Σε πολλές γυναίκες συνταγογραφούνται αντικαταθλιπτικά για τα συμπτώματα της εμμηνόπαυσης, κυρίως για τη θεραπεία των εξάψεων και της νυχτερινής εφίδρωσης. Η μείωση της δημοτικότητας της θεραπείας ορμονικής υποκατάστασης (HRT) λόγω των ανεπιθύμητων παρενεργειών έχει οδηγήσει στην ανάγκη εύρεσης θεραπείας υποκατάστασης για τα συμπτώματα της εμμηνόπαυσης. Ενώ οι μελέτες δείχνουν ότι τα αντικαταθλιπτικά μπορεί πράγματι να είναι αποτελεσματικά στη μείωση της σοβαρότητας των εξάψεων, οι παρενέργειες από τη λήψη του φαρμάκου μπορεί να οδηγήσουν σε άλλα προβλήματα.
Η λήψη αντικαταθλιπτικών για την εμμηνόπαυση και την κατάθλιψη είναι μια εγκεκριμένη θεραπεία, καθώς τα αντικαταθλιπτικά έχουν σχεδιαστεί για τη θεραπεία της μείζονος κατάθλιψης. Ωστόσο, η λήψη τους για άλλους λόγους, όπως εναλλαγές της διάθεσης, άγχος και εξάψεις, δεν είναι εγκεκριμένο θεραπευτικό σχήμα. Τα συμπτώματα της εμμηνόπαυσης μπορεί μερικές φορές να γίνουν τόσο σοβαρά που οι γυναίκες θα δοκιμάσουν οποιαδήποτε θεραπεία για να απαλύνουν τον πόνο τους. Οι επιστήμονες δεν είναι απολύτως βέβαιοι γιατί η συνταγογράφηση αντικαταθλιπτικών για την εμμηνόπαυση λειτουργεί, αλλά φαίνεται να είναι αποτελεσματική εάν η εμμηνόπαυση είναι ακόμα στα αρχικά στάδια. Φαίνεται ότι οι γυναίκες που παρουσιάζουν συμπτώματα εμμηνόπαυσης για ένα χρόνο ή περισσότερο συνεχίζουν να υποφέρουν από εξάψεις ακόμη και όταν λαμβάνουν αντικαταθλιπτικά.
Η μακροχρόνια χρήση αντικαταθλιπτικών συνδέεται με πολλές ανεπιθύμητες παρενέργειες που μπορεί να επιδεινώσουν τα συμπτώματα της εμμηνόπαυσης, συμπεριλαμβανομένου του άγχους, του διαταραγμένου ύπνου και της μειωμένης λίμπιντο. Η αντικατάσταση της έλλειψης ύπνου λόγω της νυχτερινής εφίδρωσης και των εξάψεων με την έλλειψη ύπνου λόγω της χρήσης αντικαταθλιπτικών είναι αυτοκαταστροφική. Η αύξηση βάρους, η ναυτία και ο έμετος είναι άλλες γνωστές παρενέργειες, εκτός από τον κίνδυνο εξάρτησης.
Οι τύποι αντικαταθλιπτικών που βρέθηκαν να είναι αποτελεσματικοί στη θεραπεία των συμπτωμάτων της εμμηνόπαυσης σε κλινικές δοκιμές είναι οι εκλεκτικοί αναστολείς επαναπρόσληψης σεροτονίνης (SSRIs) όπως το Prozac και το Paxil και οι αναστολείς επαναπρόσληψης σεροτονίνης νορεπινεφρίνης (SNRIs) όπως το Effexor. Μερικά από αυτά τα φάρμακα κυκλοφορούν στην αγορά στις ΗΠΑ για τη θεραπεία του προεμμηνορροϊκού συνδρόμου και της πιο σοβαρής μορφής του, της προεμμηνορροϊκής δυσφορικής διαταραχής. Το Pristiq είναι ένα SNRI που αναπτύσσεται ειδικά για τη θεραπεία της εμμηνόπαυσης.
Η σεροτονίνη είναι ένας νευροδιαβιβαστής, μια χημική ουσία που εμπλέκεται στη ρύθμιση της διάθεσης, της όρεξης, του ύπνου και της θερμοκρασίας του σώματος. Η μείωση των οιστρογόνων που σχετίζεται με την εμμηνόπαυση πιστεύεται ότι διαταράσσει τη λειτουργία της σεροτονίνης και αυτός είναι ο λόγος που το σώμα δεν είναι πλέον σε θέση να ελέγξει τη θερμοκρασία του σώματος. Τα αντικαταθλιπτικά αποκαθιστούν τεχνητά την ισορροπία, έτσι ώστε οι εξάψεις, οι νυχτερινές εφιδρώσεις και οι εναλλαγές της διάθεσης να γίνονται λιγότερο πρόβλημα. Περισσότεροι γιατροί συνταγογραφούν αντικαταθλιπτικά για την εμμηνόπαυση και η συναίνεση είναι ότι για σοβαρά συμπτώματα εμμηνόπαυσης που επηρεάζουν την ποιότητα ζωής, είναι μια αποτελεσματική θεραπεία. Για πιο ήπιες περιπτώσεις, ωστόσο, μπορεί να ενδείκνυνται λιγότερο δραστικές επιλογές.