Οι υποδοχείς Fc βρίσκονται σε κύτταρα του ανοσοποιητικού συστήματος γνωστά ως φαγοκύτταρα, τα οποία είναι σε θέση να καταναλώνουν επιβλαβείς ουσίες ή αντιγόνα. Κάθε υποδοχέας Fc είναι σε θέση να προσκολληθεί σε αυτό που ονομάζεται περιοχή Fc σε ένα αντίσωμα. Τα αντισώματα είναι ειδικές πρωτεΐνες που παράγονται από κύτταρα του ανοσοποιητικού, οι οποίες συνδέονται με αντιγόνα όπως μικροοργανισμούς, τοξίνες ή αλλεργικές ουσίες. Είναι σε θέση να τα εξουδετερώσουν ή να τα σημαδέψουν για καταστροφή από το ανοσοποιητικό σύστημα. Όταν ένας υποδοχέας Fc σε ένα ανοσοκύτταρο συνδέεται με ένα αντίσωμα και το συνδεδεμένο αντιγόνο του, αυτό μπορεί να προκαλέσει φαγοκυττάρωση, όπου καταναλώνεται το επικαλυμμένο με αντίσωμα αντιγόνο.
Υπάρχουν διαφορετικοί τύποι αντισωμάτων, το καθένα συγκεκριμένο για διαφορετικό αντιγόνο. Αυτό σημαίνει ότι υπάρχουν επίσης διαφορετικοί υποδοχείς Fc, ο καθένας ικανός να συνδεθεί με ένα αντίσωμα στην περιοχή του Fc. Τα αντισώματα είναι επίσης γνωστά ως ανοσοσφαιρίνες, Ig για συντομία και ο τύπος γνωστός ως IgG βρίσκεται συχνότερα στο αίμα.
Τα αντισώματα IgG είναι πρωτεϊνικές δομές σχήματος Υ που αποτελούνται από διαφορετικές περιοχές. Οι δύο βραχίονες του Υ είναι γνωστές ως περιοχές Fab, όπου το Fab σημαίνει θραύσμα, δεσμευτικό αντιγόνου. Το Fc είναι η περιοχή της ουράς, με το Fc για κλάσμα, κρυσταλλοποιήσιμο. Οι περιοχές Fab συνδέονται με αντιγόνα ενώ η περιοχή Fc συνδέεται με υποδοχείς Fc στην επιφάνεια ενός κυττάρου. Ένα μόριο που μοιάζει με υποδοχέα Fc έχει επίσης ανιχνευθεί σε ανοσοκύτταρα γνωστά ως λεμφοκύτταρα Β, αλλά η λειτουργία του δεν είναι πλήρως κατανοητή και δεν φαίνεται να συνδέεται με περιοχές Fc σε αντισώματα.
Τα φαγοκύτταρα, τα οποία τρώνε αποτελεσματικά επιβλαβή σωματίδια όπως τα μικρόβια, είναι μια ομάδα που αποτελείται από διαφορετικούς τύπους κυττάρων με υποδοχείς Fc που δεσμεύουν IgG στις επιφάνειές τους. Περιλαμβάνουν το ανοσοποιητικό σύστημα λευκά αιμοσφαίρια γνωστά ως μακροφάγα και ουδετερόφιλα. Τα κύτταρα του ανοσοποιητικού συστήματος γνωστά ως φυσικά κύτταρα δολοφόνων καλύπτονται επίσης από υποδοχείς Fc που συνδέονται με IgG. Τα φυσικά φονικά κύτταρα παράγουν παράγοντες που προκαλούν το θάνατο επιβλαβών κυττάρων όπως τα βακτήρια και προσελκύουν άλλα ανοσοκύτταρα για να τα καταστρέψουν. Ένας υποδοχέας Fc που συνδέεται με ένα διαφορετικό αντίσωμα, IgE, βρίσκεται στην επιφάνεια των μαστοκυττάρων, τα οποία ανταποκρίνονται σε αντιγόνα όπως η γύρη απελευθερώνοντας ουσίες που προκαλούν φλεγμονή.
Μερικές φορές συμβαίνει μια διαδικασία γνωστή ως ενίσχυση εξαρτώμενη από αντισώματα, όπου η παρουσία ενός υποδοχέα Fc βοηθά έναν ιό να εισέλθει σε ένα κύτταρο. Το κύτταρο δεν έχει κανέναν από τους υποδοχείς που χρειάζεται ο ιός για είσοδο, αλλά όταν ο ιός συνδέεται με ένα αντίσωμα είναι σε θέση να συνδεθεί με έναν υποδοχέα Fc μέσω της περιοχής Fc στο αντίσωμα. Αυτή η ενισχυμένη ικανότητα εισόδου στα κύτταρα οδηγεί σε αυξημένη μόλυνση.