Η επιλογή της καλύτερης ελλειπτικής προπόνησης σημαίνει την επιλογή μιας προπόνησης που είναι προσαρμοσμένη στο επίπεδο φυσικής κατάστασης και στους στόχους φυσικής κατάστασης κάποιου. Πολλά ελλειπτικά μηχανήματα διαθέτουν μια σειρά από τυπικά προγράμματα προπόνησης που είναι προφορτωμένα στις μνήμες τους. Αυτού του είδους οι προπονήσεις περιλαμβάνουν συχνά προπόνηση δύναμης, απώλεια βάρους και cross country. Υπάρχει επίσης μια επιλογή χειροκίνητης διαχείρισης της προπόνησης αυξάνοντας ή μειώνοντας την αντίσταση και την κλίση.
Μια ελλειπτική προπόνηση ενδυνάμωσης είναι μια καλή επιλογή για κάποιον που θέλει να χτίσει μυς. Μερικοί ελλειπτικοί αναβάτες έχουν και τα δύο πεντάλ για τα πόδια καθώς και ράβδους που μπορούν να πιαστούν με τα χέρια, δίνοντας στο πάνω μέρος του σώματος μια προπόνηση. Μια ελλειπτική προπόνηση ενδυνάμωσης σε τέτοιου είδους μηχανές μπορεί να λειτουργήσει τόσο στο πάνω μέρος όσο και στο κάτω μέρος του σώματος. Για ελλειπτικές μηχανές που έχουν μόνο τα πεντάλ, μόνο το κάτω μέρος του σώματος θα ασκηθεί, αν και οι κοιλιακοί μύες μπορούν να ασκηθούν λίγο ενώ βοηθούν το υπόλοιπο σώμα να ισορροπήσει στο μηχάνημα.
Μια ελλειπτική προπόνηση απώλειας βάρους είναι μια προπόνηση που φέρνει τον καρδιακό ρυθμό σε ένα επίπεδο όπου το λίπος θα καεί. Αυτού του είδους οι προπονήσεις συνήθως περιλαμβάνουν διαστήματα όπου η κλίση και η ένταση αυξάνονται και μετά μειώνονται. Οι προπονήσεις ενδυνάμωσης είναι παρόμοιες, εκτός από το γεγονός ότι τα διαστήματα συνήθως περιλαμβάνουν μια πιο έντονη απότομη αύξηση στην προσπάθεια που απαιτείται για να συμβαδίσει με την αντίσταση και την κλίση.
Μια ελλειπτική προπόνηση cross country προσπαθεί να μιμηθεί την εμπειρία της άσκησης σε φυσικό έδαφος. Υπάρχει μια ελαφρώς ακανόνιστη μετατόπιση κάθε διάστημα στην αντίσταση καθώς και στην κλίση. Όπως η πεζοπορία σε ένα μονοπάτι, αυτό το είδος ελλειπτικής προπόνησης έχει διαστήματα που είναι σχετικά επίπεδα και εύκολα, καθώς και διαστήματα που είναι αρκετά απότομα και απαιτούν αρκετή προσπάθεια. Αυτό το είδος μετατόπισης σε διαστήματα μπορεί να βοηθήσει στην στόχευση πολλών μυϊκών ομάδων στα πόδια και τους γλουτούς.
Μια χειροκίνητη ελλειπτική προπόνηση είναι χρήσιμη για άτομα που επικεντρώνονται στην παρακολούθηση της απόστασης που διανύουν στην προπόνησή τους ή των θερμίδων που καίνε. Είναι επίσης χρήσιμο για άτομα που επικεντρώνονται στο να φτάσουν τον καρδιακό τους ρυθμό σε ένα συγκεκριμένο επίπεδο και να διατηρήσουν αυτόν τον καρδιακό ρυθμό κατά τη διάρκεια της προπόνησης. Μια χειρωνακτική προπόνηση προσφέρει τον μεγαλύτερο βαθμό ελέγχου, αλλά μπορεί να μην ωθήσει τον ασκούμενο να εργαστεί σκληρότερα με τον τρόπο που θα μπορούσε μια προ-προγραμματισμένη προπόνηση.