Τα μύδια μπορούν να μαγειρευτούν με πολλούς διαφορετικούς τρόπους, αλλά η πιο συνηθισμένη μέθοδος είναι το μαγείρεμα στον ατμό — είτε ως μεμονωμένη μέθοδος είτε για να τα προμαγειρέψετε πριν χρησιμοποιήσετε άλλη μέθοδο μαγειρέματος. Τα γυαλιστερά, μαύρα, οβάλ σχήματος δίθυρα μαλάκια ανοίγουν κατά τη διαδικασία του ατμού. Εκτός από τον ατμό, τα μύδια συχνά τηγανίζονται, ψήνονται στη σχάρα και ψήνονται.
Ανεξάρτητα από τη μέθοδο μαγειρέματος που θα χρησιμοποιήσετε, αγοράζετε πάντα μύδια από αξιόπιστη πηγή σε μη μολυσμένη περιοχή. Είναι ενδιαφέρον ότι όσοι έχουν περισσότερη σάρκα στη λευκή πλευρά είναι συνήθως θηλυκά και τα μαλάκια με σάρκα που τείνει να έχει περισσότερο πορτοκαλί χρώμα είναι συχνά αρσενικά. Και τα δύο είναι βασικά τα ίδια, γευστικά, με τον χυμό και των δύο να είναι το πιο γευστικό μέρος. Τα μύδια θα πρέπει να ξεπλένονται αρκετές φορές για να αφαιρέσετε την άμμο πριν τα βράσουν στον ατμό και να αφαιρέσετε την προεξοχή της «γένειας».
Μύδια στον ατμό μπορούν να παρασκευαστούν προσθέτοντας τα έτοιμα μαλάκια σε μερικά φλιτζάνια υγρού που έχουν βράσει στον ατμό σε μεγάλη κατσαρόλα ή ολλανδικό φούρνο. Αφού προστεθούν τα μύδια, πρέπει να βράσουν στον ατμό για περίπου οκτώ λεπτά σε μέτρια φωτιά. Εάν είναι δυνατόν, θα πρέπει να τα γυρίσετε προσεκτικά μετά από τέσσερα ή πέντε λεπτά μαγειρέματος. Τα μύδια δεν πρέπει ποτέ να παραψηθούν γιατί μπορεί να γίνουν σκληρά. Μόλις τα κοχύλια ανοίξουν στον ατμό, έχουν τελειώσει και δεν πρέπει να χρησιμοποιούνται όποια έχουν κλειστά κελύφη.
Τα μύδια μπορούν να επικαλυφθούν με ψίχα ψωμιού και να τηγανιστούν στο τηγάνι ή ακόμα και να τηγανιστούν. Μπορούν επίσης να ψηθούν στο φούρνο στο μισό κέλυφος και να ραντιστούν με ελαιόλαδο και μυρωδικά. Τα μύδια χρειάζονται μόνο πέντε λεπτά σε υπαίθρια σχάρα σε μέτρια προς δυνατή φωτιά. Είναι νόστιμα σε σούπες, αλλά είναι καλύτερο να προστεθούν κοντά στο τέλος του χρόνου μαγειρέματος για να αποφευχθεί το υπερβολικό ψήσιμο.
Αυτά τα μαλάκια μπορούν να αντικατασταθούν με μύδια σε πιάτα όπως το λιγκουίνι με σάλτσα αχιβάδας, και ορισμένες συνταγές απαιτούν και τα δύο. Οι σαλάτες σε μεξικάνικο στυλ χρησιμοποιούν μερικές φορές μύδια και προσθέτουν μια ξεχωριστή εμφάνιση στο ισπανικό πιάτο παέγια. Η κουζίνα της Νοτιοανατολικής Ασίας χρησιμοποιεί συχνά καρύδα και τζίντζερ σε πιάτα με μύδια. Το κλασικό γαλλικό πιάτο, moules mariniers, συνδυάζει βούτυρο, κρασί, κρεμμύδια, αλάτι, πιπέρι και μαϊντανό. Για την απορρόφηση του χυμού χρησιμοποιείται μια μπαγκέτα.
Πολλοί διαφορετικοί τύποι σάλτσες μπορούν να χρησιμοποιηθούν για να ντύσουν μαγειρεμένα μύδια. Ένα γαλλικό roux μπορεί να χρησιμεύσει ως βάση σάλτσας όπως και teriyaki ή σάλτσα ντομάτας. Η γενική οδηγία που χρησιμοποιείται συνήθως κατά την αγορά τους είναι να επιτρέπεται 1 λίβρα (450 g) στο κέλυφος ανά άτομο για ένα κύριο πιάτο και 0.5 λίβρες (225 g) ανά άτομο για ένα συνοδευτικό ή ορεκτικό.