώντας διαδραστικά προγράμματα που τους επιτρέπουν να χειρίζονται αντικείμενα στον υπολογιστή. Τα μαθήματα πολλαπλασιασμού, πρόσθεσης και αφαίρεσης είναι τυπικά στο λογισμικό μαθηματικών δεξιοτήτων. Επιπλέον, τα παιδιά μπορούν να εξασκήσουν αυτά που έμαθαν χρησιμοποιώντας βιβλία εργασίας που συνοδεύουν το λογισμικό.
Το λογισμικό πληκτρολογίου βοηθά τα παιδιά με σωματικές αναπηρίες να πληκτρολογούν στον υπολογιστή. Αυτό το λογισμικό μπορεί να βοηθήσει τα παιδιά με δυσλεξία, διαταραχή ελλειμματικής προσοχής και αυτισμό να μάθουν πώς να πληκτρολογούν. Ανάλογα με την αναπηρία του παιδιού, το πρόγραμμα μπορεί να διδάξει την πληκτρολόγηση σε σύντομες ασκήσεις, προσφέροντας στο παιδί την ευκαιρία να εξασκήσει αυτό που έχει μάθει. Τα παιδιά που είναι δυσλεξικά μπορούν να χρησιμοποιήσουν λογισμικό για να τα βοηθήσουν να εξασκηθούν στην πληκτρολόγηση χωρίς να μεταφέρουν γράμματα. Το λογισμικό μπορεί επίσης να είναι αποτελεσματικό για να βοηθήσει τα παιδιά που συνήθως δυσκολεύονται να γράψουν σωστά.
Το λογισμικό ειδικής εκπαίδευσης για δεξιότητες γλωσσικών τεχνών μπορεί να χρησιμοποιεί ασκήσεις μουσικής και ομιλίας για να βοηθήσει τα παιδιά να αναπτύξουν και να βελτιώσουν τις δεξιότητες κατανόησης ανάγνωσης, προφοράς και γραμματικής. Ορισμένα προγράμματα χρησιμοποιούν εικόνες και ήχο, κάτι που τους απαιτεί να αναγνωρίζουν τις εικόνες και να προφέρουν λέξεις αφού ακούσουν ένα μήνυμα. Το λογισμικό γλωσσικών τεχνών μπορεί να διδάξει στα παιδιά που έχουν αναπηρίες να χρησιμοποιούν σωστά τις λέξεις σε πλήρεις προτάσεις. Ορισμένα προγράμματα γλωσσικών τεχνών διδάσκουν χρησιμοποιώντας διαδραστικά παιχνίδια στα οποία τα παιδιά κερδίζουν πόντους δίνοντας σωστές απαντήσεις. Τα μεγαλύτερα παιδιά μπορούν να μάθουν να γράφουν δοκίμια με λογισμικό που έχει σχεδιαστεί για να τα βοηθά στην έρευνα, την οργάνωση, τη συγγραφή και την επεξεργασία.
Οι δάσκαλοι που εργάζονται σε τάξεις όπου υπάρχουν μαθητές με αναπηρία μπορεί να χρησιμοποιούν λογισμικό ειδικής εκπαίδευσης για να παρακολουθούν την επίτευξη του στόχου και τις προσαρμογές και τις τροποποιήσεις που απαιτούνται για κάθε παιδί. Το λογισμικό χρησιμοποιείται συχνά για την παραγωγή ενός ατομικού εκπαιδευτικού σχεδίου (IEP) για μαθητές σε προγράμματα ειδικής εκπαίδευσης. Πρόσθετα πακέτα λογισμικού ειδικής αγωγής μπορούν να βοηθήσουν παιδιά με προβλήματα συμπεριφοράς ή κοινωνικά προβλήματα.
Το λογισμικό περιέχει συχνά προγράμματα σπουδών που εστιάζουν στην ανάπτυξη δεξιοτήτων επίλυσης προβλημάτων. Ορισμένα από τα συστήματα λογισμικού απαιτούν από τα παιδιά να παρακολουθούν παρουσιάσεις πολυμέσων ιστοριών και να απαντούν σε ερωτήσεις που σχετίζονται με αυτές. Τα παιδιά μαθαίνουν πώς να βελτιώνουν τις διαδικασίες λήψης αποφάσεων. Λειτουργικές δεξιότητες όπως το να ζητάς βοήθεια, να εκφράσεις ένα παράπονο ή να χειρίζεσαι την πίεση από τους συνομηλίκους είναι μερικές από τις δεξιότητες που αντιμετωπίζονται στα προγράμματα λογισμικού λειτουργικών δεξιοτήτων.