Η θεραπεία με καρδιακά βλαστοκύτταρα χρησιμοποιείται για την αντικατάσταση και την επιδιόρθωση κατεστραμμένων κυττάρων στα αιμοφόρα αγγεία και στα τοιχώματα των θαλάμων και των αιμοφόρων αγγείων της καρδιάς. Οι θεραπείες που χρησιμοποιούν τον καρδιακό ιστό του ίδιου του ασθενούς που διεγείρεται για τη δημιουργία βλαστοκυττάρων βρίσκονται σε στάδια δοκιμών και ιατρικής μελέτης από το 2011. Ένας από τους κύριους ιατρικούς τομείς που χρησιμοποιούν τη θεραπεία καρδιακών βλαστοκυττάρων είναι η αποκατάσταση της βλάβης που προκαλείται στην ανθρώπινη καρδιά από καρδιακές προσβολές και εκφυλιστική καρδιοπάθεια.
Η διαδικασία για την ολοκλήρωση της θεραπείας με καρδιακά βλαστοκύτταρα ξεκινά με τη συλλογή μικρής ποσότητας ιστού από την καρδιά του ατόμου που έχει υποστεί καρδιακή προσβολή ή που έχει βλάβη στα καρδιακά του κύτταρα από καρδιακή νόσο. Μέσα σε ένα εργαστηριακό περιβάλλον, ο συλλεγμένος ιστός διαιρείται για να ληφθούν βλαστοκύτταρα, τα οποία διεγείρονται να πολλαπλασιαστούν σε πολλά εκατομμύρια βλαστοκύτταρα εντός δύο μηνών από την έναρξη της διαδικασίας. Τα αναπτυγμένα βλαστοκύτταρα στη συνέχεια επιστρέφονται στον ασθενή και εισάγονται στην κατεστραμμένη περιοχή της καρδιάς χρησιμοποιώντας ένα μπαλόνι καθετήρα για να αποκτήσουν πρόσβαση στους θαλάμους του οργάνου.
Ορισμένοι τύποι καρδιακών κυττάρων στοχεύονται στη θεραπεία με βλαστοκύτταρα που είναι γνωστό ότι ανταποκρίνονται καλά στην ανάπτυξη σε εργαστήριο. Τα καρδιομυοκύτταρα επισκευάζονται και αντικαθίστανται στη θεραπεία με καρδιακά βλαστοκύτταρα και είναι σημαντικά, καθώς αποτελούν τον μυ που κινεί το αίμα έξω από την κοιλία της καρδιάς. Η θεραπεία χρησιμοποιείται επίσης σε μια προσπάθεια επιδιόρθωσης των κυττάρων που αποτελούν την εσωτερική επένδυση και τα τοιχώματα των νέων αιμοφόρων αγγείων. Μετά τη βλάβη που προκαλείται στα κύτταρα από καρδιακές παθήσεις, τα βλαστοκύτταρα που προωθούν την ανάπτυξη νέων αιμοφόρων αγγείων είναι σημαντικά για την παροχή αίματος και οξυγόνου στην καρδιά.
Οι προσπάθειες εισαγωγής βλαστοκυττάρων σε μια κατεστραμμένη καρδιά από δότη ή ανθρώπινο έμβρυο έχουν αποδειχθεί αναποτελεσματικές στις περισσότερες περιπτώσεις από το 2011. Η χρήση ιστού για την ανάπτυξη των βλαστοκυττάρων που αργότερα επιστρέφονται στον αρχικό δότη έχει αποδειχθεί πιο αποτελεσματική στην επιστροφή των επαγόμενων πολυδύναμων βλαστοκύτταρα στο σώμα που επιδιορθώνουν τις κατεστραμμένες περιοχές της καρδιάς. Η διαδικασία θεραπείας με καρδιακά βλαστοκύτταρα πιστεύεται ότι είναι πιο αποτελεσματική από τη χρήση κυττάρων μυελού των οστών σε μια προσπάθεια επιδιόρθωσης των τοιχωμάτων των θαλάμων και των αιμοφόρων αγγείων της καρδιάς.
Η θεραπεία με καρδιακά βλαστοκύτταρα έγινε αμφιλεγόμενη μετά την τελειοποίηση της διαδικασίας αφαίρεσης βλαστοκυττάρων από ανθρώπινα έμβρυα. Η ικανότητα ανάπτυξης βλαστοκυττάρων από τον ιστό του τελικού αποδέκτη έχει εξαλείψει μεγάλο μέρος της διαμάχης από το 2011, καθώς αυτή η νέα εξέλιξη έχει αφαιρέσει τη χρήση ανθρώπινων βλαστικών κυττάρων εμβρύου από τη διαδικασία. Η ιατρική έρευνα στη θεραπεία με βλαστοκύτταρα παραμένει αμφιλεγόμενη με τους ακτιβιστές για τα δικαιώματα των ζώων, επειδή τα πειραματόζωα παθαίνουν καρδιακές προσβολές και καρδιακές παθήσεις που προκαλούνται σε αυτά για να αναπαράγουν καρδιακά προβλήματα στον άνθρωπο.