Ο ιππόκαμπος, που ονομάστηκε έτσι επειδή το σχήμα του μοιάζει αόριστα με αυτό ενός θαλάσσιου ίππου, είναι υπεύθυνο για την κωδικοποίηση μακροπρόθεσμων αναμνήσεων και βοηθά στην χωρική πλοήγηση. Είναι ένα από τα φυλογενετικά παλαιότερα μέρη του εγκεφάλου και το πρώτο μέρος που επιλέχθηκε να τεχνητά αναπαραχθεί ως εγκεφαλική πρόθεση. Ο ιππόκαμπος είναι γνωστό ότι σχετίζεται με την εμπέδωση επεισοδιακών αναμνήσεων, οι οποίες είναι αναμνήσεις από προσωπικά βιωμένα γεγονότα και τα συναφή συναισθήματά τους. Σε αντίθεση με τις σημασιολογικές μνήμες των αφηρημένων γεγονότων και των συσχετίσεών τους, οι επεισοδιακές αναμνήσεις μπορούν να αναπαρασταθούν ως ιστορίες. Η βλάβη στον ιππόκαμπο έχει ως αποτέλεσμα την αδυναμία σχηματισμού νέων μακροπρόθεσμων επεισοδιακών αναμνήσεων, αν και οι νέες διαδικαστικές μνήμες, όπως οι κινητικές ακολουθίες για καθημερινές εργασίες, μπορούν ακόμα να μάθουν.
Στη σχιζοφρένεια και ορισμένους τύπους σοβαρής κατάθλιψης, ο ιππόκαμπος συρρικνώνεται. Ο ιππόκαμπος είναι επίσης γνωστός ως ένα από τα πιο δομημένα και μελετημένα μέρη του εγκεφάλου, γι ‘αυτό και επιλέχθηκε για προσομοίωση προσθετικών. Αν και οι ακριβείς νευρωνικοί αλγόριθμοι δεν είναι γνωστοί, έχουν διαμορφωθεί στο σύνολό τους. Επειδή ο ιππόκαμπος είναι τόσο παλιός, έχει βελτιστοποιηθεί εκτενώς από την εξέλιξη και είναι βασικά ο ίδιος σε όλα τα είδη θηλαστικών. Αυτός είναι ο λόγος για τον οποίο ήταν δυνατό να σχεδιαστεί μια πρόθεση ιππόκαμπου μέσω της εξαντλητικής μελέτης ιππόκαμπων αρουραίων που αιωρούνται στο εγκεφαλονωτιαίο υγρό.
Για την πλοήγηση, ο ιππόκαμπος περιέχει “κελιά θέσης” τα οποία ενεργοποιούνται ανάλογα με την αντιληπτή θέση του ζώου. Μπορεί να γίνει ισχυρή η ύπαρξη αυτών των κυττάρων στον ιππόκαμπο επειδή πρέπει να χρησιμοποιηθούν μνήμες για τον προσδιορισμό της τρέχουσας θέσης από πιο θεμελιώδεις μεταβλητές όπως ο προσανατολισμός και η ταχύτητα. Η ενεργοποίηση αυτών των κυττάρων τόπου έχει παρατηρηθεί σε ανθρώπους που πλοηγούνται σε πόλεις εικονικής πραγματικότητας. Ένας άθικτος ιππόκαμπος απαιτείται για πολλές εργασίες χωρικής πλοήγησης. Ο ιππόκαμπος συνδέθηκε αρχικά, λανθασμένα, με την όσφρηση, η οποία στην πραγματικότητα επεξεργάζεται από τον οσφρητικό φλοιό.