Στην ιατρική, η παθογένεια της νόσου είναι ένας όρος που χρησιμοποιείται για να αναφέρεται στην προέλευση και την ανάπτυξη μιας ασθένειας. Η μελέτη της παθογένεσης της νόσου, η οποία συνήθως αναφέρεται απλώς ως παθογένεση, αποτελεί έναν υποκλάδο των ευρύτερων πεδίων της παθοβιολογίας και της παθολογίας. Ενώ η παθοβιολογία και η παθολογία αναφέρονται στη γενική βιολογία, την ανάπτυξη και την πρόοδο μιας ασθένειας, η παθογένεση συνήθως επικεντρώνεται στους παράγοντες που οδηγούν στην αρχική προέλευση της νόσου.
Στην περίπτωση πολλών ασθενειών, πολλοί παράγοντες επηρεάζουν την παθογένεια της νόσου. Για παράδειγμα, ένα άτομο μπορεί να έχει γενετική προδιάθεση για μια ασθένεια, αλλά η ασθένεια μπορεί να μην εμφανιστεί στην πραγματικότητα εκτός εάν υπάρχουν και ορισμένοι περιβαλλοντικοί παράγοντες. Ομοίως, ορισμένα είδη μολυσματικών ασθενειών συχνά καταπολεμούνται από ένα μολυσμένο άτομο χωρίς να εμφανιστούν ποτέ συμπτώματα. Τέτοιες λοιμώξεις μπορεί να προκαλέσουν ασθένεια, για παράδειγμα, μόνο εάν υπάρχουν τα βακτήρια ή ο ιός που την προκαλεί, και ταυτόχρονα η ανοσία του μολυσμένου ατόμου εξασθενεί λόγω υποσιτισμού ή διαταραχής του ανοσοποιητικού συστήματος.
Υπάρχουν πολλοί διαφορετικοί τύποι παθογένειας ασθενειών. Αυτά περιλαμβάνουν εισβολή στο σώμα από ιούς ή βακτήρια, φλεγμονή ως απόκριση σε χημικές ουσίες, σωματικό τραύμα, παρουσία καρκινικών κυττάρων και πολλά διαφορετικά είδη γενετικών διαταραχών. Καθώς υπάρχουν τόσες πολλές πιθανές προελεύσεις της νόσου, οι γιατροί και οι ερευνητές που μελετούν την παθογένεια της νόσου συχνά ειδικεύονται σε ένα συγκεκριμένο πεδίο παθογένεσης.
Ορισμένα εξειδικευμένα πεδία παθογένειας περιλαμβάνουν την αιμοπαθολογία, την κλινική μικροβιολογία, τη γενετική και την ανοσοπαθολογία. Η αιματοπαθολογία σχετίζεται με ανωμαλίες του αίματος, του μυελού των οστών και του λεμφικού συστήματος και πώς αυτές οι ανωμαλίες μπορεί να οδηγήσουν σε ασθένεια. Στην κλινική μικροβιολογία, η μελέτη της παθογένεσης περιλαμβάνει την εξέταση του τρόπου με τον οποίο τα βακτήρια και οι ιοί εξαπλώνονται και πολλαπλασιάζονται. Η γενετική έχει πολύ σημαντικό ρόλο στην παθογένεση, καθώς ένας μεγάλος αριθμός ασθενειών προέρχεται εν μέρει ή εξ ολοκλήρου ως αποτέλεσμα ενός συγκεκριμένου γονιδίου, μιας μετάλλαξης ή μιας ανωμαλίας στο γενετικό υλικό του ασθενούς. Η ανοσοπαθολογία έχει ιδιαίτερη σημασία στην παθογένεση της νόσου των μολυσματικών ασθενειών, καθώς σχετίζεται με το ανοσοποιητικό σύστημα, συμπεριλαμβανομένου του τρόπου με τον οποίο οι αδυναμίες του ανοσοποιητικού μπορούν να επιτρέψουν σε έναν ιό ή ένα βακτήριο να επικρατήσει και να προκαλέσει ασθένεια.
Ενώ ορισμένοι γιατροί ειδικεύονται σε ένα από τα παραπάνω πεδία παθογένειας, άλλοι γιατροί και ερευνητές μπορεί να εργάζονται σε πολλούς τομείς. Αυτό συμβαίνει συχνά με άτομα που μελετούν την παθογένεση καθώς σχετίζεται με μια συγκεκριμένη ασθένεια. Στην περίπτωση ορισμένων μορφών καρκίνου, η κατανόηση της πλήρους παθογένεσης της νόσου μπορεί να περιλαμβάνει γενετικούς, μολυσματικούς, χημικούς και ανοσολογικούς παράγοντες.