Pentru fiecare tip de cultură pe care un fermier dorește să crească organic, fără ajutorul îngrășămintelor chimice sau pesticidelor, este prezentat un set diferit de dificultăți. Producerea unui randament profitabil de cartofi organici, de exemplu, este probabil să necesite mai mult timp și bani cheltuiți înainte de comercializare și un preț mai mare la standul de produse decât cei cultivați cu mijloace convenționale. Rambursarea este că legumele nu au toxine potențial dăunătoare pentru oameni și pământurile lor.
Centrul pentru Sisteme Agricole Integrate de la Universitatea din Wisconsin a descoperit în timpul unui studiu din 1990 asupra cartofilor organici că cei cultivați cu pesticide chimice, erbicide și îngrășăminte, precum și semințe modificate genetic, aveau randamente mai mari și costuri mai mici. Într-un an, fermele convenționale din studiu au produs aproximativ 32,800 de livre. (aproape 15,000 kg) pe acru de cartofi, în timp ce fermele ecologice au produs aproximativ 21,200 de lbs. (aproape 10,000 kg) pe acru. De asemenea, fermele ecologice de cartofi au fost puțin mai scumpe de exploatat, cu prețuri medii de 1,074 dolari SUA (USD) pe acru, spre deosebire de 928 USD (USD) pe acru pentru fermele convenționale. Pentru a concura, UW a remarcat că fermierii ecologici au trebuit să crească dramatic prețurile pentru a-și justifica munca.
Costul suplimentar și timpul asociat cu cultivarea cartofilor organici implică mai mulți factori. În loc să folosească îngrășăminte chimice sau erbicide pentru a potoli bolile cartofilor, fermierii trebuie să planteze pe câmpurile care au produs porumb sau lucernă cu un an înainte, pentru a preveni anumite boli. Fermierii trebuie să culeagă buruienile cu mâna sau să folosească remedii nechimice pentru uciderea buruienilor, mai degrabă decât buruienile care sufocă recoltele cu erbicide.
Poate cea mai mare amenințare pentru cartofii organici sunt numeroșii dăunători atrași de ei. În mod obișnuit, fermierii vor folosi insecticide potențial dăunătoare pentru a îndepărta insectele atrași cel mai mult de plante. Potrivit Departamentului de Entomologie al Universității din Kentucky, aceste bug-uri pot fi împărțite în două motive. Amenințările de deasupra solului sunt afidele mici, frunzele de cartofi și gândacii de cartofi. Sub pământ sunt larvele albe la fel de devastatoare și viermii de sârmă maro. Acestea sunt doar cele mai răspândite amenințări în acea parte a lumii.
Cartofii organici necesită îngrășăminte speciale, insecticide, gestionarea umidității și rotația culturilor pentru a produce un randament comercializabil. Acest lucru va însemna, de asemenea, mai mult timp petrecut pentru eradicarea dăunătorilor și a bolilor. Cu toate acestea, costul mai mare de pe piață se traduce într-un sol mai sănătos în care sunt cultivate plantele – și o hrană mai sănătoasă pe masă.