Η φλουορεσκεΐνη είναι μια φθορίζουσα χρωστική ουσία που χρησιμοποιείται σε πολλές διαφορετικές εφαρμογές στις επιστήμες και την ιατρική. Σε καθαρή κατάσταση, η φλουορεσκεΐνη είναι μια κόκκινη ή πορτοκαλί σκόνη που διαλύεται σε αλκαλικά διαλύματα για να σχηματιστεί ένα κίτρινο διάλυμα που θα ανάψει πράσινο. Εκτός από τη χρήση ευθείας φλουορεσκεΐνης, οι ερευνητές εργάζονται επίσης με διάφορα παράγωγα της ένωσης που έχουν σχεδιαστεί για να συζευχθούν με συγκεκριμένους τύπους μορίων και να εκτελούν άλλες λειτουργίες.
Στην ιατρική, αυτή η ένωση έχει ένα ευρύ φάσμα χρήσεων. Οι οφθαλμίατροι το χρησιμοποιούν σε οφθαλμικές εξετάσεις, βάφοντας το μάτι με τη βαφή για να αναζητήσουν σημάδια δακρύων στον κερατοειδή και μπορούν επίσης να το χρησιμοποιήσουν για αγγειογραφία με φλουορεσκεΐνη του αμφιβληστροειδούς, χρησιμοποιώντας τη βαφή για να αναζητήσουν διαρροές μέσα στα αιμοφόρα αγγεία του ματιού . Η χημική ουσία μπορεί επίσης να χρησιμοποιηθεί ως ιχνηθέτης σε άλλες περιοχές του σώματος και χρησιμοποιείται στη μικροσκοπία και ως λεκέ. Επιπλέον, παράγωγα φλουορεσκεΐνης χρησιμοποιούνται στο εργαστήριο για τον εντοπισμό ενώσεων σε υγρά δείγματα, με τη χημική ουσία να συνδέεται με συγκεκριμένες πρωτεΐνες για να λειτουργήσει ως σημαία.
Στην εργαστηριακή επιστήμη, η φλουορεσκεΐνη μπορεί να χρησιμοποιηθεί για την επισήμανση πρωτεϊνών και σε μια σειρά άλλων εργασιών. Έξω από το εργαστήριο, αυτή η βαφή χρησιμοποιήθηκε ιστορικά για τον εντοπισμό της ροής του ποταμού και των ροών των ρύπων, αν και έχει αντικατασταθεί σε ορισμένες περιοχές λόγω ανησυχιών για τις περιβαλλοντικές επιπτώσεις αυτών των πρακτικών. Αυτή η ένωση χρησιμοποιείται επίσης σε λέιζερ βαφής και σε ορισμένα άλλα επιστημονικά όργανα που πρέπει να μπορούν να φθορίζουν.
Οι ωκεανογράφοι και οι υδρολόγοι έχουν χρησιμοποιήσει ιστορικά τη φλουορεσκεΐνη για να εντοπίσουν τη ροή των ρευμάτων μέσα από υδάτινα σώματα ενδιαφέροντος. Σε αυτήν την περίπτωση, ένα φορτίο γνωστό ως «σημειακή πηγή» απελευθερώνεται σε μια καθορισμένη θέση και ακολουθείται καθώς κινείται μέσα στο νερό. Εκτός από την παροχή δεδομένων σχετικά με τη ροή ρεύματος, η κίνηση της φλουορεσκεΐνης μπορεί επίσης να χρησιμοποιηθεί για τον εντοπισμό μολυσματικών ουσιών, επισημαίνοντας τη ρύπανση με την ένωση και παρακολουθώντας για να δούμε πού πηγαίνει. Αυτές οι πληροφορίες μπορούν να χρησιμοποιηθούν σε προσπάθειες περιβαλλοντικού καθαρισμού.
Αρκετές χημικές εταιρείες κατασκευάζουν φλουορεσκεΐνη και παράγωγα αυτής της ένωσης, όπως η ισοθειοκυανική φλουορεσκεΐνη. Αυτές οι εταιρείες μπορούν να πουλήσουν το προϊόν συσκευασμένο ως σκόνη ή διάλυμα, σε διάφορα μεγέθη για να καλύψουν τις ανάγκες των χρηστών. Αυτή η ένωση είναι ένα από τα πιο ευρέως χρησιμοποιούμενα μόρια φθορισμού και πολυάριθμες φωτογραφίες που παρουσιάζουν αυτή τη χημική ένωση σε δράση μπορούν να βρεθούν σε επιστημονικούς ιστότοπους.